MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 chromosome

Total Repeats: 15226

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009972	GTG	2	6	416218	416223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_009972	AGC	2	6	416249	416254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_009972	AGC	2	6	416301	416306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_009972	GACGAT	2	12	416361	416372	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1005	NC_009972	TCA	2	6	416391	416396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_009972	ATATT	2	10	416432	416441	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_009972	TAC	2	6	416478	416483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_009972	TGTA	2	8	416488	416495	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_009972	CCA	2	6	416512	416517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_009972	CTG	2	6	416518	416523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_009972	ATG	2	6	416536	416541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_009972	TTG	2	6	416542	416547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_009972	GCCA	2	8	416564	416571	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_009972	GCG	2	6	416572	416577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_009972	TGGAA	2	10	416683	416692	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_009972	TTATT	2	10	416720	416729	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_009972	TGA	2	6	416733	416738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_009972	CCG	2	6	416755	416760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_009972	TAT	2	6	416803	416808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_009972	GTT	3	9	416809	416817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_009972	CAA	2	6	416819	416824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_009972	CTAT	2	8	416853	416860	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1023	NC_009972	CAA	2	6	416887	416892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_009972	ACC	3	9	416941	416949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_009972	AAC	2	6	417028	417033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_009972	TGG	2	6	417078	417083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_009972	GAT	2	6	417117	417122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_009972	TGA	3	9	417135	417143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_009972	GGT	2	6	417229	417234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_009972	GAT	2	6	417268	417273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_009972	TGG	2	6	417285	417290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_009972	TG	3	6	417317	417322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_009972	ATGAGC	2	12	417352	417363	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1034	NC_009972	AAT	2	6	417391	417396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_009972	GGT	2	6	417397	417402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_009972	TGGA	2	8	417503	417510	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_009972	TCT	2	6	417539	417544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_009972	ATCA	2	8	417549	417556	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1039	NC_009972	TGGC	2	8	417569	417576	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1040	NC_009972	GTC	2	6	417752	417757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_009972	CGA	2	6	417852	417857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_009972	TGA	2	6	417876	417881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_009972	CAAC	2	8	417896	417903	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_009972	CCAA	2	8	417919	417926	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_009972	CAAC	2	8	417980	417987	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1046	NC_009972	CCAA	2	8	417991	417998	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1047	NC_009972	ACGGTT	2	12	418006	418017	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1048	NC_009972	ACG	2	6	418066	418071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_009972	TCA	2	6	418114	418119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_009972	T	8	8	418158	418165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_009972	ACC	2	6	418251	418256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_009972	TACAA	2	10	418296	418305	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1053	NC_009972	GCA	2	6	418306	418311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_009972	CT	3	6	418319	418324	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_009972	TAA	2	6	419453	419458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_009972	GCT	2	6	419516	419521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_009972	TTG	2	6	420682	420687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_009972	AGG	2	6	420691	420696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_009972	CCCTGC	2	12	421669	421680	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_009972	CTG	2	6	421698	421703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_009972	GTG	2	6	421817	421822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_009972	TAA	2	6	421838	421843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_009972	CTA	2	6	423563	423568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_009972	T	6	6	424182	424187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_009972	TCA	2	6	424191	424196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_009972	TAGC	2	8	424197	424204	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1067	NC_009972	CAT	2	6	424844	424849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_009972	TGG	2	6	424874	424879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_009972	GCC	2	6	424957	424962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1070	NC_009972	AAC	2	6	425000	425005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_009972	ATG	2	6	425016	425021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_009972	GCA	2	6	425051	425056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_009972	AGC	2	6	425071	425076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_009972	T	6	6	425105	425110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_009972	TTC	2	6	426579	426584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_009972	AAT	2	6	426593	426598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1078	NC_009972	CT	4	8	430773	430780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1079	NC_009972	TC	3	6	430781	430786	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1080	NC_009972	TG	3	6	431830	431835	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_009972	AAT	2	6	431872	431877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_009972	GAC	2	6	431879	431884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_009972	ATC	2	6	431886	431891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_009972	TGG	2	6	432910	432915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_009972	A	6	6	433009	433014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_009972	GCTA	2	8	433039	433046	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1087	NC_009972	TGT	2	6	434391	434396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_009972	TGA	2	6	434450	434455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_009972	CCT	2	6	435320	435325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_009972	ATT	2	6	435332	435337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_009972	TGA	2	6	438535	438540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_009972	AACC	2	8	438552	438559	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1093	NC_009972	GCT	2	6	438614	438619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1095	NC_009972	A	6	6	438699	438704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_009972	CCA	2	6	438747	438752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_009972	ATT	2	6	439075	439080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_009972	CT	3	6	439085	439090	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_009972	AC	4	8	439103	439110	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_009972	GAA	2	6	439171	439176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_009972	CTATA	2	10	439233	439242	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1102	NC_009972	ACTGTA	2	12	439251	439262	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1103	NC_009972	CGTGG	2	10	439275	439284	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1104	NC_009972	AGC	2	6	439312	439317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_009972	TGG	2	6	440558	440563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_009972	CT	3	6	440679	440684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_009972	AGGCG	2	10	440690	440699	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1108	NC_009972	CAA	2	6	440730	440735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_009972	AGGCG	2	10	440795	440804	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1110	NC_009972	CGCC	2	8	440842	440849	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1111	NC_009972	CTC	2	6	440935	440940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_009972	CGC	2	6	444259	444264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_009972	TCTA	2	8	444278	444285	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1114	NC_009972	ATT	2	6	444286	444291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_009972	CAA	2	6	444304	444309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_009972	A	6	6	451111	451116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_009972	CAG	2	6	451117	451122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_009972	CTC	2	6	451198	451203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_009972	TCT	2	6	451216	451221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_009972	ATA	2	6	451308	451313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_009972	T	6	6	451366	451371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_009972	ATT	2	6	451396	451401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_009972	ACA	2	6	451416	451421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_009972	AGG	2	6	453113	453118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_009972	GGTT	2	8	453671	453678	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_009972	TCAC	2	8	455297	455304	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_009972	ATT	2	6	455380	455385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_009972	AAC	2	6	456097	456102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_009972	GGA	2	6	456115	456120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_009972	CGAGG	2	10	456382	456391	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1131	NC_009972	G	6	6	456390	456395	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_009972	CGCC	2	8	456417	456424	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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1134	NC_009972	CAA	2	6	456469	456474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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