MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halobacterium salinarum R1

Total Repeats: 4319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010364	ACC	2	6	115166	115171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_010364	TAG	2	6	115815	115820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_010364	AC	3	6	116434	116439	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
504	NC_010364	ACG	2	6	116540	116545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_010364	GC	3	6	116572	116577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
506	NC_010364	GT	3	6	116615	116620	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
507	NC_010364	CGAG	2	8	116636	116643	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
508	NC_010364	CGAC	2	8	116664	116671	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
509	NC_010364	CAA	2	6	116673	116678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_010364	GCGA	2	8	116681	116688	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
511	NC_010364	ATG	2	6	116721	116726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_010364	ACA	2	6	117290	117295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_010364	CGC	2	6	117317	117322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_010364	CAT	2	6	117357	117362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_010364	TGG	3	9	117384	117392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_010364	TCG	2	6	117437	117442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_010364	GGC	2	6	117446	117451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_010364	GCAGC	2	10	117472	117481	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
519	NC_010364	TGG	2	6	117485	117490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_010364	GC	3	6	117492	117497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
521	NC_010364	GTC	2	6	117606	117611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_010364	CGG	2	6	117620	117625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_010364	TCGG	2	8	117628	117635	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
524	NC_010364	TAG	2	6	117649	117654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_010364	GAAGA	2	10	117713	117722	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
526	NC_010364	AAG	2	6	117787	117792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_010364	GCC	2	6	118185	118190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_010364	TTCT	2	8	118209	118216	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
529	NC_010364	GAG	2	6	118233	118238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
530	NC_010364	CG	3	6	118248	118253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
531	NC_010364	GTC	2	6	118293	118298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_010364	CGT	2	6	118310	118315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_010364	GTG	2	6	118318	118323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
534	NC_010364	GTT	2	6	118409	118414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_010364	CGGC	2	8	119220	119227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
536	NC_010364	CGTG	2	8	119351	119358	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
537	NC_010364	TC	3	6	119404	119409	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
538	NC_010364	CT	3	6	119410	119415	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
539	NC_010364	GGT	2	6	119449	119454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_010364	TCGCT	2	10	119591	119600	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
541	NC_010364	TAT	2	6	119652	119657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_010364	AAC	2	6	120352	120357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_010364	A	6	6	120377	120382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_010364	TGG	2	6	120622	120627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_010364	GCC	2	6	120645	120650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_010364	CCT	2	6	120660	120665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_010364	TAA	2	6	120669	120674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_010364	T	7	7	120685	120691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_010364	CCCG	2	8	120781	120788	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
550	NC_010364	AC	3	6	124973	124978	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
551	NC_010364	CTGT	2	8	124985	124992	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
552	NC_010364	GCC	2	6	125003	125008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_010364	GTT	2	6	125011	125016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_010364	GAC	2	6	125062	125067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_010364	CCG	2	6	125094	125099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_010364	CCG	2	6	125115	125120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_010364	T	6	6	125137	125142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_010364	CCG	2	6	125147	125152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_010364	TCC	2	6	126299	126304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_010364	CG	3	6	127779	127784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
561	NC_010364	CAG	2	6	128566	128571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_010364	CCCG	2	8	128608	128615	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
563	NC_010364	CAGCC	2	10	128618	128627	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
564	NC_010364	CGG	2	6	129881	129886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_010364	CG	3	6	130866	130871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
566	NC_010364	CG	3	6	132879	132884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
567	NC_010364	CG	3	6	132908	132913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
568	NC_010364	GCT	2	6	132960	132965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_010364	CCA	2	6	135441	135446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_010364	TGG	2	6	135490	135495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
571	NC_010364	AAC	2	6	136987	136992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_010364	TGG	3	9	137011	137019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_010364	CGG	3	9	138643	138651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_010364	CAGCCA	2	12	141306	141317	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
575	NC_010364	CGC	2	6	141337	141342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_010364	GCGCC	2	10	142375	142384	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
577	NC_010364	CGT	2	6	143262	143267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_010364	GCA	2	6	143272	143277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_010364	CTG	2	6	144370	144375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_010364	CTCG	2	8	144441	144448	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
581	NC_010364	ACG	3	9	144479	144487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_010364	GCC	2	6	144494	144499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_010364	GT	3	6	145192	145197	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
584	NC_010364	CG	3	6	145247	145252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
585	NC_010364	CGC	2	6	145254	145259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_010364	ACG	2	6	145293	145298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_010364	GCC	2	6	148699	148704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_010364	CAC	2	6	148705	148710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_010364	CCG	2	6	148794	148799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_010364	CAC	2	6	148824	148829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
591	NC_010364	CACAC	2	10	148845	148854	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
592	NC_010364	CCG	2	6	148886	148891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
593	NC_010364	TCG	3	9	148894	148902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_010364	CCCG	2	8	148907	148914	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
595	NC_010364	CGC	2	6	152869	152874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_010364	CTG	2	6	152885	152890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_010364	AC	3	6	152898	152903	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
598	NC_010364	GCC	2	6	152915	152920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_010364	TG	3	6	153540	153545	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_010364	CGT	2	6	153588	153593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_010364	CCA	2	6	153614	153619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_010364	CCG	2	6	153640	153645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
