MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haemophilus influenzae PittGG chromosome

Total Repeats: 10421

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009567	AAT	2	6	102413	102418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_009567	CA	3	6	102426	102431	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
503	NC_009567	AATGT	2	10	102440	102449	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
504	NC_009567	AGTA	2	8	102621	102628	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
505	NC_009567	TTTG	2	8	102645	102652	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
506	NC_009567	CAT	2	6	102654	102659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_009567	AATT	2	8	102664	102671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_009567	GCC	2	6	102694	102699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_009567	GTC	2	6	102732	102737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_009567	GGT	2	6	102740	102745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
511	NC_009567	T	6	6	102848	102853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_009567	GTT	2	6	102947	102952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_009567	CAA	2	6	102971	102976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_009567	CAA	2	6	103011	103016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_009567	AC	3	6	103056	103061	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
516	NC_009567	ATC	2	6	103084	103089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_009567	GCG	2	6	103119	103124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_009567	T	8	8	103161	103168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_009567	TTG	2	6	103170	103175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_009567	TAT	2	6	103202	103207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_009567	AGA	2	6	103271	103276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_009567	A	6	6	103291	103296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_009567	T	6	6	103316	103321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_009567	TAA	2	6	104687	104692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_009567	AAAG	2	8	105698	105705	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
526	NC_009567	TAA	2	6	105764	105769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_009567	TTA	2	6	105780	105785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_009567	A	6	6	105813	105818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_009567	T	6	6	105842	105847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_009567	GAC	2	6	105882	105887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_009567	AT	3	6	105925	105930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_009567	TGG	2	6	105957	105962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_009567	T	6	6	105988	105993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_009567	TCA	2	6	106012	106017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_009567	T	6	6	106079	106084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_009567	GTT	2	6	106132	106137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_009567	GTT	2	6	106143	106148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_009567	GATTTA	2	12	106189	106200	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_009567	ATT	2	6	106246	106251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_009567	GAA	2	6	106390	106395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_009567	TGTA	2	8	106443	106450	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
542	NC_009567	AG	3	6	106452	106457	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
543	NC_009567	GAA	2	6	106459	106464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_009567	TTA	2	6	106480	106485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_009567	TTGG	2	8	106493	106500	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
546	NC_009567	TAT	2	6	106518	106523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_009567	TAA	2	6	106538	106543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_009567	GAAAT	2	10	106613	106622	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
549	NC_009567	TAG	2	6	106649	106654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_009567	T	6	6	106666	106671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_009567	GACA	2	8	106719	106726	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
552	NC_009567	T	6	6	106849	106854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_009567	TCG	2	6	106888	106893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_009567	TTG	2	6	106995	107000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_009567	TTTA	2	8	107019	107026	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_009567	CAA	2	6	107045	107050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_009567	AAG	2	6	107067	107072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_009567	ATG	2	6	107076	107081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_009567	ATT	2	6	107083	107088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_009567	TGA	2	6	107098	107103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_009567	ATT	2	6	107110	107115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_009567	GTGC	2	8	107177	107184	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
563	NC_009567	CGT	2	6	107201	107206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_009567	GAT	2	6	107300	107305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_009567	GAA	2	6	107426	107431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_009567	AAGG	2	8	112042	112049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
567	NC_009567	CAGTTT	2	12	113003	113014	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
568	NC_009567	A	7	7	113032	113038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_009567	ATT	2	6	113043	113048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_009567	CTTA	2	8	113099	113106	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
571	NC_009567	T	7	7	113167	113173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_009567	TATT	2	8	113200	113207	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_009567	AG	3	6	113842	113847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
574	NC_009567	TAA	2	6	115311	115316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_009567	T	7	7	115325	115331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_009567	GTT	2	6	115332	115337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_009567	GAA	2	6	115345	115350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_009567	TG	3	6	115521	115526	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
579	NC_009567	ATTT	2	8	115527	115534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_009567	GCA	2	6	115619	115624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_009567	CCT	2	6	116156	116161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_009567	AT	4	8	116166	116173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_009567	AT	4	8	116206	116213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_009567	ATT	3	9	116224	116232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_009567	TTA	2	6	116240	116245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_009567	A	7	7	117008	117014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_009567	A	8	8	117031	117038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_009567	ATT	2	6	117042	117047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_009567	ATT	2	6	117070	117075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_009567	A	7	7	117103	117109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_009567	T	6	6	117117	117122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_009567	ATTA	2	8	118302	118309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_009567	CCCG	2	8	123204	123211	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
594	NC_009567	ATT	2	6	123252	123257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_009567	A	6	6	123325	123330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_009567	A	7	7	123356	123362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_009567	ATTA	2	8	123392	123399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_009567	CT	3	6	123407	123412	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
599	NC_009567	A	6	6	123487	123492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_009567	TTA	2	6	123571	123576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_009567	TAT	2	6	123621	123626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_009567	ATT	2	6	123675	123680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_009567	CT	3	6	123685	123690	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
604	NC_009567	AATT	2	8	123728	123735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_009567	TTTA	2	8	123754	123761	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_009567	GCA	2	6	123792	123797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_009567	TGAT	2	8	123814	123821	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
608	NC_009567	ATA	2	6	123860	123865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_009567	T	6	6	123900	123905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_009567	CCA	2	6	123929	123934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_009567	TAC	2	6	123955	123960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_009567	AGTGA	2	10	125991	126000	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
613	NC_009567	ATA	2	6	126004	126009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_009567	ACTTTT	2	12	126022	126033	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
615	NC_009567	TAA	2	6	126034	126039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_009567	GA	3	6	126040	126045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
617	NC_009567	ATT	2	6	128646	128651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_009567	TTA	2	6	128667	128672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_009567	AAT	2	6	129790	129795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_009567	TGA	2	6	129806	129811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_009567	AGT	2	6	129847	129852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_009567	T	7	7	129884	129890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_009567	AATT	2	8	129914	129921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_009567	TAA	2	6	129940	129945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_009567	AGG	2	6	129998	130003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
626	NC_009567	ATTTA	2	10	130064	130073	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_009567	ATA	2	6	130090	130095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_009567	T	6	6	130100	130105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_009567	ATTA	2	8	130121	130128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_009567	A	7	7	130149	130155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_009567	ATCA	2	8	130216	130223	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
632	NC_009567	TTTA	2	8	131272	131279	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_009567	AAT	2	6	131281	131286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_009567	ATT	2	6	131298	131303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_009567	TTGC	2	8	131382	131389	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
636	NC_009567	A	6	6	131421	131426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_009567	A	6	6	131450	131455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_009567	ATAA	2	8	131518	131525	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_009567	GAA	2	6	133086	133091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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641	NC_009567	AAG	2	6	135195	135200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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