MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Shi470 chromosome

Total Repeats: 1700

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010698	GGT	2	6	4086	4091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010698	TAT	2	6	4134	4139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010698	TGG	2	6	4178	4183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010698	TGG	2	6	4298	4303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010698	GTG	2	6	4414	4419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010698	ACC	2	6	4446	4451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_010698	GGT	2	6	4459	4464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010698	AAT	2	6	4621	4626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010698	ATT	2	6	4817	4822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010698	TGT	2	6	4901	4906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010698	ATT	2	6	5307	5312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010698	GTT	2	6	5609	5614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010698	TAA	2	6	5678	5683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010698	TTA	2	6	5736	5741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010698	GTG	2	6	5805	5810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010698	GTT	2	6	5825	5830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010698	TCT	2	6	5949	5954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010698	ATG	2	6	6025	6030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010698	AGT	2	6	6034	6039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010698	AGA	2	6	6155	6160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010698	CTT	2	6	6403	6408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010698	TAG	5	15	6430	6444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010698	TGT	2	6	6473	6478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010698	TTG	2	6	6539	6544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010698	GTT	2	6	6608	6613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010698	CCG	2	6	6742	6747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_010698	GCT	2	6	6857	6862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010698	AAT	2	6	7115	7120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010698	TGT	2	6	7187	7192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010698	TAA	3	9	9007	9015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010698	TAA	2	6	9488	9493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010698	ATT	2	6	9507	9512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010698	TTA	2	6	9533	9538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010698	ACA	2	6	9629	9634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010698	GAA	2	6	9647	9652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010698	ATA	2	6	13409	13414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010698	CTG	2	6	16456	16461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010698	TAT	2	6	20886	20891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010698	AAG	2	6	22757	22762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010698	CTT	2	6	24881	24886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010698	GTT	2	6	25089	25094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010698	TCA	2	6	29723	29728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010698	TAA	2	6	38488	38493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010698	TAA	2	6	46582	46587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010698	TAA	2	6	46590	46595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010698	TAA	3	9	55133	55141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010698	AGA	2	6	55854	55859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010698	CAA	2	6	55863	55868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010698	AGA	2	6	55875	55880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010698	TTG	2	6	57423	57428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010698	GAT	2	6	57438	57443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010698	CGC	2	6	57559	57564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_010698	AGA	2	6	57890	57895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010698	CAA	2	6	57936	57941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010698	TAT	2	6	58053	58058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010698	TAA	2	6	58127	58132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010698	AGA	2	6	58139	58144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010698	CTA	2	6	58261	58266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010698	CTA	2	6	58508	58513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010698	TTA	2	6	58539	58544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010698	CGA	2	6	58585	58590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010698	TGG	2	6	58609	58614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010698	GTG	2	6	58758	58763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010698	ACC	2	6	58833	58838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_010698	AGA	2	6	58964	58969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010698	TGA	2	6	58988	58993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010698	AAG	2	6	59236	59241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010698	TGG	2	6	59299	59304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010698	TGA	2	6	59335	59340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010698	CAA	2	6	59369	59374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010698	CAC	2	6	59436	59441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_010698	TGA	2	6	59506	59511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010698	AAC	2	6	59613	59618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010698	ACA	2	6	63159	63164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010698	TTG	2	6	63186	63191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010698	TTA	2	6	65860	65865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010698	ATT	3	9	65870	65878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010698	TAA	2	6	66013	66018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010698	TGG	2	6	66019	66024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010698	CTT	2	6	68297	68302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010698	ATG	2	6	68311	68316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010698	TAT	2	6	68322	68327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010698	CTT	2	6	68332	68337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010698	TTG	2	6	68353	68358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010698	ACC	2	6	69505	69510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_010698	ACT	2	6	69512	69517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010698	CTT	2	6	70141	70146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010698	AGT	2	6	70155	70160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010698	TCT	2	6	71425	71430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010698	TGT	2	6	71491	71496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010698	AAG	2	6	71544	71549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010698	GGT	2	6	73734	73739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010698	ATT	2	6	75946	75951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010698	ATT	2	6	75959	75964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010698	TTA	2	6	83884	83889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010698	GAA	2	6	84480	84485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010698	ATG	2	6	84595	84600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010698	GAT	2	6	84840	84845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010698	TGT	2	6	84863	84868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010698	AAG	2	6	85049	85054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010698	TTG	2	6	88527	88532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010698	CTT	2	6	91121	91126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010698	TGA	2	6	91191	91196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010698	GAT	2	6	91198	91203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010698	TCA	2	6	91293	91298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010698	ATA	2	6	94543	94548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010698	CTC	2	6	96120	96125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_010698	GTT	2	6	97933	97938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010698	CAA	2	6	97965	97970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010698	ATA	2	6	98017	98022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010698	ATA	2	6	99825	99830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010698	TCC	2	6	102507	102512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_010698	TTA	2	6	102585	102590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010698	ATG	2	6	102937	102942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010698	TAC	2	6	103050	103055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010698	AAG	2	6	103303	103308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010698	TGA	2	6	106624	106629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010698	TAA	2	6	106659	106664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010698	GAT	2	6	114707	114712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010698	GAT	2	6	114727	114732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010698	TTA	2	6	116033	116038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010698	GTA	2	6	116041	116046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010698	TAA	2	6	116192	116197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010698	ACC	2	6	117293	117298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_010698	GGT	2	6	120010	120015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010698	TAG	2	6	123411	123416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010698	TAA	2	6	124534	124539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010698	TGG	2	6	125243	125248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010698	TTG	2	6	125256	125261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010698	GAC	2	6	125392	125397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_010698	GGT	2	6	125418	125423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010698	AGA	2	6	125435	125440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010698	GAA	2	6	125461	125466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010698	TTG	2	6	125479	125484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010698	TAG	2	6	126397	126402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010698	ACC	2	6	126504	126509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_010698	ACC	2	6	126666	126671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_010698	ATG	2	6	126789	126794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010698	ATT	2	6	127048	127053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_010698	TAA	2	6	130020	130025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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