603	NC_010364	TGG	2	6	154655	154660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
604	NC_010364	CGC	2	6	154708	154713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_010364	GCT	2	6	154720	154725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_010364	CACGT	2	10	154811	154820	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
607	NC_010364	CGC	2	6	154825	154830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_010364	CGG	2	6	154834	154839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_010364	TGG	2	6	154840	154845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_010364	TCAC	2	8	155759	155766	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
611	NC_010364	CCT	2	6	155791	155796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_010364	GCC	2	6	155807	155812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_010364	GCCG	2	8	155820	155827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
614	NC_010364	GGC	2	6	155835	155840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_010364	GCG	2	6	157624	157629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_010364	CCGG	2	8	158562	158569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
617	NC_010364	GCG	2	6	158589	158594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_010364	CGC	2	6	158616	158621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_010364	C	6	6	160615	160620	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
620	NC_010364	CG	3	6	161289	161294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
621	NC_010364	GCC	2	6	161321	161326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_010364	GC	3	6	161351	161356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
623	NC_010364	CCG	2	6	162771	162776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_010364	CT	3	6	162788	162793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
625	NC_010364	CCG	3	9	164291	164299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_010364	CG	3	6	165278	165283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
627	NC_010364	GGT	2	6	166754	166759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
628	NC_010364	GAC	2	6	166769	166774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_010364	AC	3	6	166791	166796	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
630	NC_010364	AATA	2	8	166807	166814	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_010364	CGG	2	6	166820	166825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_010364	CCAC	2	8	167420	167427	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
633	NC_010364	C	6	6	167524	167529	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
634	NC_010364	TGG	2	6	167660	167665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
635	NC_010364	AG	3	6	167680	167685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
636	NC_010364	GTA	2	6	167706	167711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_010364	GTCGT	2	10	167717	167726	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
638	NC_010364	GA	3	6	167792	167797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
639	NC_010364	CACTCC	2	12	167819	167830	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
640	NC_010364	TCA	2	6	167841	167846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_010364	CTC	2	6	167874	167879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
642	NC_010364	AGA	2	6	167905	167910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
643	NC_010364	CGC	2	6	167938	167943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
644	NC_010364	GC	3	6	168247	168252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
645	NC_010364	AGC	2	6	168274	168279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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647	NC_010364	CTC	2	6	169383	169388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
648	NC_010364	CGC	2	6	169401	169406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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650	NC_010364	ACG	2	6	176831	176836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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652	NC_010364	TG	4	8	176947	176954	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
653	NC_010364	GGC	2	6	176969	176974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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657	NC_010364	CGG	2	6	177089	177094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
658	NC_010364	CCG	2	6	177163	177168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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671	NC_010364	GCC	2	6	182921	182926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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674	NC_010364	CCG	2	6	185407	185412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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681	NC_010364	TG	3	6	187673	187678	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
682	NC_010364	CAC	2	6	187693	187698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
683	NC_010364	CGT	2	6	187757	187762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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724	NC_010364	GTC	2	6	219031	219036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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768	NC_010364	CGA	2	6	254223	254228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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771	NC_010364	CGGC	2	8	254349	254356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
772	NC_010364	CGAG	2	8	254380	254387	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
773	NC_010364	CGCC	2	8	255093	255100	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
774	NC_010364	GCC	2	6	255102	255107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
775	NC_010364	CGG	2	6	255161	255166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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777	NC_010364	ACG	2	6	255196	255201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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914	NC_010364	CAG	2	6	306372	306377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
915	NC_010364	ACTGC	2	10	306385	306394	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
916	NC_010364	CCA	2	6	306398	306403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
917	NC_010364	GCG	2	6	306420	306425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
918	NC_010364	GCG	2	6	306441	306446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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923	NC_010364	CGC	2	6	310567	310572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
924	NC_010364	CCAGC	2	10	313025	313034	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
925	NC_010364	GCC	3	9	313061	313069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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938	NC_010364	TGG	2	6	320854	320859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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947	NC_010364	CGG	2	6	325034	325039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
948	NC_010364	CCG	2	6	325079	325084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
949	NC_010364	GGC	2	6	325085	325090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
950	NC_010364	CGC	2	6	325578	325583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
951	NC_010364	AC	3	6	325593	325598	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
952	NC_010364	CTCA	2	8	325619	325626	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
953	NC_010364	GTT	2	6	326001	326006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
954	NC_010364	GCC	2	6	326049	326054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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956	NC_010364	GC	3	6	326066	326071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
957	NC_010364	GAC	2	6	330698	330703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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961	NC_010364	GT	3	6	335140	335145	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
962	NC_010364	GCG	2	6	335151	335156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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978	NC_010364	CG	3	6	346399	346404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
979	NC_010364	CGCC	2	8	346406	346413	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
980	NC_010364	CGG	2	6	346436	346441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
981	NC_010364	CCA	2	6	346463	346468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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997	NC_010364	GGT	2	6	355513	355518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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