MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Haemophilus somnus 2336 chromosome

Total Repeats: 6868

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_010519	ACA	2	6	200893	200898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_010519	TCA	2	6	200906	200911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_010519	GGC	2	6	200955	200960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_010519	T	7	7	201092	201098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_010519	ATT	2	6	201133	201138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_010519	ATTT	2	8	201180	201187	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_010519	TAA	2	6	201774	201779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_010519	ATTG	2	8	201787	201794	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
510	NC_010519	TAT	2	6	201795	201800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_010519	TAA	2	6	205345	205350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_010519	GT	3	6	205708	205713	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
513	NC_010519	TA	3	6	205763	205768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_010519	TA	3	6	205788	205793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_010519	A	6	6	205793	205798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_010519	TTTA	2	8	205849	205856	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_010519	TTG	2	6	209480	209485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_010519	AAT	2	6	209494	209499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_010519	AT	3	6	209859	209864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_010519	GTTGTA	2	12	210588	210599	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_010519	T	7	7	210738	210744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_010519	TTCTAT	2	12	210752	210763	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
523	NC_010519	TATAT	2	10	210765	210774	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_010519	GGA	2	6	210791	210796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_010519	TCC	2	6	210871	210876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_010519	T	6	6	210932	210937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_010519	TAA	2	6	210956	210961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_010519	A	7	7	212543	212549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_010519	TACT	2	8	212565	212572	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
530	NC_010519	T	6	6	212579	212584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_010519	GTAAAA	2	12	212597	212608	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
532	NC_010519	A	6	6	212605	212610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_010519	A	6	6	214645	214650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_010519	CAC	2	6	216735	216740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_010519	CTA	2	6	216748	216753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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537	NC_010519	GA	3	6	216781	216786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
538	NC_010519	A	6	6	216793	216798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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541	NC_010519	AAAC	2	8	216888	216895	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
542	NC_010519	AGG	2	6	216953	216958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_010519	TTA	2	6	216969	216974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_010519	CAT	2	6	217571	217576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_010519	CCTT	2	8	217611	217618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
546	NC_010519	TCA	3	9	217641	217649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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549	NC_010519	T	7	7	217681	217687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_010519	ATT	2	6	217755	217760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_010519	T	6	6	217759	217764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_010519	TGC	2	6	217817	217822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_010519	A	6	6	218539	218544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_010519	ATAAA	2	10	218554	218563	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_010519	TAA	2	6	218591	218596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_010519	A	7	7	218606	218612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_010519	ATGA	2	8	220317	220324	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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559	NC_010519	ACA	2	6	220346	220351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_010519	AT	4	8	220385	220392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_010519	ATT	2	6	220400	220405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_010519	T	8	8	220416	220423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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564	NC_010519	TTAAA	2	10	220546	220555	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_010519	TA	3	6	227488	227493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_010519	TAC	2	6	227527	227532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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569	NC_010519	T	6	6	229506	229511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_010519	G	7	7	229543	229549	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
571	NC_010519	CTT	2	6	229573	229578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_010519	CAG	3	9	229671	229679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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575	NC_010519	TGA	2	6	229806	229811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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605	NC_010519	T	6	6	240656	240661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_010519	T	6	6	240665	240670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_010519	T	7	7	240695	240701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_010519	T	6	6	240782	240787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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613	NC_010519	ATG	2	6	243700	243705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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615	NC_010519	TTA	2	6	245590	245595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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618	NC_010519	CTTTT	3	15	247649	247663	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
619	NC_010519	T	7	7	247660	247666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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623	NC_010519	AGTTA	2	10	256295	256304	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
624	NC_010519	T	6	6	256338	256343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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629	NC_010519	TGAA	2	8	258039	258046	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
630	NC_010519	ATA	2	6	258071	258076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_010519	T	7	7	258128	258134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_010519	T	6	6	258193	258198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_010519	ATT	2	6	258210	258215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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636	NC_010519	TTG	2	6	258328	258333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_010519	T	7	7	258428	258434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_010519	CAA	2	6	259027	259032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_010519	TAA	2	6	259036	259041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_010519	ATG	2	6	259046	259051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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