MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS1

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010366	GTTAC	2	10	59	68	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_010366	TATAA	2	10	5338	5347	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010366	AGTAA	2	10	8723	8732	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010366	CGCTG	2	10	9064	9073	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_010366	AAATG	2	10	9076	9085	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010366	TCGCC	2	10	16364	16373	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_010366	AACAG	2	10	23790	23799	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_010366	AACAG	2	10	34773	34782	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_010366	GTCCG	2	10	35729	35738	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_010366	GAAGA	2	10	40697	40706	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010366	AAACC	2	10	58400	58409	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_010366	GAAGA	2	10	73611	73620	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010366	TCGGT	2	10	74601	74610	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_010366	TTTCC	2	10	74649	74658	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_010366	ACGCC	2	10	74892	74901	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_010366	CGAAT	2	10	82730	82739	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_010366	CTCCG	2	10	88961	88970	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
18	NC_010366	TGTCG	2	10	92987	92996	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_010366	CGACT	2	10	93120	93129	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_010366	TCAGG	2	10	104615	104624	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_010366	GTGAG	2	10	111773	111782	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010366	GGGGT	2	10	126870	126879	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010366	CGACG	2	10	137512	137521	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_010366	GAAGA	2	10	147017	147026	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.