MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Halobacterium salinarum R1

Total Repeats: 4319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010364	CTAT	2	8	1367180	1367187	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3002	NC_010364	CA	4	8	1367201	1367208	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3003	NC_010364	CCCG	2	8	1367455	1367462	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3004	NC_010364	AGG	2	6	1368382	1368387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_010364	CG	3	6	1371353	1371358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3006	NC_010364	CCG	2	6	1373485	1373490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3007	NC_010364	GCG	3	9	1373512	1373520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3009	NC_010364	CGC	2	6	1374841	1374846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3010	NC_010364	ACC	2	6	1374862	1374867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3011	NC_010364	T	6	6	1374877	1374882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_010364	CGT	2	6	1374887	1374892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_010364	GC	3	6	1375450	1375455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3014	NC_010364	CGG	2	6	1376684	1376689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_010364	CGC	2	6	1376692	1376697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3019	NC_010364	GCGG	2	8	1384174	1384181	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3020	NC_010364	CAC	2	6	1384221	1384226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3021	NC_010364	GTGTC	2	10	1386167	1386176	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3022	NC_010364	CGC	2	6	1386183	1386188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3023	NC_010364	GCC	2	6	1386196	1386201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3112	NC_010364	CGG	2	6	1412541	1412546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_010364	CGG	2	6	1412548	1412553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_010364	CGT	2	6	1412554	1412559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3121	NC_010364	TGGGG	2	10	1418878	1418887	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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3127	NC_010364	TCG	2	6	1420379	1420384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_010364	G	6	6	1422039	1422044	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_010364	ATA	2	6	1423056	1423061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_010364	CGA	2	6	1423114	1423119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_010364	AAC	2	6	1424097	1424102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_010364	TGC	2	6	1424113	1424118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_010364	CA	3	6	1425519	1425524	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3134	NC_010364	TA	3	6	1427316	1427321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_010364	GC	3	6	1427362	1427367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3136	NC_010364	GGC	2	6	1427368	1427373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3137	NC_010364	CGG	3	9	1432291	1432299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3138	NC_010364	G	6	6	1432307	1432312	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3139	NC_010364	GCG	2	6	1432318	1432323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3140	NC_010364	TGC	2	6	1432325	1432330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3141	NC_010364	TA	3	6	1432354	1432359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3142	NC_010364	GCA	2	6	1432430	1432435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3143	NC_010364	TTTC	2	8	1433270	1433277	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3144	NC_010364	CAC	2	6	1433304	1433309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3145	NC_010364	CCG	2	6	1433335	1433340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3146	NC_010364	ACG	2	6	1433355	1433360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3147	NC_010364	G	6	6	1435134	1435139	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3148	NC_010364	CG	3	6	1435140	1435145	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3149	NC_010364	TTGCC	2	10	1435151	1435160	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3150	NC_010364	GC	3	6	1436683	1436688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3151	NC_010364	GCG	2	6	1437467	1437472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3152	NC_010364	GCG	2	6	1437491	1437496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3153	NC_010364	GA	3	6	1438051	1438056	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3154	NC_010364	CCG	2	6	1438061	1438066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3155	NC_010364	GC	3	6	1438089	1438094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3156	NC_010364	CGG	2	6	1438095	1438100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3157	NC_010364	GTG	2	6	1439300	1439305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3158	NC_010364	CGG	2	6	1439323	1439328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3159	NC_010364	GCG	2	6	1439329	1439334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3160	NC_010364	TAA	2	6	1442007	1442012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3161	NC_010364	CGGA	2	8	1442059	1442066	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3162	NC_010364	CCG	2	6	1442076	1442081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3163	NC_010364	CGT	2	6	1442149	1442154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3164	NC_010364	CAG	2	6	1446539	1446544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3165	NC_010364	GTCCG	2	10	1446555	1446564	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3166	NC_010364	GAGCG	2	10	1447224	1447233	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3167	NC_010364	CCA	2	6	1447273	1447278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3169	NC_010364	CGA	2	6	1447838	1447843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3171	NC_010364	CCT	2	6	1448197	1448202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3172	NC_010364	GCG	2	6	1448255	1448260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3175	NC_010364	GATTC	2	10	1449710	1449719	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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3177	NC_010364	TGTA	2	8	1449975	1449982	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3182	NC_010364	TCG	2	6	1450259	1450264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3183	NC_010364	CTC	2	6	1450291	1450296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3202	NC_010364	ACG	2	6	1459626	1459631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3204	NC_010364	ACTGTT	2	12	1460176	1460187	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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3208	NC_010364	C	6	6	1460830	1460835	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3209	NC_010364	G	6	6	1463918	1463923	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3210	NC_010364	ACC	2	6	1463950	1463955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3222	NC_010364	TTG	2	6	1474594	1474599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3223	NC_010364	CTG	2	6	1474613	1474618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3227	NC_010364	GGC	2	6	1475170	1475175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3228	NC_010364	GCGT	2	8	1475183	1475190	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3229	NC_010364	C	7	7	1475196	1475202	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3230	NC_010364	GGC	2	6	1475203	1475208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3231	NC_010364	GGC	2	6	1475225	1475230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3232	NC_010364	GGT	2	6	1475250	1475255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3233	NC_010364	TGGG	2	8	1477745	1477752	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3234	NC_010364	GAC	2	6	1477754	1477759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3235	NC_010364	GC	5	10	1477840	1477849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3236	NC_010364	TTC	2	6	1477886	1477891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3241	NC_010364	TCGG	2	8	1482786	1482793	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3242	NC_010364	GCC	2	6	1482797	1482802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3243	NC_010364	GCT	2	6	1482815	1482820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3244	NC_010364	GGT	2	6	1484366	1484371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3245	NC_010364	GCCG	2	8	1484454	1484461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3246	NC_010364	AGG	2	6	1484464	1484469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3247	NC_010364	CGG	3	9	1484522	1484530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3248	NC_010364	TCG	2	6	1485727	1485732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3249	NC_010364	GAC	2	6	1485758	1485763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3250	NC_010364	TCG	2	6	1485813	1485818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3251	NC_010364	GGT	2	6	1485820	1485825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3252	NC_010364	CTCG	2	8	1485826	1485833	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3253	NC_010364	ACG	2	6	1485839	1485844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3254	NC_010364	GAG	2	6	1485851	1485856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3255	NC_010364	CGC	2	6	1485898	1485903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3256	NC_010364	TGC	2	6	1485906	1485911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3257	NC_010364	GTC	2	6	1485913	1485918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3258	NC_010364	GACT	2	8	1485926	1485933	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3259	NC_010364	CGG	2	6	1485951	1485956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3260	NC_010364	GGC	2	6	1485988	1485993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3261	NC_010364	CGC	2	6	1487215	1487220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3262	NC_010364	TCGT	2	8	1487267	1487274	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3263	NC_010364	ACCG	2	8	1487299	1487306	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3276	NC_010364	AGGG	2	8	1493556	1493563	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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3279	NC_010364	CAGA	2	8	1493614	1493621	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3385	NC_010364	CCGG	2	8	1556348	1556355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3389	NC_010364	C	6	6	1561252	1561257	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3390	NC_010364	GCG	2	6	1561275	1561280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3392	NC_010364	GC	3	6	1561304	1561309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3393	NC_010364	CAG	2	6	1561343	1561348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3396	NC_010364	CGTA	2	8	1561408	1561415	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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