MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 plasmid pHAU01

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009973	CCACC	2	10	10455	10464	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
2	NC_009973	ATAGC	2	10	12566	12575	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_009973	TTTTA	2	10	17533	17542	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009973	TTTTA	2	10	23188	23197	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009973	CACCG	2	10	23597	23606	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_009973	ATGGC	2	10	26378	26387	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_009973	TTGTC	2	10	30452	30461	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_009973	TAGGA	2	10	31621	31630	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009973	CGCAC	2	10	34514	34523	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NC_009973	GCTAT	2	10	37929	37938	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_009973	TGCGG	2	10	37996	38005	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_009973	ATCCA	2	10	38132	38141	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_009973	AATGA	2	10	39916	39925	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009973	CCCAA	2	10	44113	44122	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
15	NC_009973	GACCA	2	10	49759	49768	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_009973	CGATG	2	10	59758	59767	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_009973	AGCCC	2	10	59852	59861	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
18	NC_009973	GTCTT	2	10	63448	63457	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_009973	TTGTG	2	10	84124	84133	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009973	ATCCA	2	10	102009	102018	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_009973	CGATC	2	10	102222	102231	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_009973	AAACT	2	10	103010	103019	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009973	CGGCG	2	10	103033	103042	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
24	NC_009973	CATTT	2	10	105441	105450	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_009973	GGGCT	2	10	109851	109860	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_009973	CAATG	2	10	110416	110425	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_009973	ACCAA	2	10	119007	119016	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_009973	TGGAA	2	10	134865	134874	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009973	TGCCG	2	10	146949	146958	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_009973	GCGAT	2	10	152731	152740	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_009973	CATCG	2	10	152778	152787	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_009973	CATCG	2	10	152830	152839	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_009973	CATCG	2	10	152882	152891	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_009973	CATCG	2	10	152975	152984	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_009973	TGTTT	2	10	158082	158091	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009973	ACACC	2	10	173339	173348	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
37	NC_009973	TGCAG	2	10	180659	180668	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_009973	AAGGA	2	10	180847	180856	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009973	TTATT	2	10	192390	192399	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009973	TACAG	2	10	196257	196266	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_009973	TTGCT	2	10	197928	197937	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_009973	CTATC	2	10	217319	217328	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_009973	GACGC	2	10	229741	229750	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_009973	CACGC	2	10	238950	238959	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
45	NC_009973	TATGG	2	10	241260	241269	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009973	AGGCA	2	10	247579	247588	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_009973	TGATA	2	10	248041	248050	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009973	AGCAA	2	10	254757	254766	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_009973	TGGCG	2	10	254986	254995	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_009973	CCCCG	2	10	257177	257186	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
51	NC_009973	CGAGC	2	10	267401	267410	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_009973	GCTCG	2	10	267421	267430	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_009973	ACCAG	2	10	269298	269307	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_009973	GATTA	2	10	276513	276522	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009973	GCCCT	2	10	281969	281978	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
56	NC_009973	CAGGG	2	10	295668	295677	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
57	NC_009973	ACTCT	2	10	296804	296813	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NC_009973	CTATC	2	10	300994	301003	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_009973	CACAA	2	10	301143	301152	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_009973	TCCAC	2	10	312737	312746	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
61	NC_009973	CGCTG	2	10	324538	324547	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
62	NC_009973	CATAG	2	10	329930	329939	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_009973	CGCGC	2	10	334813	334822	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
64	NC_009973	TCTGT	2	10	336889	336898	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.