MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS4

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010367	TATC	2	8	2	9	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010367	TAAA	2	8	787	794	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010367	TGAC	2	8	818	825	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_010367	TCGC	2	8	2190	2197	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_010367	GTCA	2	8	12832	12839	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010367	AAAC	2	8	22548	22555	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_010367	TCTG	2	8	23143	23150	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_010367	GACG	2	8	23900	23907	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_010367	ACTC	2	8	23970	23977	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010367	CTGG	2	8	25227	25234	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_010367	GTTC	2	8	28904	28911	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_010367	GTCG	2	8	29239	29246	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_010367	CCCT	2	8	29309	29316	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_010367	TTAG	2	8	30929	30936	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010367	GGAA	2	8	30981	30988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010367	ATAG	2	8	32490	32497	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010367	ACCG	2	8	33813	33820	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010367	CGTG	2	8	33858	33865	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_010367	TCGC	2	8	33993	34000	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010367	ACAG	2	8	36702	36709	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_010367	CACG	2	8	37658	37665	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_010367	GTCC	2	8	38051	38058	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_010367	TGGC	2	8	38094	38101	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_010367	GTTT	2	8	40837	40844	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.