MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS1

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010366	TC	3	6	1278	1283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010366	GT	3	6	1680	1685	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010366	AT	3	6	1760	1765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010366	GA	3	6	1898	1903	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010366	CG	3	6	3732	3737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_010366	AG	3	6	5075	5080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010366	AC	3	6	5324	5329	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_010366	CT	3	6	5373	5378	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010366	AC	3	6	9121	9126	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010366	CA	4	8	14075	14082	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010366	TC	3	6	22288	22293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_010366	AC	3	6	24185	24190	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_010366	GC	3	6	31908	31913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_010366	AT	3	6	35408	35413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010366	TG	3	6	36986	36991	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010366	TG	3	6	38853	38858	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010366	AT	3	6	38892	38897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010366	AT	3	6	38929	38934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010366	AT	3	6	42426	42431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010366	CT	3	6	53341	53346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_010366	TG	3	6	55296	55301	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010366	TA	3	6	58484	58489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010366	CT	4	8	59639	59646	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_010366	GT	3	6	60973	60978	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010366	TC	3	6	64136	64141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010366	AT	3	6	64223	64228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010366	AG	3	6	68164	68169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010366	AG	3	6	69521	69526	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010366	TC	3	6	71926	71931	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_010366	GA	3	6	72792	72797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010366	GA	3	6	73167	73172	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010366	TC	3	6	73366	73371	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_010366	TG	3	6	74752	74757	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010366	CA	3	6	78401	78406	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010366	GA	3	6	78698	78703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010366	GA	3	6	80720	80725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010366	GA	3	6	81778	81783	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010366	CT	3	6	85145	85150	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_010366	AG	3	6	87125	87130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010366	AT	3	6	87218	87223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010366	CA	4	8	87545	87552	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_010366	GT	3	6	94859	94864	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010366	TG	3	6	98075	98080	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010366	AG	3	6	98971	98976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010366	AT	3	6	99077	99082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010366	GA	3	6	99216	99221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010366	CG	3	6	101050	101055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_010366	CT	3	6	111693	111698	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010366	GA	3	6	112420	112425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010366	CA	3	6	124651	124656	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010366	AG	3	6	126281	126286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010366	AT	3	6	127026	127031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010366	AT	3	6	127568	127573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010366	GA	3	6	127577	127582	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010366	TG	3	6	127668	127673	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010366	CT	3	6	127742	127747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_010366	GT	3	6	128717	128722	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010366	GT	3	6	128740	128745	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010366	CT	3	6	128976	128981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_010366	CA	3	6	129056	129061	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_010366	TC	3	6	137342	137347	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_010366	AC	3	6	137377	137382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_010366	AT	3	6	137525	137530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010366	CT	3	6	140441	140446	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_010366	CT	3	6	147588	147593	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.