MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Shi470 chromosome

Total Repeats: 290

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010698	TC	3	6	4968	4973	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010698	AC	3	6	6296	6301	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_010698	GA	5	10	7043	7052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010698	CA	3	6	16435	16440	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_010698	AG	3	6	25177	25182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010698	TA	3	6	26802	26807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010698	AG	3	6	38508	38513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010698	TA	3	6	57690	57695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010698	AG	3	6	58326	58331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010698	GT	3	6	58404	58409	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010698	AG	4	8	58811	58818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010698	CG	3	6	59702	59707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_010698	TA	4	8	69605	69612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010698	TC	3	6	71447	71452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_010698	AG	4	8	71520	71527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010698	AG	3	6	75984	75989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010698	AG	3	6	76011	76016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010698	GA	3	6	76044	76049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010698	AG	3	6	84208	84213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010698	AT	3	6	84254	84259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010698	CA	3	6	84443	84448	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_010698	TA	3	6	87527	87532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010698	GT	3	6	89598	89603	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010698	TG	4	8	94478	94485	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010698	CT	3	6	103209	103214	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010698	AC	5	10	106853	106862	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010698	TA	4	8	116045	116052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010698	AT	3	6	119871	119876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010698	AG	3	6	125450	125455	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010698	TA	3	6	125489	125494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010698	CT	3	6	126461	126466	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010698	GC	3	6	126762	126767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_010698	GA	3	6	131776	131781	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010698	AG	3	6	131818	131823	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010698	TG	3	6	153839	153844	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010698	TC	3	6	157247	157252	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_010698	AC	3	6	166662	166667	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_010698	AG	3	6	177781	177786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010698	CA	3	6	178215	178220	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_010698	TA	3	6	178517	178522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010698	TC	3	6	179056	179061	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_010698	CT	3	6	193165	193170	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_010698	CT	3	6	194827	194832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_010698	AG	3	6	195017	195022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010698	CT	3	6	195535	195540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_010698	AT	3	6	196214	196219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010698	GC	3	6	200894	200899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_010698	AT	3	6	203966	203971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010698	TG	3	6	215945	215950	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010698	GT	3	6	223628	223633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010698	TC	3	6	255704	255709	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_010698	AG	3	6	293169	293174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010698	AG	3	6	323699	323704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010698	CT	3	6	332401	332406	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_010698	AG	3	6	332432	332437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010698	CT	3	6	350550	350555	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_010698	AT	3	6	369698	369703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010698	AG	3	6	371382	371387	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010698	AG	3	6	372838	372843	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010698	AG	3	6	373012	373017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010698	TC	3	6	373707	373712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_010698	GA	4	8	381392	381399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010698	AT	3	6	419168	419173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010698	TA	3	6	431968	431973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010698	GC	3	6	432060	432065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_010698	AT	4	8	446636	446643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010698	AG	3	6	449937	449942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010698	GT	3	6	459874	459879	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010698	TA	3	6	461526	461531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010698	AG	3	6	507951	507956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010698	CT	4	8	517244	517251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_010698	AT	3	6	520184	520189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010698	TG	3	6	531445	531450	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010698	GA	3	6	531458	531463	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010698	GT	3	6	533271	533276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010698	AC	3	6	540780	540785	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_010698	GA	3	6	543113	543118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010698	GA	3	6	545780	545785	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010698	AT	3	6	559756	559761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010698	GC	3	6	559834	559839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_010698	CT	3	6	571475	571480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_010698	CT	3	6	571517	571522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_010698	CT	3	6	576661	576666	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_010698	TC	3	6	597088	597093	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_010698	CT	3	6	597121	597126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_010698	TA	3	6	600058	600063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010698	AT	3	6	606209	606214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010698	TA	3	6	606219	606224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010698	AG	3	6	606400	606405	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010698	GA	3	6	606605	606610	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010698	GA	3	6	606748	606753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010698	TG	3	6	617667	617672	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010698	AG	3	6	624043	624048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010698	CT	3	6	628081	628086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_010698	AT	8	16	645503	645518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010698	TA	3	6	653438	653443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010698	TC	3	6	661745	661750	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_010698	CT	3	6	670759	670764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_010698	TA	3	6	691218	691223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010698	TC	4	8	691331	691338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_010698	AG	3	6	694509	694514	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010698	CT	3	6	702267	702272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_010698	GA	9	18	705763	705780	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010698	GA	3	6	733044	733049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010698	TG	3	6	744506	744511	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010698	AT	3	6	761864	761869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010698	GA	3	6	763621	763626	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010698	TA	3	6	789661	789666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010698	GT	3	6	791531	791536	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010698	TA	3	6	792961	792966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010698	TG	3	6	797064	797069	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010698	TA	3	6	803825	803830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010698	TC	3	6	803930	803935	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_010698	TG	4	8	807944	807951	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010698	GT	4	8	807967	807974	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010698	AC	4	8	824455	824462	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_010698	AG	3	6	824496	824501	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010698	AC	3	6	825470	825475	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_010698	CA	3	6	825985	825990	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_010698	CT	3	6	826837	826842	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_010698	CT	3	6	826860	826865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_010698	TC	4	8	828435	828442	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_010698	AG	3	6	854111	854116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010698	CA	3	6	854554	854559	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_010698	TG	3	6	860282	860287	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010698	TC	5	10	860346	860355	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_010698	AG	3	6	868362	868367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010698	GA	5	10	874857	874866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010698	AT	4	8	874868	874875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010698	AT	4	8	874889	874896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010698	TA	3	6	891992	891997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010698	TC	4	8	896462	896469	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_010698	TC	3	6	896475	896480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_010698	TA	3	6	921223	921228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010698	TG	3	6	925369	925374	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010698	CT	3	6	928093	928098	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_010698	AT	3	6	928152	928157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010698	AT	3	6	931991	931996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010698	CA	3	6	938394	938399	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_010698	GC	3	6	950759	950764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_010698	GA	3	6	951240	951245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010698	AG	3	6	952292	952297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010698	AT	3	6	952696	952701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010698	GT	3	6	962136	962141	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010698	AC	3	6	962815	962820	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_010698	TG	3	6	962881	962886	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010698	AG	3	6	963070	963075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010698	CA	3	6	963625	963630	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_010698	AG	3	6	964450	964455	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010698	GC	3	6	965040	965045	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_010698	GC	3	6	966337	966342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_010698	AT	3	6	967039	967044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_010698	TG	3	6	967455	967460	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_010698	TA	3	6	981054	981059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.