MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 plasmid pHAU01

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009973	AC	3	6	2447	2452	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009973	GC	3	6	10490	10495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009973	TC	3	6	13001	13006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009973	CA	3	6	20743	20748	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009973	GA	3	6	23172	23177	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009973	AG	3	6	25259	25264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009973	AT	4	8	25306	25313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009973	AT	3	6	25338	25343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009973	TC	3	6	27576	27581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009973	AG	3	6	27632	27637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009973	GT	3	6	27710	27715	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009973	CT	3	6	27989	27994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009973	GC	3	6	34147	34152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009973	TC	3	6	37174	37179	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009973	TC	3	6	40248	40253	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009973	GA	3	6	44081	44086	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009973	GT	3	6	47988	47993	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009973	CG	3	6	48097	48102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009973	TG	3	6	52281	52286	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009973	CG	3	6	54190	54195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009973	TG	3	6	56356	56361	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009973	TG	3	6	56458	56463	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009973	GT	3	6	58601	58606	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009973	CA	3	6	58755	58760	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009973	AT	3	6	58929	58934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009973	GT	3	6	66453	66458	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009973	AC	3	6	68088	68093	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009973	TG	3	6	69890	69895	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009973	CA	3	6	70895	70900	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009973	GT	3	6	70938	70943	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009973	CA	3	6	81559	81564	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009973	AC	3	6	81593	81598	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009973	CA	3	6	84179	84184	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009973	AT	3	6	84421	84426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009973	AT	3	6	84437	84442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009973	AG	3	6	101892	101897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009973	CT	3	6	106423	106428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009973	AC	3	6	106786	106791	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009973	AC	3	6	106930	106935	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009973	CT	3	6	109260	109265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009973	CA	3	6	111947	111952	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009973	AC	3	6	113184	113189	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009973	AT	3	6	114515	114520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009973	AG	3	6	125865	125870	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009973	TC	4	8	128574	128581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009973	GC	3	6	135561	135566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009973	CG	3	6	137446	137451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_009973	CG	4	8	138546	138553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_009973	CA	3	6	173254	173259	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009973	AC	3	6	178342	178347	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009973	AC	3	6	179170	179175	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009973	GA	3	6	180806	180811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009973	CA	3	6	180838	180843	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009973	TA	3	6	182975	182980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009973	AT	3	6	183063	183068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009973	AT	3	6	183074	183079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009973	AT	3	6	188468	188473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009973	CT	3	6	188476	188481	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_009973	GA	4	8	195132	195139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009973	AT	3	6	196178	196183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009973	AT	4	8	196445	196452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009973	CA	3	6	197960	197965	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009973	AG	4	8	203197	203204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009973	AT	3	6	210484	210489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009973	TA	3	6	210510	210515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009973	TA	3	6	210641	210646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009973	TA	3	6	210707	210712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009973	TA	3	6	210742	210747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009973	AT	3	6	210779	210784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009973	AT	3	6	210807	210812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009973	AG	3	6	217406	217411	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009973	AG	3	6	217451	217456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009973	TA	3	6	217551	217556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009973	TC	3	6	217596	217601	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009973	GA	3	6	223439	223444	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009973	AT	3	6	223470	223475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009973	CT	3	6	223964	223969	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_009973	AG	3	6	238640	238645	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009973	AC	3	6	239124	239129	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_009973	GA	3	6	241391	241396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009973	CG	3	6	247960	247965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009973	AG	3	6	254848	254853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009973	TC	3	6	256109	256114	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_009973	AT	3	6	259589	259594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009973	CG	3	6	262853	262858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_009973	TC	3	6	274055	274060	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_009973	GA	3	6	274441	274446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009973	TC	3	6	276499	276504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_009973	CA	3	6	276934	276939	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_009973	AT	3	6	280676	280681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009973	CA	3	6	282111	282116	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_009973	CG	3	6	282391	282396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_009973	AC	3	6	295654	295659	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009973	CG	3	6	296337	296342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_009973	CG	3	6	296520	296525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_009973	TA	3	6	301171	301176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009973	CA	3	6	305749	305754	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_009973	CT	3	6	306397	306402	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_009973	CA	4	8	307562	307569	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_009973	TG	4	8	312593	312600	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009973	GT	3	6	312730	312735	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009973	CT	3	6	335027	335032	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_009973	TC	3	6	335213	335218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_009973	TC	4	8	335229	335236	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.