MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS3

Total Repeats: 869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010368	TAG	2	6	8050	8055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010368	CCG	2	6	8076	8081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_010368	TCG	2	6	8104	8109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010368	GCC	2	6	8179	8184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_010368	GTC	2	6	8185	8190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010368	GCG	2	6	8221	8226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010368	CCG	2	6	8230	8235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_010368	CCG	2	6	8260	8265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_010368	ACT	2	6	8367	8372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010368	GGC	2	6	8449	8454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010368	GAG	2	6	8482	8487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010368	CCT	2	6	8510	8515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_010368	GGC	2	6	9821	9826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010368	GTC	2	6	9891	9896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010368	GAC	2	6	11282	11287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010368	AAG	2	6	13989	13994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010368	AGA	2	6	14100	14105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010368	TGT	2	6	15584	15589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010368	CTG	2	6	15601	15606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010368	CTA	2	6	15652	15657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010368	GTC	2	6	15756	15761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010368	CGA	2	6	17170	17175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010368	CGT	2	6	17327	17332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010368	GGA	2	6	17437	17442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010368	GAG	2	6	17663	17668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010368	CGA	2	6	17689	17694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010368	TGG	2	6	17713	17718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010368	AAG	2	6	17838	17843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010368	CCG	2	6	17858	17863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_010368	GAG	2	6	17888	17893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010368	GGC	2	6	17901	17906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010368	GCT	2	6	17924	17929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010368	ACG	2	6	18070	18075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010368	GTC	2	6	18082	18087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010368	CCA	2	6	18173	18178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_010368	GTC	2	6	18305	18310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010368	GGC	2	6	18356	18361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010368	GCC	2	6	18367	18372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_010368	TCT	2	6	19719	19724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010368	ATA	2	6	20315	20320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010368	ATT	2	6	20324	20329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010368	ATT	2	6	20726	20731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010368	TTG	2	6	20757	20762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010368	GCT	2	6	21068	21073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010368	GAA	2	6	21109	21114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010368	ACT	2	6	21237	21242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010368	CGT	2	6	21324	21329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010368	ATG	2	6	21491	21496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010368	TAT	2	6	22461	22466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010368	TGA	2	6	22509	22514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010368	TCC	2	6	22584	22589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_010368	AGT	2	6	22606	22611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010368	TCG	2	6	22633	22638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010368	ACT	2	6	22644	22649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010368	ACG	2	6	22741	22746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010368	ACC	2	6	22916	22921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_010368	TCG	2	6	22955	22960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010368	CCG	2	6	23011	23016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_010368	TCG	2	6	23143	23148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010368	GTC	2	6	23271	23276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010368	GAC	2	6	23277	23282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010368	CGT	2	6	23326	23331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010368	GAA	2	6	23339	23344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010368	GCT	2	6	23363	23368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010368	TTG	2	6	23406	23411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010368	CCT	2	6	23452	23457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_010368	TCA	2	6	23473	23478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010368	GTC	2	6	23486	23491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010368	TCA	2	6	23494	23499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010368	TCG	2	6	23508	23513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010368	GAT	3	9	23516	23524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010368	GTA	2	6	23567	23572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010368	GAG	2	6	23646	23651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010368	ATC	2	6	23790	23795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010368	TCG	2	6	23955	23960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010368	CGT	2	6	24208	24213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010368	TAC	2	6	24401	24406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010368	TAC	2	6	24477	24482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010368	CGT	2	6	24505	24510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010368	ACG	2	6	24517	24522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010368	TCC	2	6	24540	24545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_010368	TTG	2	6	24924	24929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010368	CTG	2	6	24951	24956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010368	GCT	2	6	24963	24968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010368	CGA	2	6	24972	24977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010368	GCC	2	6	24983	24988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_010368	TCT	2	6	25002	25007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010368	GGC	2	6	25053	25058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_010368	TGC	2	6	25091	25096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010368	GTC	2	6	25219	25224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010368	ACC	2	6	25920	25925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_010368	CAC	2	6	25964	25969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_010368	CGA	2	6	25990	25995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010368	GCT	2	6	26000	26005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_010368	CCG	2	6	26031	26036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_010368	CGG	2	6	26052	26057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010368	GAG	2	6	26765	26770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010368	GTT	2	6	26820	26825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010368	CAG	2	6	26826	26831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010368	GAG	2	6	26874	26879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010368	CGA	2	6	26975	26980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010368	TAG	2	6	26984	26989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010368	CAA	2	6	27010	27015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_010368	CAG	2	6	27710	27715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_010368	CGA	2	6	29727	29732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010368	ACA	2	6	29746	29751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010368	ACC	2	6	30637	30642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_010368	TGT	2	6	30661	30666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010368	ATC	2	6	30707	30712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010368	GCC	2	6	36199	36204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_010368	CAA	3	9	36282	36290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_010368	ACG	2	6	36336	36341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010368	TGC	2	6	36346	36351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010368	AAG	2	6	36436	36441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010368	ACC	2	6	36459	36464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_010368	TTC	2	6	36543	36548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_010368	TTC	2	6	37082	37087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_010368	GAC	2	6	37318	37323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_010368	CAC	2	6	37676	37681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_010368	TGC	2	6	39338	39343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010368	TCG	2	6	39406	39411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_010368	AGC	2	6	39588	39593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010368	TTC	2	6	39632	39637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_010368	TGT	2	6	42049	42054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010368	GCT	2	6	42079	42084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_010368	CGG	2	6	42171	42176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_010368	CGA	2	6	42233	42238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_010368	CGA	2	6	42270	42275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_010368	CCG	2	6	42366	42371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_010368	TCG	2	6	42498	42503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_010368	GGC	2	6	42559	42564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_010368	ACG	2	6	43121	43126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_010368	GAA	2	6	43150	43155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010368	TAT	2	6	43240	43245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010368	CTG	2	6	43349	43354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_010368	CTT	2	6	43362	43367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_010368	GTG	2	6	43384	43389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010368	TCT	2	6	43451	43456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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