MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Heliobacterium modesticaldum Ice1 chromosome

Total Repeats: 1187

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010337	CAAA	2	8	278	285	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010337	TCCC	2	8	4370	4377	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_010337	CGAC	2	8	7400	7407	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_010337	CCAG	2	8	7670	7677	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_010337	GTCT	2	8	7698	7705	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010337	AATC	2	8	9890	9897	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_010337	CCTC	2	8	9973	9980	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8	NC_010337	ATCG	2	8	12104	12111	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_010337	GAAT	2	8	12827	12834	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010337	GCCC	2	8	16926	16933	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11	NC_010337	AAGC	2	8	16963	16970	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_010337	AAGC	2	8	18870	18877	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_010337	TTTA	2	8	19422	19429	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010337	AGCC	2	8	19633	19640	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_010337	AGAC	2	8	21508	21515	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_010337	GTAC	2	8	23622	23629	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_010337	CACT	2	8	25007	25014	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010337	GAAT	2	8	25802	25809	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010337	TCCC	2	8	28059	28066	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
20	NC_010337	ATTA	2	8	30655	30662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010337	TATC	2	8	30676	30683	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_010337	TGGT	2	8	31680	31687	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010337	TGGG	2	8	34150	34157	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010337	ACCC	2	8	34576	34583	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_010337	TAGT	2	8	35398	35405	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010337	ATCC	2	8	35480	35487	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010337	ACAG	2	8	35508	35515	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_010337	AGGG	2	8	35934	35941	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010337	CGTC	2	8	36165	36172	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_010337	GCCC	2	8	36343	36350	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31	NC_010337	GATA	2	8	43447	43454	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010337	TTTA	2	8	43507	43514	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010337	CCTT	2	8	44587	44594	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_010337	CCCT	2	8	44843	44850	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
35	NC_010337	CTGT	2	8	48515	48522	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_010337	CCCT	2	8	50401	50408	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
37	NC_010337	AAGG	2	8	50410	50417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010337	AAAG	2	8	53272	53279	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010337	CCCT	2	8	53750	53757	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
40	NC_010337	TCAT	2	8	62706	62713	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_010337	GCCA	2	8	63317	63324	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_010337	TGAG	2	8	65235	65242	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010337	ATTC	2	8	65244	65251	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_010337	AAAT	2	8	65318	65325	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010337	ACTC	2	8	79480	79487	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_010337	TTTC	2	8	82656	82663	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_010337	CGGG	2	8	85282	85289	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_010337	AATA	2	8	86822	86829	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010337	CTGT	2	8	86916	86923	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_010337	GACT	2	8	88106	88113	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_010337	CCGC	2	8	93726	93733	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
52	NC_010337	ATCG	2	8	96102	96109	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_010337	AATC	2	8	96853	96860	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_010337	CGGT	2	8	98442	98449	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_010337	GTAT	2	8	98451	98458	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010337	CTGC	2	8	101520	101527	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_010337	TTGC	2	8	104596	104603	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_010337	GCTG	2	8	104619	104626	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_010337	CGAA	2	8	104709	104716	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_010337	GAAA	2	8	104816	104823	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010337	CAAA	2	8	105707	105714	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_010337	ACAA	2	8	107127	107134	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_010337	GTCC	2	8	109927	109934	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_010337	GATC	2	8	109976	109983	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_010337	TTCT	2	8	112566	112573	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_010337	GCAG	2	8	119262	119269	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_010337	TGCC	2	8	119278	119285	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_010337	ATTT	2	8	119430	119437	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010337	CAAA	2	8	120265	120272	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_010337	GGAG	2	8	160804	160811	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010337	AATT	2	8	161027	161034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010337	ATGA	2	8	161075	161082	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010337	TGAT	2	8	161386	161393	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010337	TCCT	2	8	162753	162760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_010337	CATA	2	8	162967	162974	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_010337	CTTC	2	8	163020	163027	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_010337	CCCG	2	8	166042	166049	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
