MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haemophilus influenzae PittEE chromosome

Total Repeats: 8294

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009566	TTA	2	6	295029	295034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_009566	TAA	3	9	295040	295048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_009566	A	6	6	295047	295052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_009566	T	7	7	295063	295069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_009566	TTAT	2	8	295105	295112	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_009566	A	6	6	295892	295897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_009566	CTT	2	6	295898	295903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_009566	ACCTTA	2	12	295905	295916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_009566	CAAT	2	8	295937	295944	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1010	NC_009566	AAC	2	6	295947	295952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_009566	TGG	2	6	296193	296198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_009566	TCA	2	6	296229	296234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_009566	AAC	2	6	296239	296244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_009566	TGG	2	6	296485	296490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_009566	TCA	2	6	296521	296526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_009566	AAC	2	6	296531	296536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_009566	ATTT	2	8	298906	298913	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_009566	GTC	2	6	298929	298934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_009566	T	7	7	298945	298951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_009566	A	7	7	298979	298985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_009566	CATAA	2	10	299040	299049	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1022	NC_009566	AAT	2	6	301774	301779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_009566	ATT	2	6	301839	301844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_009566	AAAT	2	8	303159	303166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_009566	TAT	2	6	303173	303178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_009566	AGT	2	6	303179	303184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1028	NC_009566	TGT	2	6	303246	303251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_009566	TAA	2	6	304497	304502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_009566	A	6	6	304562	304567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_009566	T	6	6	304568	304573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_009566	T	6	6	304606	304611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_009566	TAT	2	6	307660	307665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_009566	AAT	2	6	307673	307678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_009566	TAA	2	6	308462	308467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_009566	AGT	2	6	309840	309845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_009566	CAA	2	6	309882	309887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_009566	ACT	2	6	309896	309901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_009566	AGA	2	6	309917	309922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_009566	TAA	2	6	309934	309939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_009566	A	6	6	309938	309943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_009566	TAAT	2	8	309974	309981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_009566	AATAA	2	10	309992	310001	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_009566	AAAT	2	8	310016	310023	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_009566	TTA	2	6	310800	310805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_009566	TGA	2	6	310816	310821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_009566	AAATA	2	10	310853	310862	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_009566	ATT	2	6	310900	310905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_009566	T	6	6	310908	310913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_009566	AAT	2	6	310929	310934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_009566	A	7	7	310939	310945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_009566	T	6	6	310994	310999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_009566	GCA	2	6	311601	311606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_009566	ACA	2	6	311672	311677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_009566	AT	3	6	314665	314670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_009566	ACGTAA	2	12	314714	314725	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1057	NC_009566	ATT	2	6	314747	314752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_009566	GTG	2	6	314772	314777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1060	NC_009566	ATA	2	6	314850	314855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_009566	TTTA	2	8	314881	314888	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_009566	GTG	2	6	314900	314905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_009566	CCT	2	6	314934	314939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_009566	GTG	2	6	315034	315039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_009566	CCT	2	6	315068	315073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_009566	GTG	2	6	315153	315158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_009566	CCT	2	6	315187	315192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_009566	TGT	2	6	315234	315239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_009566	T	6	6	315329	315334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_009566	GTA	2	6	315355	315360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_009566	GAC	2	6	315365	315370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1073	NC_009566	ATA	2	6	316865	316870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1081	NC_009566	AAAT	2	8	318533	318540	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_009566	TCA	2	6	318546	318551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_009566	CAG	2	6	320415	320420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1089	NC_009566	AAT	2	6	325200	325205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_009566	TAA	2	6	325596	325601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_009566	TAA	2	6	332371	332376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_009566	GAT	2	6	332396	332401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1094	NC_009566	GAT	2	6	332408	332413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_009566	TAA	3	9	332416	332424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1099	NC_009566	A	6	6	332592	332597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_009566	AAC	2	6	332619	332624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_009566	ATT	2	6	332669	332674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_009566	AAT	2	6	332682	332687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_009566	T	6	6	332693	332698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1105	NC_009566	ATT	2	6	332840	332845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_009566	TGT	2	6	332906	332911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_009566	GTTT	2	8	332987	332994	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_009566	TTGG	2	8	333006	333013	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_009566	T	6	6	333037	333042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_009566	AGA	2	6	333079	333084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_009566	ATC	2	6	333227	333232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_009566	AT	3	6	333279	333284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_009566	CGA	2	6	333339	333344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_009566	AAAG	2	8	333417	333424	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_009566	T	6	6	333477	333482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_009566	GTT	2	6	333484	333489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_009566	ATA	2	6	333613	333618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_009566	ACC	2	6	333635	333640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_009566	AAC	2	6	333785	333790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_009566	GATT	2	8	334526	334533	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_009566	TAA	2	6	335125	335130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_009566	ATT	2	6	335132	335137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_009566	A	6	6	335150	335155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_009566	ATA	2	6	335167	335172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_009566	TAA	2	6	336147	336152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_009566	TTA	2	6	336153	336158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_009566	TCT	2	6	336162	336167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_009566	T	6	6	336201	336206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_009566	TCT	2	6	336213	336218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_009566	ATTTTT	2	12	336223	336234	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_009566	A	6	6	336241	336246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_009566	ATA	2	6	336395	336400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_009566	A	6	6	336412	336417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_009566	A	6	6	336474	336479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_009566	GACA	2	8	336487	336494	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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