MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halobacterium salinarum R1

Total Repeats: 4319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010364	CGA	2	6	356277	356282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_010364	GC	3	6	356461	356466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_010364	CAC	2	6	356488	356493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1004	NC_010364	GCG	2	6	356496	356501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_010364	GAGC	2	8	356507	356514	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1006	NC_010364	GAG	2	6	356539	356544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_010364	GCC	2	6	359215	359220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_010364	ACGT	2	8	359292	359299	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_010364	GTG	2	6	359331	359336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_010364	TG	3	6	359335	359340	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_010364	GGC	2	6	359382	359387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_010364	AACG	2	8	359406	359413	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1013	NC_010364	AC	3	6	359436	359441	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_010364	TCA	2	6	361099	361104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_010364	CGG	2	6	362076	362081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_010364	GGT	3	9	362099	362107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_010364	GGC	2	6	362108	362113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_010364	GACG	2	8	363809	363816	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1019	NC_010364	TCC	2	6	363844	363849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_010364	GAC	3	9	363852	363860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_010364	GAGCGG	2	12	363897	363908	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
1022	NC_010364	ACG	2	6	363946	363951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_010364	GC	3	6	363969	363974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_010364	CGT	2	6	363992	363997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_010364	GTCGCG	2	12	364017	364028	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_010364	CGG	2	6	364032	364037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_010364	CGG	2	6	364059	364064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_010364	GCT	2	6	364089	364094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_010364	CGG	2	6	364170	364175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_010364	GCC	2	6	364209	364214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_010364	TG	3	6	364796	364801	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_010364	G	6	6	364824	364829	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_010364	CG	3	6	364843	364848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_010364	A	6	6	368501	368506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_010364	CAG	2	6	369678	369683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_010364	TGG	2	6	369711	369716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_010364	CGTCGC	2	12	369764	369775	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_010364	CGC	2	6	370526	370531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_010364	CGC	2	6	370551	370556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_010364	GCCG	2	8	370570	370577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_010364	CGG	2	6	371807	371812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_010364	CGAC	2	8	373765	373772	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_010364	CGCC	2	8	373844	373851	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1044	NC_010364	CGG	2	6	373856	373861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_010364	CCA	2	6	373862	373867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_010364	CCG	2	6	375282	375287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_010364	GCC	2	6	375317	375322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_010364	GGGC	2	8	375326	375333	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1049	NC_010364	CCG	2	6	375764	375769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_010364	CGC	2	6	377242	377247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_010364	TCCC	2	8	377263	377270	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1052	NC_010364	TTG	2	6	379335	379340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_010364	TAT	2	6	379358	379363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_010364	CGGT	2	8	379400	379407	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1055	NC_010364	CGC	3	9	380576	380584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_010364	C	6	6	380584	380589	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1057	NC_010364	CCG	2	6	380594	380599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_010364	CCGT	2	8	382649	382656	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_010364	ATCA	2	8	384107	384114	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1060	NC_010364	CAGTC	2	10	384988	384997	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1061	NC_010364	GAC	2	6	385030	385035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_010364	GAC	2	6	385041	385046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_010364	TGA	2	6	385286	385291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_010364	GCCG	2	8	385498	385505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_010364	TG	3	6	386777	386782	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_010364	CG	3	6	386799	386804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_010364	CGC	2	6	386864	386869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_010364	TGG	2	6	386926	386931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_010364	CCG	2	6	387167	387172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1070	NC_010364	CA	3	6	387174	387179	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_010364	CCGCC	2	10	387196	387205	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1072	NC_010364	AGG	2	6	391763	391768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_010364	GTG	2	6	392074	392079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_010364	C	6	6	392334	392339	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1075	NC_010364	CGGA	2	8	392377	392384	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1076	NC_010364	CGAACC	2	12	392385	392396	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1077	NC_010364	AGC	2	6	395922	395927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_010364	C	6	6	395963	395968	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1079	NC_010364	GGGC	2	8	395973	395980	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1080	NC_010364	GT	3	6	396001	396006	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_010364	GAC	2	6	396028	396033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_010364	CGC	2	6	396047	396052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_010364	ACG	2	6	396053	396058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_010364	TAT	2	6	396124	396129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_010364	CGC	2	6	397092	397097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1086	NC_010364	ACGCA	2	10	397104	397113	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1087	NC_010364	CA	4	8	397116	397123	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1088	NC_010364	GCCG	2	8	400400	400407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_010364	GTG	2	6	400942	400947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_010364	ACG	2	6	400979	400984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_010364	ACT	2	6	401005	401010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_010364	G	6	6	401036	401041	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_010364	G	6	6	401086	401091	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_010364	GCC	2	6	401097	401102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_010364	AT	3	6	401295	401300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_010364	CG	3	6	402437	402442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1097	NC_010364	GCT	2	6	402454	402459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_010364	CGTGG	2	10	402463	402472	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1099	NC_010364	TGGC	2	8	402473	402480	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1100	NC_010364	GCC	2	6	402487	402492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1101	NC_010364	CGCC	2	8	402503	402510	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1102	NC_010364	CGT	2	6	404676	404681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_010364	AT	4	8	404696	404703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_010364	CGA	2	6	404755	404760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_010364	CAC	3	9	404783	404791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_010364	TC	3	6	408022	408027	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_010364	GGC	2	6	408069	408074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_010364	CGT	2	6	409073	409078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_010364	CAC	2	6	409127	409132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_010364	GGC	2	6	410440	410445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_010364	TGA	2	6	410471	410476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_010364	CGC	2	6	410477	410482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_010364	AC	3	6	410490	410495	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1114	NC_010364	AC	3	6	412454	412459	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_010364	CGG	3	9	412500	412508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_010364	CCA	2	6	412509	412514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_010364	TCA	2	6	413123	413128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_010364	CGAC	2	8	413164	413171	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_010364	GCA	2	6	415448	415453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_010364	CGT	2	6	415458	415463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_010364	CGG	2	6	415481	415486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_010364	GGCGT	2	10	419596	419605	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1123	NC_010364	CCGC	2	8	419630	419637	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1124	NC_010364	CCG	2	6	419642	419647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_010364	CGG	2	6	419650	419655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_010364	CGA	2	6	419715	419720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_010364	CGA	2	6	421290	421295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_010364	CGG	2	6	421468	421473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_010364	ATCCC	2	10	421486	421495	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1130	NC_010364	GAA	2	6	422265	422270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_010364	CCG	2	6	422282	422287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1132	NC_010364	CCG	2	6	422294	422299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_010364	CGA	2	6	422896	422901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_010364	ACGGA	2	10	422909	422918	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1135	NC_010364	CGG	2	6	430850	430855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_010364	GGC	2	6	430875	430880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_010364	GTC	2	6	430890	430895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1253	NC_010364	GCG	4	12	488338	488349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1268	NC_010364	AAAG	2	8	494353	494360	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1269	NC_010364	CCA	2	6	494397	494402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1408	NC_010364	AGT	2	6	571534	571539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1409	NC_010364	ACG	2	6	571567	571572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1410	NC_010364	TCG	2	6	571579	571584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1411	NC_010364	CACC	2	8	571615	571622	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1412	NC_010364	CCA	2	6	571623	571628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1431	NC_010364	CG	3	6	582574	582579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1432	NC_010364	A	6	6	582580	582585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1433	NC_010364	GT	4	8	582590	582597	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_010364	AAC	2	6	585068	585073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1443	NC_010364	C	6	6	585535	585540	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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