MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haemophilus influenzae PittGG chromosome

Total Repeats: 10421

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009567	CAAT	2	8	12	19	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009567	ATT	2	6	28	33	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009567	ACTTCC	2	12	36	47	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009567	TAAAAA	2	12	48	59	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009567	AATG	2	8	124	131	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009567	T	6	6	153	158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009567	GAGC	2	8	192	199	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009567	A	7	7	300	306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009567	GTT	2	6	350	355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009567	T	6	6	1169	1174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009567	AT	4	8	1194	1201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009567	TCTA	2	8	1208	1215	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009567	TCTA	2	8	1290	1297	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009567	ATTT	2	8	1307	1314	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009567	T	6	6	1326	1331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009567	AAT	2	6	1359	1364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009567	GAT	2	6	1369	1374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009567	TAA	2	6	1378	1383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009567	TTA	2	6	1455	1460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009567	AT	3	6	1475	1480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009567	AC	3	6	1492	1497	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009567	ATTA	2	8	1499	1506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009567	TTA	2	6	1527	1532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009567	CTT	2	6	2285	2290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009567	GCT	2	6	2688	2693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009567	ATAA	2	8	2701	2708	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009567	TAA	2	6	2725	2730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009567	TTTA	2	8	2738	2745	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009567	TC	3	6	2835	2840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009567	ATT	2	6	2897	2902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009567	AAT	2	6	4585	4590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009567	TTA	2	6	4620	4625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009567	A	6	6	4648	4653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009567	TAA	2	6	5755	5760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009567	GTT	2	6	5777	5782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009567	ATA	2	6	5863	5868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009567	TAAA	2	8	5920	5927	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009567	GTT	2	6	6002	6007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009567	ACT	2	6	6037	6042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009567	GC	3	6	6127	6132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009567	CCA	2	6	6149	6154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_009567	CCA	2	6	6169	6174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_009567	GC	3	6	6196	6201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009567	GAAC	2	8	6202	6209	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009567	GAA	2	6	6229	6234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009567	TCA	2	6	6235	6240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009567	A	6	6	6243	6248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009567	ATT	2	6	6250	6255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009567	T	7	7	6254	6260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009567	CAT	2	6	6370	6375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009567	CTG	2	6	6384	6389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009567	CTAAA	2	10	6396	6405	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_009567	AGT	2	6	6463	6468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009567	GACG	2	8	6479	6486	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_009567	T	6	6	6528	6533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009567	T	6	6	6605	6610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009567	TCA	2	6	6703	6708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009567	TAT	2	6	6845	6850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009567	CTT	2	6	6904	6909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009567	GATT	2	8	6943	6950	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009567	ATG	2	6	7057	7062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009567	AGTG	2	8	7090	7097	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009567	TGG	2	6	7098	7103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009567	T	7	7	7121	7127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009567	GATTT	2	10	7135	7144	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009567	A	6	6	7235	7240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009567	A	6	6	7247	7252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009567	TTG	2	6	7295	7300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009567	AAT	2	6	8752	8757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009567	A	7	7	8806	8812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009567	T	6	6	8885	8890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009567	ACT	2	6	8953	8958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009567	CA	3	6	8960	8965	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_009567	CAC	2	6	8993	8998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_009567	TGG	2	6	9006	9011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009567	AG	3	6	9074	9079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009567	TA	3	6	9112	9117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009567	CA	3	6	9122	9127	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_009567	A	6	6	9130	9135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009567	CTT	2	6	9141	9146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009567	T	6	6	9145	9150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009567	GTA	2	6	9171	9176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009567	CA	3	6	9224	9229	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_009567	ACA	2	6	9962	9967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_009567	GC	3	6	10017	10022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_009567	CA	3	6	11663	11668	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_009567	GAC	2	6	11733	11738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009567	TCC	2	6	12190	12195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_009567	T	6	6	12229	12234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009567	GTTAT	2	10	12242	12251	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009567	ATG	2	6	12290	12295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009567	TAA	2	6	12521	12526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009567	TTTG	2	8	15941	15948	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009567	T	6	6	16025	16030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009567	T	6	6	16407	16412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009567	T	6	6	16990	16995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009567	C	6	6	17006	17011	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
98	NC_009567	CCT	2	6	17017	17022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_009567	CT	3	6	17076	17081	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_009567	AG	3	6	17086	17091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009567	ACA	2	6	17093	17098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_009567	A	7	7	17115	17121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009567	GTT	2	6	17127	17132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009567	TTG	2	6	17137	17142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009567	TAA	2	6	17145	17150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009567	ATTTT	2	10	21145	21154	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009567	TCA	2	6	25300	25305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009567	TA	3	6	25335	25340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009567	A	6	6	25340	25345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009567	GCA	2	6	27460	27465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009567	TAAA	2	8	27488	27495	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009567	AAT	2	6	29939	29944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009567	T	7	7	34058	34064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009567	TTTA	2	8	34069	34076	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009567	ATT	2	6	34081	34086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009567	AG	3	6	34106	34111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009567	A	7	7	34153	34159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009567	ACA	2	6	34218	34223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_009567	AG	3	6	34234	34239	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009567	TAGA	2	8	35355	35362	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009567	T	6	6	35386	35391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009567	ATA	2	6	35863	35868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009567	ATAA	2	8	35872	35879	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009567	T	7	7	35892	35898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009567	TAAA	2	8	35944	35951	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009567	A	6	6	35949	35954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009567	T	6	6	35955	35960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009567	TAA	2	6	35985	35990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009567	A	6	6	35997	36002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009567	ATA	2	6	36023	36028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009567	TTTC	2	8	36036	36043	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_009567	AAAG	2	8	36111	36118	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009567	AG	3	6	37386	37391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009567	T	7	7	37406	37412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009567	TCT	2	6	38668	38673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_009567	AGCA	2	8	38687	38694	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_009567	T	7	7	39210	39216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009567	TTG	2	6	39228	39233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009567	TAT	2	6	39258	39263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009567	T	6	6	39334	39339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009567	TTG	2	6	39373	39378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009567	TGA	2	6	39408	39413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009567	ATT	2	6	39452	39457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009567	A	6	6	39476	39481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009567	ATT	2	6	39508	39513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009567	CAA	2	6	39641	39646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_009567	GAT	2	6	39653	39658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009567	ATT	2	6	39690	39695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009567	TGG	2	6	39730	39735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009567	ATT	2	6	39789	39794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009567	ATT	2	6	39807	39812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_009567	TGA	2	6	39826	39831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_009567	ATTT	2	8	39833	39840	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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