MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Halobacterium salinarum R1

Total Repeats: 162

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010364	G	6	6	18014	18019	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010364	C	6	6	24660	24665	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3	NC_010364	T	6	6	31403	31408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010364	C	6	6	34027	34032	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5	NC_010364	C	6	6	34240	34245	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6	NC_010364	C	6	6	50162	50167	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7	NC_010364	C	6	6	51323	51328	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8	NC_010364	A	6	6	80636	80641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010364	A	6	6	84831	84836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010364	A	6	6	97756	97761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010364	A	6	6	120377	120382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010364	T	7	7	120685	120691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010364	T	6	6	125137	125142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010364	C	6	6	160615	160620	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15	NC_010364	C	6	6	167524	167529	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16	NC_010364	C	6	6	173674	173679	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17	NC_010364	C	6	6	223136	223141	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18	NC_010364	C	6	6	238126	238131	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19	NC_010364	C	6	6	255430	255435	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
20	NC_010364	T	7	7	269820	269826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010364	C	6	6	273876	273881	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
22	NC_010364	T	6	6	282777	282782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010364	A	6	6	286438	286443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010364	C	6	6	296624	296629	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25	NC_010364	C	6	6	296640	296645	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26	NC_010364	T	6	6	316265	316270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010364	A	6	6	326057	326062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010364	C	6	6	338211	338216	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_010364	G	6	6	364824	364829	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010364	A	6	6	368501	368506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010364	C	6	6	380584	380589	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
32	NC_010364	C	6	6	392334	392339	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
33	NC_010364	C	6	6	395963	395968	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
34	NC_010364	G	6	6	401036	401041	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010364	G	6	6	401086	401091	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010364	A	6	6	437148	437153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010364	T	6	6	447327	447332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010364	C	7	7	455165	455171	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
39	NC_010364	C	6	6	455597	455602	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40	NC_010364	A	6	6	457552	457557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010364	C	6	6	458630	458635	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42	NC_010364	G	6	6	497795	497800	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010364	C	6	6	522935	522940	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
44	NC_010364	C	6	6	527819	527824	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
45	NC_010364	G	6	6	532364	532369	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010364	C	6	6	570513	570518	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47	NC_010364	A	6	6	571696	571701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010364	A	6	6	582580	582585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010364	C	6	6	585535	585540	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50	NC_010364	C	6	6	608130	608135	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
51	NC_010364	C	6	6	608196	608201	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
52	NC_010364	C	6	6	629643	629648	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53	NC_010364	G	6	6	635752	635757	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010364	G	6	6	648816	648821	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010364	T	6	6	663335	663340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010364	G	7	7	696284	696290	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010364	T	6	6	710564	710569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010364	T	9	9	746790	746798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010364	G	6	6	751290	751295	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010364	A	6	6	765340	765345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010364	G	6	6	767510	767515	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010364	A	6	6	779189	779194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010364	G	6	6	790104	790109	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010364	G	6	6	812803	812808	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010364	A	6	6	837000	837005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010364	T	6	6	841708	841713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010364	A	6	6	847594	847599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010364	C	6	6	854448	854453	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
69	NC_010364	C	6	6	873491	873496	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
70	NC_010364	A	6	6	874825	874830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010364	C	6	6	906543	906548	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
72	NC_010364	G	6	6	912367	912372	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010364	C	6	6	912517	912522	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
74	NC_010364	G	7	7	913997	914003	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010364	A	7	7	921562	921568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010364	C	6	6	947305	947310	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
77	NC_010364	C	6	6	967129	967134	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
78	NC_010364	A	6	6	972110	972115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010364	A	7	7	986693	986699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010364	G	6	6	988833	988838	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010364	T	6	6	995923	995928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010364	C	6	6	1010577	1010582	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
83	NC_010364	A	6	6	1039169	1039174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010364	C	6	6	1053894	1053899	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
85	NC_010364	A	6	6	1062210	1062215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010364	A	6	6	1081743	1081748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010364	A	6	6	1096819	1096824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010364	G	6	6	1100230	1100235	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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90	NC_010364	G	7	7	1122143	1122149	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010364	T	6	6	1178823	1178828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010364	G	6	6	1189684	1189689	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010364	A	6	6	1196060	1196065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010364	G	6	6	1205391	1205396	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010364	G	6	6	1219415	1219420	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010364	C	6	6	1223239	1223244	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
97	NC_010364	G	6	6	1225147	1225152	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010364	T	6	6	1240439	1240444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010364	A	6	6	1292553	1292558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010364	A	6	6	1318881	1318886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010364	G	6	6	1319937	1319942	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010364	T	6	6	1321377	1321382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010364	C	6	6	1322959	1322964	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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108	NC_010364	T	6	6	1374877	1374882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010364	A	7	7	1387506	1387512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010364	G	6	6	1422039	1422044	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010364	G	6	6	1432307	1432312	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010364	G	6	6	1435134	1435139	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010364	C	6	6	1460830	1460835	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
114	NC_010364	G	6	6	1463918	1463923	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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116	NC_010364	G	6	6	1493550	1493555	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010364	C	6	6	1493596	1493601	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
118	NC_010364	T	6	6	1535190	1535195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010364	C	6	6	1546027	1546032	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
120	NC_010364	C	6	6	1561252	1561257	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
121	NC_010364	G	6	6	1561421	1561426	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010364	G	6	6	1566734	1566739	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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124	NC_010364	G	6	6	1577915	1577920	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010364	G	6	6	1583254	1583259	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010364	G	6	6	1599350	1599355	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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131	NC_010364	T	6	6	1668844	1668849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010364	G	6	6	1676422	1676427	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010364	G	6	6	1690667	1690672	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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136	NC_010364	C	6	6	1706060	1706065	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
137	NC_010364	G	6	6	1714039	1714044	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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140	NC_010364	G	6	6	1733520	1733525	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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146	NC_010364	G	6	6	1795133	1795138	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_010364	A	7	7	1855828	1855834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.