MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 chromosome

Total Repeats: 15226

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_009972	AT	3	6	2505689	2505694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_009972	GTC	2	6	2505695	2505700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_009972	TA	3	6	2505705	2505710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_009972	AG	3	6	2505803	2505808	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_009972	TCAA	2	8	2505853	2505860	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6006	NC_009972	CCA	2	6	2505945	2505950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6007	NC_009972	ATTG	2	8	2505992	2505999	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_009972	CGT	2	6	2506014	2506019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_009972	AAT	2	6	2506045	2506050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_009972	TAG	2	6	2507418	2507423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_009972	GTC	2	6	2507425	2507430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_009972	CAC	2	6	2508779	2508784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6013	NC_009972	ACC	2	6	2508856	2508861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6014	NC_009972	CTTG	2	8	2508928	2508935	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6015	NC_009972	AAT	2	6	2508971	2508976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_009972	CGTGGT	2	12	2508998	2509009	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6017	NC_009972	T	6	6	2509012	2509017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_009972	GTCA	2	8	2509059	2509066	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6019	NC_009972	AGC	2	6	2509167	2509172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_009972	ACAA	2	8	2509206	2509213	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6021	NC_009972	GGA	2	6	2509229	2509234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_009972	ATG	2	6	2509756	2509761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_009972	CGCA	2	8	2509972	2509979	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6024	NC_009972	GTTG	2	8	2510212	2510219	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_009972	CTG	2	6	2510222	2510227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_009972	GCTG	2	8	2510255	2510262	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6027	NC_009972	TCCT	2	8	2511543	2511550	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6028	NC_009972	ACT	2	6	2511551	2511556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_009972	GGC	2	6	2511558	2511563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_009972	TCC	2	6	2512199	2512204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6031	NC_009972	TTG	2	6	2512218	2512223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_009972	AGTAT	2	10	2512247	2512256	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_009972	CA	3	6	2517595	2517600	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6034	NC_009972	ATAC	2	8	2528248	2528255	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6035	NC_009972	GT	3	6	2528279	2528284	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_009972	ATT	2	6	2528299	2528304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_009972	TAA	2	6	2528313	2528318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_009972	TTG	2	6	2528325	2528330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_009972	CAG	2	6	2528331	2528336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_009972	ATT	3	9	2528358	2528366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_009972	GTA	2	6	2528403	2528408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_009972	A	6	6	2528438	2528443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_009972	TGA	2	6	2528447	2528452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_009972	TGC	2	6	2529458	2529463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_009972	A	6	6	2529471	2529476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_009972	TGC	2	6	2529584	2529589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_009972	GAG	2	6	2529733	2529738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_009972	GGA	2	6	2530329	2530334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_009972	TTG	2	6	2531013	2531018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_009972	CA	3	6	2531061	2531066	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6051	NC_009972	ATC	2	6	2531070	2531075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_009972	ATG	2	6	2531087	2531092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_009972	ATA	2	6	2531118	2531123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_009972	TGAG	2	8	2531158	2531165	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_009972	GGA	2	6	2531172	2531177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_009972	AAG	2	6	2540411	2540416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_009972	CTT	2	6	2540449	2540454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_009972	ATAC	2	8	2540514	2540521	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6059	NC_009972	AGT	2	6	2540539	2540544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_009972	T	6	6	2540562	2540567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_009972	ATT	2	6	2540571	2540576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_009972	AAT	2	6	2540598	2540603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_009972	CGTG	2	8	2540633	2540640	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6064	NC_009972	ATACT	2	10	2540683	2540692	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6065	NC_009972	TC	3	6	2540695	2540700	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6066	NC_009972	ATA	2	6	2541486	2541491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_009972	ACTA	2	8	2542241	2542248	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6068	NC_009972	TGC	2	6	2542255	2542260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_009972	CTG	2	6	2543444	2543449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_009972	ATTG	2	8	2543452	2543459	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_009972	AATC	2	8	2543467	2543474	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6072	NC_009972	GAT	2	6	2543501	2543506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_009972	TTA	2	6	2543523	2543528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_009972	GAT	2	6	2543685	2543690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_009972	GGT	2	6	2543857	2543862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_009972	ATC	2	6	2547848	2547853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6077	NC_009972	TTG	2	6	2547919	2547924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_009972	CAT	2	6	2547979	2547984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_009972	GAT	2	6	2548007	2548012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_009972	TAC	2	6	2549011	2549016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_009972	ATT	2	6	2549050	2549055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_009972	ATA	2	6	2549094	2549099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_009972	A	6	6	2549105	2549110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_009972	CTT	2	6	2549140	2549145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_009972	AAATAA	2	12	2549176	2549187	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_009972	CCT	2	6	2549192	2549197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6087	NC_009972	TAC	2	6	2549227	2549232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_009972	ACAT	2	8	2549261	2549268	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6089	NC_009972	CAAT	2	8	2549271	2549278	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6090	NC_009972	GAT	2	6	2549281	2549286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_009972	TTC	2	6	2549309	2549314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6092	NC_009972	AAG	2	6	2549336	2549341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_009972	CTA	2	6	2549369	2549374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_009972	T	6	6	2549377	2549382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_009972	TGA	2	6	2549453	2549458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_009972	AGAA	2	8	2549504	2549511	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_009972	TAT	2	6	2549541	2549546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_009972	TA	3	6	2549550	2549555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_009972	CTT	2	6	2549592	2549597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_009972	GAT	2	6	2549703	2549708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_009972	TGAT	2	8	2549741	2549748	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_009972	AATC	2	8	2549758	2549765	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6103	NC_009972	AAC	2	6	2549883	2549888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_009972	ATT	2	6	2549934	2549939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_009972	G	7	7	2550034	2550040	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_009972	CT	3	6	2550052	2550057	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6107	NC_009972	ATCA	2	8	2550092	2550099	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6108	NC_009972	TTGC	2	8	2550131	2550138	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6109	NC_009972	TTGCT	2	10	2550149	2550158	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6110	NC_009972	AC	3	6	2550170	2550175	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6111	NC_009972	GAG	2	6	2554699	2554704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_009972	TCAAG	2	10	2554721	2554730	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6113	NC_009972	CGA	2	6	2554780	2554785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_009972	ACA	2	6	2554828	2554833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_009972	CAC	2	6	2554858	2554863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6116	NC_009972	AT	3	6	2554868	2554873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_009972	TC	3	6	2554899	2554904	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6118	NC_009972	TGG	2	6	2554960	2554965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_009972	ATG	2	6	2555005	2555010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_009972	CCTGCA	2	12	2555067	2555078	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6121	NC_009972	AAC	2	6	2555943	2555948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_009972	AGCAC	2	10	2555949	2555958	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6123	NC_009972	GA	3	6	2556124	2556129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_009972	TAA	2	6	2556143	2556148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_009972	GCC	2	6	2556221	2556226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6126	NC_009972	G	6	6	2556273	2556278	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_009972	AT	3	6	2556292	2556297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_009972	GGT	2	6	2556338	2556343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_009972	CG	3	6	2556348	2556353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6131	NC_009972	TGG	2	6	2556515	2556520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6133	NC_009972	GTG	2	6	2556562	2556567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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