MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Halobacterium salinarum R1

Total Repeats: 627

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010364	GCTG	2	8	3299	3306	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010364	CCCT	2	8	12803	12810	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_010364	ACTC	2	8	12811	12818	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_010364	TCGC	2	8	13166	13173	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_010364	GGCG	2	8	14446	14453	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010364	TAGA	2	8	15286	15293	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010364	CTAA	2	8	18132	18139	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_010364	CCCT	2	8	21855	21862	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_010364	ATGG	2	8	22879	22886	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010364	ATAC	2	8	23081	23088	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_010364	CCCT	2	8	24735	24742	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12	NC_010364	CCTC	2	8	25229	25236	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_010364	GCCA	2	8	25522	25529	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_010364	AACC	2	8	25536	25543	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_010364	CCCA	2	8	26091	26098	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
16	NC_010364	AACT	2	8	29017	29024	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_010364	CACT	2	8	29995	30002	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010364	TCAC	2	8	30241	30248	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010364	TACG	2	8	30323	30330	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_010364	CGGC	2	8	31346	31353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_010364	GTCT	2	8	31647	31654	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_010364	ACGG	2	8	32449	32456	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_010364	AGCG	2	8	34112	34119	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_010364	TATC	2	8	34363	34370	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_010364	GTGA	2	8	37175	37182	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010364	AGTT	2	8	46539	46546	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010364	CTTC	2	8	46609	46616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010364	AATA	2	8	46621	46628	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010364	GGTG	2	8	46861	46868	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010364	AGCA	2	8	48043	48050	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_010364	CTAA	2	8	48057	48064	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_010364	TTCC	2	8	49535	49542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_010364	GACG	2	8	49629	49636	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_010364	GAAG	2	8	49917	49924	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010364	CCGA	2	8	50333	50340	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_010364	GACT	2	8	53113	53120	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_010364	GGAA	2	8	53281	53288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010364	ACCG	2	8	54164	54171	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_010364	TGAG	2	8	55538	55545	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010364	TTCC	2	8	58129	58136	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_010364	CTAA	2	8	58181	58188	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_010364	GTTC	2	8	61332	61339	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_010364	GCTC	2	8	63870	63877	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_010364	GTGG	2	8	64732	64739	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010364	AGAC	2	8	67001	67008	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_010364	TCAC	2	8	69837	69844	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_010364	CCTT	2	8	70557	70564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_010364	ACCA	2	8	71805	71812	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010364	CGCC	2	8	72775	72782	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
50	NC_010364	CGCC	2	8	72909	72916	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51	NC_010364	ACGC	2	8	72918	72925	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_010364	CGGG	2	8	74594	74601	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_010364	GCCG	2	8	78923	78930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_010364	GTGG	2	8	80621	80628	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010364	CCGG	2	8	82358	82365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_010364	GCCC	2	8	82383	82390	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
57	NC_010364	GCTG	2	8	83492	83499	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_010364	GCAG	2	8	85499	85506	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_010364	CCGT	2	8	85566	85573	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_010364	ACGC	2	8	87632	87639	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_010364	CCGC	2	8	87734	87741	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
62	NC_010364	CCGA	2	8	88530	88537	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_010364	TTAG	2	8	89316	89323	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010364	GGAA	2	8	89368	89375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010364	GAAC	2	8	91328	91335	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_010364	CGCT	2	8	97621	97628	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_010364	CCGT	2	8	97948	97955	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_010364	CCAT	2	8	100066	100073	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_010364	CTCC	2	8	100118	100125	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
70	NC_010364	TGGC	2	8	100427	100434	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_010364	TTCT	2	8	108183	108190	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_010364	ACTC	2	8	110248	110255	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_010364	CCCG	2	8	114729	114736	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
74	NC_010364	GCCA	2	8	114876	114883	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_010364	CCAT	2	8	115051	115058	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_010364	CGAG	2	8	116636	116643	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_010364	CGAC	2	8	116664	116671	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010364	GCGA	2	8	116681	116688	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_010364	TCGG	2	8	117628	117635	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_010364	TTCT	2	8	118209	118216	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_010364	CGGC	2	8	119220	119227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_010364	CGTG	2	8	119351	119358	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_010364	CCCG	2	8	120781	120788	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
84	NC_010364	CTGT	2	8	124985	124992	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_010364	CCCG	2	8	128608	128615	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
86	NC_010364	CTCG	2	8	144441	144448	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_010364	CCCG	2	8	148907	148914	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
88	NC_010364	TCAC	2	8	155759	155766	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_010364	GCCG	2	8	155820	155827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_010364	CCGG	2	8	158562	158569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_010364	AATA	2	8	166807	166814	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010364	CCAC	2	8	167420	167427	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
93	NC_010364	CGGC	2	8	181237	181244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_010364	CGGA	2	8	190444	190451	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_010364	CGGC	2	8	190452	190459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_010364	TCCC	2	8	201813	201820	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