78	NC_010337	GAAG	2	8	166309	166316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010337	CATA	2	8	177085	177092	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_010337	TGCT	2	8	179393	179400	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_010337	TCCC	2	8	180935	180942	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
82	NC_010337	AGGG	2	8	183529	183536	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010337	ATTC	2	8	210708	210715	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_010337	CTGT	2	8	211410	211417	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_010337	TTTA	2	8	220726	220733	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010337	AGGC	2	8	220869	220876	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_010337	GATC	2	8	221227	221234	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_010337	CGGT	2	8	221479	221486	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_010337	TGTC	2	8	221802	221809	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_010337	GTCG	2	8	223401	223408	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_010337	TCGC	2	8	223923	223930	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_010337	CAGG	2	8	226401	226408	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_010337	ATTG	2	8	226802	226809	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010337	TTTC	2	8	231468	231475	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_010337	AAAG	2	8	248950	248957	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010337	GTCA	2	8	252000	252007	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_010337	AACG	2	8	252482	252489	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_010337	AACA	2	8	254356	254363	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_010337	GTCT	2	8	258395	258402	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_010337	GGCT	2	8	260269	260276	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_010337	GTTT	2	8	260589	260596	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010337	GCTA	2	8	260929	260936	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_010337	CTGG	2	8	261008	261015	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_010337	GAAA	2	8	261450	261457	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010337	GCCT	2	8	263636	263643	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_010337	GTCT	2	8	265897	265904	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_010337	GGCT	2	8	267771	267778	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_010337	GTCT	2	8	268032	268039	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_010337	GGCT	2	8	269906	269913	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_010337	TTTC	2	8	270226	270233	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_010337	GAGC	2	8	271186	271193	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_010337	AGGC	2	8	272433	272440	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_010337	AAGA	2	8	274678	274685	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010337	CTAT	2	8	274698	274705	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_010337	CGTT	2	8	286181	286188	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_010337	GTCT	2	8	286226	286233	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_010337	GGCT	2	8	288100	288107	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_010337	CCCG	2	8	289417	289424	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
119	NC_010337	TCCC	2	8	294557	294564	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
120	NC_010337	CCTG	2	8	296717	296724	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_010337	ATTA	2	8	297548	297555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010337	CCGG	2	8	302290	302297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_010337	AGAA	2	8	305012	305019	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010337	GACG	2	8	313718	313725	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_010337	ATCG	2	8	328887	328894	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_010337	ATTT	2	8	329305	329312	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010337	ACAG	2	8	329375	329382	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_010337	TGAT	2	8	332544	332551	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010337	ACCT	2	8	334631	334638	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_010337	TCAT	3	12	336708	336719	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_010337	TATT	2	8	346866	346873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010337	GCAA	2	8	346897	346904	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_010337	TCCT	2	8	351504	351511	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_010337	CTTC	2	8	352285	352292	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_010337	CCTC	2	8	353883	353890	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
136	NC_010337	CTTT	2	8	363205	363212	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_010337	ATGA	2	8	363223	363230	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010337	CCTT	2	8	369195	369202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_010337	TGTC	2	8	370534	370541	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_010337	GACA	2	8	370561	370568	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_010337	TCTG	2	8	370807	370814	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_010337	AGAA	2	8	370990	370997	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010337	GCCC	2	8	373771	373778	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
144	NC_010337	TTCC	2	8	374207	374214	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_010337	CTTG	2	8	376212	376219	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_010337	GGAA	2	8	378808	378815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010337	CGGA	2	8	384233	384240	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_010337	TAAG	2	8	384364	384371	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010337	GATT	2	8	384496	384503	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010337	GACG	2	8	384625	384632	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_010337	CTCC	2	8	385073	385080	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
152	NC_010337	ATCG	2	8	385576	385583	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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