MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Shi470 chromosome

Total Repeats: 3861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010698	TTC	2	6	1431556	1431561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_010698	GA	3	6	1431684	1431689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_010698	CAA	2	6	1431700	1431705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_010698	CATC	2	8	1431710	1431717	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3505	NC_010698	CAG	2	6	1431795	1431800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_010698	ACCT	2	8	1431864	1431871	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3507	NC_010698	TAG	2	6	1431888	1431893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_010698	CTGA	2	8	1431935	1431942	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3509	NC_010698	GCT	2	6	1432011	1432016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_010698	TCT	2	6	1432060	1432065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_010698	TCC	2	6	1432100	1432105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3512	NC_010698	TGC	2	6	1432115	1432120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_010698	CTG	2	6	1432154	1432159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_010698	GT	3	6	1432195	1432200	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_010698	TTACC	2	10	1432248	1432257	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3516	NC_010698	ATC	2	6	1432328	1432333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_010698	CGC	2	6	1432454	1432459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3518	NC_010698	T	6	6	1432522	1432527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_010698	TAA	2	6	1432547	1432552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_010698	ATT	2	6	1432588	1432593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_010698	ACA	3	9	1432623	1432631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_010698	AGAA	2	8	1432636	1432643	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_010698	ATA	2	6	1432717	1432722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_010698	CAAT	2	8	1432723	1432730	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3525	NC_010698	AGC	2	6	1432913	1432918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_010698	A	7	7	1441625	1441631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_010698	AT	3	6	1441677	1441682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_010698	A	6	6	1441716	1441721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_010698	AT	3	6	1444109	1444114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_010698	A	6	6	1444187	1444192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_010698	GTT	2	6	1444193	1444198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_010698	AGAC	2	8	1444215	1444222	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3533	NC_010698	AAT	2	6	1444267	1444272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_010698	AAT	2	6	1444353	1444358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_010698	AG	3	6	1444399	1444404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_010698	GCAA	2	8	1444460	1444467	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3537	NC_010698	AC	3	6	1447006	1447011	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3538	NC_010698	T	8	8	1447045	1447052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_010698	TTAA	2	8	1447126	1447133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_010698	T	6	6	1447140	1447145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_010698	AACA	2	8	1447146	1447153	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3542	NC_010698	A	6	6	1447172	1447177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_010698	T	6	6	1447181	1447186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_010698	AAAG	2	8	1447192	1447199	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_010698	A	6	6	1447231	1447236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_010698	A	6	6	1447243	1447248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_010698	T	6	6	1447618	1447623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_010698	CCCCAA	2	12	1447629	1447640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3549	NC_010698	A	6	6	1452114	1452119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_010698	ATT	2	6	1452146	1452151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_010698	TGG	2	6	1452158	1452163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_010698	TAA	2	6	1452167	1452172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_010698	TAT	2	6	1452182	1452187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_010698	TTG	2	6	1453421	1453426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_010698	TCC	2	6	1454036	1454041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3556	NC_010698	AT	3	6	1457452	1457457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_010698	TC	3	6	1457458	1457463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3558	NC_010698	TGTT	2	8	1457495	1457502	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_010698	GATT	2	8	1457564	1457571	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_010698	TA	3	6	1460134	1460139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_010698	ATA	3	9	1460179	1460187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_010698	T	6	6	1460190	1460195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_010698	A	6	6	1460209	1460214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_010698	TCAA	2	8	1462910	1462917	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3565	NC_010698	AAC	2	6	1462966	1462971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_010698	GCT	2	6	1463031	1463036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_010698	GTTT	2	8	1463059	1463066	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_010698	ATGAA	2	10	1463092	1463101	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_010698	TGT	2	6	1463178	1463183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_010698	AAAT	2	8	1463213	1463220	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_010698	GTT	2	6	1463312	1463317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_010698	CGAA	2	8	1463348	1463355	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3573	NC_010698	T	7	7	1463362	1463368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_010698	TAA	2	6	1463393	1463398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_010698	TTG	2	6	1463413	1463418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_010698	GC	3	6	1463425	1463430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3577	NC_010698	ACA	2	6	1463507	1463512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_010698	CAAA	2	8	1463516	1463523	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3579	NC_010698	AACAA	2	10	1479990	1479999	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3580	NC_010698	T	6	6	1480998	1481003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_010698	ATAAA	2	10	1483908	1483917	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_010698	GTT	2	6	1485658	1485663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_010698	AG	3	6	1485710	1485715	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_010698	ATT	2	6	1485997	1486002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_010698	T	6	6	1488930	1488935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_010698	TTATT	2	10	1488951	1488960	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_010698	TAA	2	6	1491216	1491221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_010698	GCAAC	2	10	1491253	1491262	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3589	NC_010698	TGG	2	6	1491309	1491314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_010698	TCTA	2	8	1491328	1491335	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3591	NC_010698	T	6	6	1491403	1491408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_010698	AAC	2	6	1491502	1491507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_010698	A	6	6	1491554	1491559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_010698	ACG	2	6	1491576	1491581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_010698	ACA	2	6	1491591	1491596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_010698	A	6	6	1491648	1491653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_010698	AG	3	6	1491683	1491688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_010698	AGAAA	2	10	1491727	1491736	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_010698	ATG	2	6	1491826	1491831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_010698	ATT	2	6	1491846	1491851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_010698	ATTT	2	8	1491968	1491975	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_010698	AGA	2	6	1492034	1492039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_010698	A	7	7	1492046	1492052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_010698	ACC	2	6	1492114	1492119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3605	NC_010698	TATT	2	8	1492224	1492231	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_010698	ATCA	2	8	1492282	1492289	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3607	NC_010698	TGGT	2	8	1492610	1492617	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_010698	CGT	2	6	1492851	1492856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_010698	AGCGTC	2	12	1492896	1492907	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_010698	ATT	2	6	1492953	1492958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_010698	A	6	6	1492992	1492997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_010698	A	6	6	1493149	1493154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_010698	TAG	2	6	1493159	1493164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_010698	ACC	2	6	1493175	1493180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3615	NC_010698	T	7	7	1493181	1493187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_010698	TCA	2	6	1493211	1493216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_010698	GCTG	2	8	1493342	1493349	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3618	NC_010698	AAC	2	6	1493420	1493425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_010698	T	6	6	1493569	1493574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_010698	ACCA	2	8	1493629	1493636	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3621	NC_010698	ACC	2	6	1493768	1493773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3622	NC_010698	ATA	2	6	1493786	1493791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_010698	TAG	2	6	1493821	1493826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_010698	TGA	2	6	1496654	1496659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_010698	TTA	2	6	1499630	1499635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_010698	TTA	2	6	1499648	1499653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_010698	TAATA	2	10	1499654	1499663	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_010698	C	6	6	1499664	1499669	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3629	NC_010698	TTAG	2	8	1499683	1499690	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_010698	TGG	2	6	1499731	1499736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_010698	T	6	6	1503730	1503735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_010698	TAT	2	6	1503783	1503788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3633	NC_010698	AAT	2	6	1503796	1503801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.