MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 plasmid pHAU02

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009974	CGAAC	2	10	11624	11633	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_009974	CCAAC	2	10	12109	12118	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
3	NC_009974	CCAAC	2	10	12127	12136	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
4	NC_009974	TCCTA	2	10	24145	24154	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_009974	GACCC	2	10	34252	34261	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_009974	CAGCT	2	10	36097	36106	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_009974	ACGCC	2	10	44685	44694	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_009974	TTGCT	2	10	44920	44929	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_009974	GTCAT	2	10	50878	50887	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_009974	AGCAT	2	10	57668	57677	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_009974	GACGT	2	10	59156	59165	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_009974	CCAAC	2	10	68441	68450	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
13	NC_009974	CAACG	2	10	70023	70032	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_009974	TGTCT	2	10	73188	73197	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009974	GGTGT	2	10	74404	74413	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009974	TATAT	2	10	74486	74495	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009974	TTGAT	2	10	83773	83782	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009974	TCCGC	2	10	87555	87564	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_009974	GGCGC	2	10	96778	96787	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
20	NC_009974	AGCGC	2	10	96865	96874	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_009974	GCATA	2	10	98050	98059	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.