MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Haemophilus influenzae PittEE chromosome

Total Repeats: 1212

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009566	TTTC	2	8	330	337	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009566	TAGT	2	8	702	709	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009566	TATT	2	8	750	757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009566	AATC	2	8	1367	1374	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009566	TGTA	2	8	4527	4534	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009566	TGTT	2	8	5156	5163	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009566	TGAT	2	8	5187	5194	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009566	TTGG	2	8	5232	5239	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009566	ATTT	2	8	5644	5651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009566	ATTA	2	8	5772	5779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009566	TTAC	2	8	5851	5858	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009566	AAAG	2	8	6245	6252	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009566	TTTC	2	8	6564	6571	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009566	TTGT	2	8	6789	6796	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009566	TTTA	2	8	6916	6923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009566	CTTT	2	8	8258	8265	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009566	GATA	2	8	10440	10447	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009566	CTTT	2	8	10471	10478	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009566	GATA	2	8	10479	10486	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009566	ATAA	2	8	10557	10564	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009566	TCAA	2	8	11057	11064	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009566	ATAA	2	8	11153	11160	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009566	AATA	2	8	11482	11489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009566	TAAG	2	8	13956	13963	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009566	TAAA	2	8	14635	14642	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009566	AATG	2	8	20667	20674	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009566	TCTA	2	8	20705	20712	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009566	AATT	2	8	21863	21870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009566	AGCC	2	8	24014	24021	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009566	TTTA	2	8	26484	26491	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009566	CTTT	2	8	32489	32496	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009566	TAAA	2	8	32534	32541	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009566	ATTT	2	8	35662	35669	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009566	TAAA	2	8	43745	43752	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009566	TTTA	2	8	43835	43842	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009566	ATAA	2	8	54381	54388	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009566	GATA	2	8	57371	57378	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009566	TAAC	2	8	57497	57504	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009566	AATA	2	8	58995	59002	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009566	CTAA	2	8	59092	59099	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009566	TTGA	2	8	66870	66877	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009566	TTCT	2	8	66917	66924	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009566	ATCA	2	8	66986	66993	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009566	CAAA	2	8	67021	67028	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009566	CGGA	2	8	67069	67076	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009566	TCTT	2	8	70783	70790	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009566	TTAA	2	8	70808	70815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009566	ATTT	2	8	70977	70984	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009566	AAAC	2	8	71319	71326	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009566	ACCA	2	8	71384	71391	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009566	CAGA	2	8	71471	71478	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009566	CATT	2	8	77938	77945	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009566	GATT	2	8	77980	77987	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009566	AATC	2	8	77991	77998	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_009566	AGTT	2	8	78176	78183	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009566	AGAA	2	8	82293	82300	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009566	CAAA	2	8	89545	89552	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009566	TAAA	2	8	90783	90790	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009566	ATAA	2	8	102996	103003	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009566	GATT	2	8	103865	103872	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009566	GTAA	2	8	104458	104465	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009566	AATA	2	8	105286	105293	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009566	ATTA	2	8	114848	114855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009566	GTTT	2	8	114902	114909	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009566	CAAA	2	8	116330	116337	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009566	TTAT	2	8	116376	116383	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009566	TCAT	2	8	121544	121551	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_009566	TATT	2	8	123971	123978	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009566	GCTC	2	8	124103	124110	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_009566	TGCG	2	8	129237	129244	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_009566	TCTT	2	8	135497	135504	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009566	TTAT	2	8	139071	139078	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009566	ACTA	2	8	141491	141498	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009566	CTTT	2	8	141995	142002	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_009566	TTTC	2	8	146280	146287	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009566	ATTT	2	8	150161	150168	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009566	TTTA	2	8	160412	160419	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009566	AAAC	2	8	160786	160793	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009566	ATAA	2	8	160805	160812	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009566	AAAT	2	8	163302	163309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009566	AAGC	2	8	163594	163601	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_009566	AGAA	2	8	163645	163652	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009566	TGCA	2	8	164173	164180	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009566	AAAT	2	8	164640	164647	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009566	AACC	2	8	164660	164667	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_009566	ATTT	2	8	179253	179260	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009566	ATTA	2	8	179385	179392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009566	CAAT	2	8	180839	180846	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_009566	ATTC	2	8	183463	183470	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_009566	TAAA	2	8	191121	191128	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009566	AAGT	2	8	193314	193321	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009566	TCTA	2	8	198533	198540	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_009566	AGCA	7	28	198852	198879	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_009566	ATTA	2	8	198992	198999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009566	TATT	2	8	199057	199064	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009566	TTTA	2	8	199084	199091	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009566	TATT	2	8	199265	199272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009566	ACAA	2	8	199316	199323	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_009566	CAAT	2	8	199350	199357	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_009566	TGAA	2	8	199510	199517	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009566	ATTT	2	8	199580	199587	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009566	ATAG	2	8	206500	206507	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009566	GAAT	2	8	211272	211279	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009566	GTCG	2	8	211472	211479	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_009566	CTTT	2	8	212115	212122	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_009566	AATT	2	8	212374	212381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009566	AATA	2	8	215526	215533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009566	TAAA	2	8	226379	226386	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009566	ATCT	2	8	226491	226498	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_009566	ATAA	2	8	230045	230052	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009566	TAAT	2	8	237891	237898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009566	ATGA	3	12	244218	244229	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009566	AGCA	2	8	252542	252549	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_009566	ATTT	2	8	257037	257044	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009566	ATCT	2	8	257109	257116	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_009566	AAAT	2	8	258435	258442	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009566	TAAT	2	8	258805	258812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009566	TTGT	2	8	259296	259303	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009566	ATTA	2	8	261837	261844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009566	ATTC	2	8	263588	263595	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_009566	CTAA	2	8	263839	263846	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_009566	AGGT	2	8	264551	264558	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009566	CCAT	2	8	264589	264596	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_009566	TAAT	2	8	264779	264786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009566	CTTT	2	8	264970	264977	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_009566	GGTA	2	8	265184	265191	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009566	TTTG	2	8	265267	265274	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009566	AAGT	2	8	265482	265489	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009566	AATA	2	8	265900	265907	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009566	ATAA	2	8	265936	265943	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009566	ATCT	2	8	266853	266860	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_009566	GCAA	2	8	268101	268108	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_009566	GATT	2	8	269545	269552	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009566	ATAA	2	8	269560	269567	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009566	TAAA	2	8	272344	272351	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009566	GATT	2	8	272730	272737	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009566	TCAA	2	8	272750	272757	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_009566	GCTT	2	8	272771	272778	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_009566	TAAG	2	8	272800	272807	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009566	CTTT	2	8	274643	274650	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_009566	ATTT	2	8	274710	274717	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009566	AATC	2	8	276265	276272	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_009566	TTAA	2	8	276813	276820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009566	ATTA	2	8	280359	280366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009566	CAAT	2	8	280383	280390	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_009566	GAAG	2	8	283376	283383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009566	TTTA	2	8	286067	286074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009566	AAAT	2	8	288859	288866	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009566	ACAA	2	8	289798	289805	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_009566	TTAT	2	8	295105	295112	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009566	CAAT	2	8	295937	295944	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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153	NC_009566	AAAT	2	8	303159	303166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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