MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS2

Total Repeats: 1066

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010369	GCCA	2	8	189799	189806	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1002	NC_010369	ACCG	2	8	189817	189824	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_010369	CAC	2	6	189853	189858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1004	NC_010369	TGA	2	6	189861	189866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_010369	GGC	2	6	189912	189917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_010369	GAT	2	6	189935	189940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_010369	CCAG	2	8	189947	189954	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_010369	AGG	2	6	189985	189990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_010369	GTG	2	6	189995	190000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_010369	CTG	2	6	190107	190112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_010369	GCG	2	6	190190	190195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_010369	TGA	2	6	190226	190231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_010369	CGC	2	6	190232	190237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_010369	CAC	2	6	190316	190321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_010369	GAC	2	6	190328	190333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_010369	GAC	2	6	190338	190343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_010369	ACGG	2	8	190371	190378	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1018	NC_010369	TGG	2	6	190385	190390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_010369	GCT	2	6	190401	190406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_010369	CGT	2	6	190436	190441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_010369	GAA	2	6	190451	190456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_010369	ACC	2	6	190507	190512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_010369	GAC	2	6	190530	190535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_010369	TCGC	2	8	190542	190549	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_010369	CAC	2	6	190550	190555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_010369	CGC	2	6	190606	190611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_010369	AAG	2	6	190701	190706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_010369	CCA	2	6	190717	190722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_010369	GAACG	2	10	190745	190754	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1030	NC_010369	CGA	2	6	190820	190825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_010369	GCG	2	6	190856	190861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_010369	CAAT	2	8	190908	190915	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_010369	AGA	2	6	190924	190929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_010369	TGC	2	6	190947	190952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_010369	TCG	2	6	190971	190976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_010369	TGAC	2	8	191022	191029	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1037	NC_010369	CGT	2	6	191049	191054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_010369	GAA	2	6	191108	191113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_010369	CGG	2	6	191156	191161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_010369	CACC	2	8	191179	191186	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1041	NC_010369	CGC	2	6	191254	191259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_010369	CT	3	6	191510	191515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_010369	TGG	2	6	191573	191578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_010369	TGG	2	6	191614	191619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_010369	GAT	2	6	191624	191629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_010369	ACGT	2	8	191639	191646	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1047	NC_010369	ATA	2	6	191725	191730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_010369	CTT	2	6	192036	192041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_010369	TCT	2	6	192106	192111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_010369	ACGT	2	8	192170	192177	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1051	NC_010369	ACG	2	6	192212	192217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_010369	CGA	2	6	192368	192373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_010369	GTC	2	6	192381	192386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_010369	GTC	2	6	192399	192404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_010369	GTA	2	6	192405	192410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_010369	GTG	2	6	192438	192443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_010369	TGG	2	6	192487	192492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_010369	GTC	2	6	194226	194231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_010369	GAC	2	6	194246	194251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_010369	ACT	2	6	194333	194338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_010369	ATT	2	6	194351	194356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_010369	TCAG	2	8	194424	194431	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1063	NC_010369	GCG	2	6	194448	194453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_010369	AGA	2	6	194908	194913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_010369	TCG	2	6	194919	194924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_010369	ATA	2	6	194948	194953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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