97	NC_010364	ACGT	2	8	214343	214350	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_010364	GCGT	2	8	214471	214478	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_010364	GGAC	2	8	219016	219023	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_010364	GGCC	2	8	223171	223178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_010364	GGCT	2	8	225789	225796	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_010364	CGCC	2	8	225822	225829	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
103	NC_010364	CGGG	2	8	227272	227279	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
104	NC_010364	TGTC	2	8	236373	236380	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_010364	GACA	2	8	238234	238241	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_010364	CCGC	2	8	238381	238388	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
107	NC_010364	CCAG	2	8	254202	254209	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_010364	CGGC	2	8	254349	254356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_010364	CGAG	2	8	254380	254387	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_010364	CGCC	2	8	255093	255100	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
111	NC_010364	ACGT	2	8	255612	255619	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_010364	TTCC	2	8	257063	257070	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_010364	CTAA	2	8	257115	257122	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_010364	TCGC	2	8	264561	264568	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_010364	CGAC	2	8	265029	265036	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_010364	GGCC	2	8	276228	276235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_010364	TGCG	2	8	280429	280436	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_010364	TCGT	2	8	289188	289195	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_010364	CGCC	2	8	289324	289331	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
120	NC_010364	CCGG	2	8	289525	289532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_010364	GTCC	2	8	289544	289551	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_010364	CGAC	2	8	289594	289601	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_010364	TCAC	2	8	289798	289805	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_010364	TACG	2	8	289880	289887	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_010364	TGGT	2	8	292556	292563	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010364	TGCC	2	8	296631	296638	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_010364	CCGT	2	8	300528	300535	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_010364	GGCG	2	8	301028	301035	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
129	NC_010364	ACGC	2	8	309383	309390	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_010364	GGGC	2	8	310553	310560	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
131	NC_010364	CGTT	2	8	317665	317672	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_010364	CACG	2	8	317730	317737	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_010364	TGCC	2	8	321305	321312	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_010364	GTCT	2	8	325016	325023	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_010364	CTCA	2	8	325619	325626	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_010364	ACCC	2	8	332280	332287	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
137	NC_010364	CGCC	2	8	334197	334204	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
138	NC_010364	CGTA	2	8	342863	342870	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_010364	TGGG	2	8	342883	342890	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010364	TACG	2	8	346336	346343	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_010364	CGCC	2	8	346406	346413	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
142	NC_010364	AGTC	2	8	352817	352824	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_010364	GAGC	2	8	356507	356514	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_010364	ACGT	2	8	359292	359299	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_010364	AACG	2	8	359406	359413	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_010364	GACG	2	8	363809	363816	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_010364	GCCG	2	8	370570	370577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_010364	CGAC	2	8	373765	373772	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_010364	CGCC	2	8	373844	373851	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
150	NC_010364	GGGC	2	8	375326	375333	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
151	NC_010364	TCCC	2	8	377263	377270	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
152	NC_010364	CGGT	2	8	379400	379407	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
153	NC_010364	CCGT	2	8	382649	382656	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
154	NC_010364	ATCA	2	8	384107	384114	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
155	NC_010364	GCCG	2	8	385498	385505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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158	NC_010364	GCCG	2	8	400400	400407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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169	NC_010364	CCGC	2	8	451102	451109	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
170	NC_010364	ATGA	2	8	451156	451163	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_010364	CCGA	2	8	456829	456836	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
177	NC_010364	ATTG	2	8	456924	456931	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_010364	CTGA	2	8	494701	494708	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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445	NC_010364	GCGG	2	8	1384174	1384181	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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455	NC_010364	CGGA	2	8	1442059	1442066	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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467	NC_010364	TGGG	2	8	1477745	1477752	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_010364	GCCG	2	8	1484454	1484461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
471	NC_010364	CTCG	2	8	1485826	1485833	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
472	NC_010364	GACT	2	8	1485926	1485933	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
473	NC_010364	TCGT	2	8	1487267	1487274	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
474	NC_010364	ACCG	2	8	1487299	1487306	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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477	NC_010364	ACGT	2	8	1493715	1493722	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
478	NC_010364	CCGC	2	8	1495130	1495137	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
479	NC_010364	GCTG	2	8	1506219	1506226	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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481	NC_010364	GCGT	2	8	1522357	1522364	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
482	NC_010364	ACGG	2	8	1522415	1522422	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
483	NC_010364	GCGG	2	8	1523539	1523546	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
484	NC_010364	AGCG	2	8	1528043	1528050	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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487	NC_010364	ACCG	2	8	1555076	1555083	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
488	NC_010364	CTTA	2	8	1556340	1556347	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
489	NC_010364	CCGG	2	8	1556348	1556355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
490	NC_010364	CCGA	2	8	1561296	1561303	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
491	NC_010364	CGTA	2	8	1561408	1561415	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
492	NC_010364	CTGG	2	8	1561475	1561482	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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498	NC_010364	ATAC	2	8	1599410	1599417	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
499	NC_010364	CCCT	2	8	1601482	1601489	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
500	NC_010364	GCGA	2	8	1606378	1606385	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

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