MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS2

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010369	TC	3	6	1621	1626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010369	GA	3	6	1639	1644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010369	AC	3	6	8186	8191	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_010369	TA	3	6	11856	11861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010369	TC	3	6	11903	11908	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_010369	CA	3	6	12194	12199	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_010369	GT	3	6	13838	13843	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010369	TA	5	10	14859	14868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010369	AC	3	6	18206	18211	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010369	CG	3	6	18440	18445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010369	GA	4	8	20761	20768	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010369	GA	3	6	24526	24531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010369	CA	3	6	24578	24583	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_010369	CG	3	6	27055	27060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_010369	TA	3	6	27720	27725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010369	TC	3	6	29466	29471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_010369	CG	3	6	33185	33190	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010369	CG	3	6	38262	38267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010369	AT	3	6	39113	39118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010369	GC	3	6	40111	40116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_010369	GC	4	8	45309	45316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_010369	CA	3	6	45377	45382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_010369	CA	3	6	46896	46901	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_010369	AG	3	6	48580	48585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010369	GC	3	6	49938	49943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010369	AG	3	6	51756	51761	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010369	CG	3	6	53607	53612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010369	GT	3	6	56521	56526	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010369	GT	3	6	56555	56560	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010369	GT	3	6	57652	57657	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010369	AT	3	6	59338	59343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010369	CA	3	6	59780	59785	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_010369	TC	3	6	62205	62210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_010369	GT	4	8	63363	63370	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010369	CA	3	6	63471	63476	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_010369	TC	3	6	67200	67205	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_010369	GA	3	6	67298	67303	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010369	TC	3	6	68395	68400	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_010369	GC	3	6	69569	69574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_010369	GC	3	6	69619	69624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_010369	CG	3	6	69649	69654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_010369	GC	3	6	72076	72081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_010369	TC	3	6	72126	72131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_010369	TG	3	6	73842	73847	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010369	GA	3	6	74447	74452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010369	AC	3	6	77020	77025	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_010369	TC	3	6	77392	77397	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_010369	AC	3	6	78382	78387	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010369	TC	3	6	78724	78729	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_010369	CA	3	6	80311	80316	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010369	GA	3	6	80457	80462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010369	CT	3	6	82670	82675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_010369	CA	3	6	83026	83031	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_010369	TA	3	6	83441	83446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010369	CT	3	6	86298	86303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_010369	TG	3	6	88292	88297	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010369	AT	3	6	88331	88336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010369	AT	3	6	88368	88373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010369	AT	3	6	91865	91870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010369	CT	3	6	102780	102785	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_010369	TG	3	6	104735	104740	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010369	TA	3	6	107923	107928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010369	CT	4	8	109078	109085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_010369	GT	3	6	110412	110417	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010369	TC	3	6	113575	113580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_010369	AT	3	6	113662	113667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010369	AG	3	6	117603	117608	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010369	AG	3	6	118960	118965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010369	TC	3	6	121365	121370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_010369	GA	3	6	122231	122236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010369	GA	3	6	122606	122611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010369	TC	3	6	122805	122810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_010369	TG	3	6	124191	124196	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010369	CA	3	6	127840	127845	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_010369	GA	3	6	128137	128142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010369	GA	3	6	130159	130164	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010369	GA	3	6	131217	131222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010369	CT	3	6	134584	134589	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_010369	AG	3	6	136564	136569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010369	AT	3	6	136657	136662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010369	CA	4	8	136984	136991	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_010369	GT	3	6	144298	144303	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010369	TG	3	6	147514	147519	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010369	AG	3	6	149372	149377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010369	TC	3	6	150809	150814	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_010369	GT	3	6	151969	151974	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010369	CA	3	6	152788	152793	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_010369	AC	3	6	154534	154539	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_010369	GT	3	6	156091	156096	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010369	AC	3	6	156881	156886	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_010369	AG	3	6	157695	157700	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010369	AC	3	6	157863	157868	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_010369	TC	3	6	157954	157959	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_010369	CA	3	6	160991	160996	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_010369	AC	3	6	161234	161239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_010369	AG	3	6	163949	163954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010369	GT	3	6	165325	165330	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010369	TA	3	6	184891	184896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010369	CT	3	6	191510	191515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.