MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Haemophilus influenzae PittGG chromosome

Total Repeats: 1550

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009567	CAAT	2	8	12	19	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009567	AATG	2	8	124	131	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009567	GAGC	2	8	192	199	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009567	TCTA	2	8	1208	1215	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009567	TCTA	2	8	1290	1297	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009567	ATTT	2	8	1307	1314	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009567	ATTA	2	8	1499	1506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009567	ATAA	2	8	2701	2708	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009567	TTTA	2	8	2738	2745	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009567	TAAA	2	8	5920	5927	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009567	GAAC	2	8	6202	6209	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009567	GACG	2	8	6479	6486	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009567	GATT	2	8	6943	6950	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009567	AGTG	2	8	7090	7097	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009567	TTTG	2	8	15941	15948	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009567	TAAA	2	8	27488	27495	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009567	TTTA	2	8	34069	34076	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009567	TAGA	2	8	35355	35362	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009567	ATAA	2	8	35872	35879	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009567	TAAA	2	8	35944	35951	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009567	TTTC	2	8	36036	36043	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009567	AAAG	2	8	36111	36118	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009567	AGCA	2	8	38687	38694	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009567	ATTT	2	8	39833	39840	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009567	AAGA	2	8	40076	40083	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009567	CTGC	2	8	40284	40291	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009567	TGCA	2	8	40690	40697	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009567	TTGG	2	8	40875	40882	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009567	AGTT	2	8	41075	41082	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009567	TTTG	2	8	44748	44755	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009567	GATC	2	8	53628	53635	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009567	TTTG	2	8	54041	54048	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009567	ATTT	2	8	57787	57794	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009567	GAAT	2	8	58930	58937	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009567	AACC	2	8	59138	59145	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009567	TTAT	2	8	59262	59269	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009567	TGAC	2	8	59666	59673	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009567	TTTA	2	8	59709	59716	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009567	GTTT	2	8	61777	61784	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009567	ACTG	2	8	61835	61842	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009567	TAAA	2	8	62125	62132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009567	ATTT	2	8	65449	65456	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009567	ATTT	2	8	65463	65470	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009567	CCCT	2	8	66240	66247	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_009567	GTTG	2	8	70458	70465	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009567	CCAA	2	8	70600	70607	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009567	TTTA	2	8	71515	71522	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009567	TTTA	2	8	71566	71573	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009567	AAAC	2	8	71612	71619	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009567	CCTC	2	8	71710	71717	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_009567	GCTG	2	8	71790	71797	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009567	TTTA	2	8	71900	71907	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009567	GATT	2	8	74461	74468	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009567	TTGA	2	8	74519	74526	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009567	CGTT	2	8	74644	74651	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_009567	TTGA	2	8	74785	74792	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009567	TTTC	2	8	75081	75088	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009567	TTTA	2	8	75177	75184	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009567	TTGG	2	8	75236	75243	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009567	TGGC	2	8	75246	75253	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009567	AATG	2	8	75763	75770	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009567	GATT	2	8	76184	76191	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009567	TGAT	2	8	83663	83670	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009567	CGTG	2	8	83680	83687	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009567	TTCA	2	8	86361	86368	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009567	TTTA	2	8	89500	89507	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009567	AAAT	2	8	89702	89709	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009567	TTAC	2	8	89770	89777	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009567	AACC	2	8	89822	89829	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_009567	ATTT	2	8	93903	93910	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009567	TAAA	2	8	98948	98955	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009567	TTTA	2	8	99445	99452	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009567	AATG	2	8	100382	100389	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009567	TGTT	2	8	100708	100715	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009567	GTTG	2	8	101310	101317	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009567	GTTA	2	8	101822	101829	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009567	AGTA	2	8	102621	102628	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009567	TTTG	2	8	102645	102652	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009567	AATT	2	8	102664	102671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009567	AAAG	2	8	105698	105705	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009567	TGTA	2	8	106443	106450	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009567	TTGG	2	8	106493	106500	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009567	GACA	2	8	106719	106726	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009567	TTTA	2	8	107019	107026	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009567	GTGC	2	8	107177	107184	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_009567	AAGG	2	8	112042	112049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009567	CTTA	2	8	113099	113106	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_009567	TATT	2	8	113200	113207	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009567	ATTT	2	8	115527	115534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009567	ATTA	2	8	118302	118309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009567	CCCG	2	8	123204	123211	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
92	NC_009567	ATTA	2	8	123392	123399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009567	AATT	2	8	123728	123735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009567	TTTA	2	8	123754	123761	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009567	TGAT	2	8	123814	123821	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009567	AATT	2	8	129914	129921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009567	ATTA	2	8	130121	130128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009567	ATCA	2	8	130216	130223	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_009567	TTTA	2	8	131272	131279	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009567	TTGC	2	8	131382	131389	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_009567	ATAA	2	8	131518	131525	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009567	ATAA	2	8	139999	140006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009567	TATT	2	8	143670	143677	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009567	TATT	2	8	144356	144363	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009567	TAAT	2	8	146350	146357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009567	ATTC	2	8	147053	147060	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_009567	CAAA	2	8	150726	150733	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_009567	TAAT	2	8	151095	151102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009567	CCCG	2	8	151736	151743	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
110	NC_009567	TAGC	2	8	156369	156376	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_009567	TAAA	2	8	156425	156432	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009567	ATTT	2	8	157776	157783	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009567	TAAA	2	8	157854	157861	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009567	AAAG	2	8	160010	160017	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009567	TTAA	2	8	165629	165636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009567	GAAA	2	8	165670	165677	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009567	AAAT	2	8	165840	165847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009567	ACTC	2	8	166477	166484	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_009567	AAAG	2	8	167191	167198	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009567	ACAG	2	8	167372	167379	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_009567	GACA	2	8	167435	167442	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_009567	ATTT	2	8	167975	167982	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009567	AGAC	2	8	169097	169104	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_009567	CAAA	2	8	171402	171409	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_009567	TTTA	2	8	173509	173516	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009567	TTAA	2	8	174472	174479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009567	GTCT	2	8	174498	174505	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_009567	AATT	2	8	176315	176322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009567	TTGC	2	8	176355	176362	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_009567	TCCA	2	8	179273	179280	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_009567	TATT	2	8	189551	189558	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009567	CTTT	2	8	189605	189612	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_009567	TGAA	2	8	192682	192689	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009567	TAAA	2	8	199970	199977	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009567	AACA	2	8	200048	200055	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_009567	TAAA	2	8	200063	200070	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009567	ATTT	2	8	200080	200087	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009567	TAAA	2	8	200090	200097	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009567	TTTC	2	8	201669	201676	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_009567	GTTT	2	8	202018	202025	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009567	CTTT	2	8	202229	202236	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_009567	ATTA	2	8	202886	202893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009567	GCTT	2	8	203776	203783	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_009567	ACCT	2	8	207122	207129	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_009567	TAAA	2	8	208784	208791	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009567	ATCA	2	8	209079	209086	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_009567	ATTA	2	8	210153	210160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009567	ATAA	2	8	210449	210456	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009567	TTTA	2	8	212044	212051	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009567	TGAT	2	8	215271	215278	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009567	CATT	2	8	217301	217308	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_009567	TCGC	2	8	218734	218741	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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