MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Herminiimonas arsenicoxydans chromosome

Total Repeats: 8388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009138	GCA	2	6	1547929	1547934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_009138	AAC	2	6	1550836	1550841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_009138	AGC	2	6	1551387	1551392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_009138	ACG	2	6	1551397	1551402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_009138	AATC	2	8	1551439	1551446	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4006	NC_009138	TTC	2	6	1551831	1551836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_009138	AAT	2	6	1555840	1555845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_009138	A	6	6	1555891	1555896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_009138	TAT	2	6	1555912	1555917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_009138	AG	3	6	1555946	1555951	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_009138	ATG	2	6	1555953	1555958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_009138	GCC	2	6	1555979	1555984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4013	NC_009138	GAA	2	6	1557482	1557487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_009138	AGG	2	6	1557544	1557549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_009138	AGA	2	6	1557551	1557556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_009138	CTG	2	6	1558499	1558504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_009138	GCA	2	6	1558552	1558557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_009138	ATA	2	6	1560407	1560412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_009138	CCT	2	6	1560424	1560429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4020	NC_009138	GGCT	2	8	1560466	1560473	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4021	NC_009138	CGG	2	6	1560500	1560505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_009138	GCG	2	6	1560524	1560529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_009138	AAT	2	6	1561288	1561293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_009138	TGAA	2	8	1561314	1561321	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_009138	TAA	2	6	1561351	1561356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_009138	CAC	2	6	1562954	1562959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4027	NC_009138	TCC	3	9	1563262	1563270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4028	NC_009138	AAT	2	6	1563300	1563305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_009138	AGC	2	6	1563456	1563461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_009138	ACCG	2	8	1563470	1563477	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4031	NC_009138	GCA	2	6	1563521	1563526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_009138	AAT	2	6	1563565	1563570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_009138	TTG	2	6	1563576	1563581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_009138	CAG	2	6	1565582	1565587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_009138	AG	3	6	1565586	1565591	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_009138	GAA	2	6	1565609	1565614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_009138	GCA	3	9	1565644	1565652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_009138	A	6	6	1565667	1565672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_009138	TCA	2	6	1565678	1565683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_009138	CAG	2	6	1565766	1565771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_009138	CAT	2	6	1565784	1565789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_009138	GCC	2	6	1565878	1565883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4043	NC_009138	TCT	2	6	1566124	1566129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_009138	GGC	2	6	1566139	1566144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_009138	CAC	2	6	1566198	1566203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4046	NC_009138	TTG	2	6	1566264	1566269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_009138	TGC	2	6	1566753	1566758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_009138	CTT	2	6	1566820	1566825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_009138	GGCG	2	8	1566840	1566847	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4050	NC_009138	T	6	6	1566850	1566855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_009138	TGG	2	6	1566921	1566926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_009138	CG	3	6	1566933	1566938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4053	NC_009138	TGC	2	6	1569541	1569546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_009138	TGG	2	6	1569609	1569614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_009138	TCA	2	6	1569640	1569645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_009138	TA	4	8	1569662	1569669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_009138	CACC	2	8	1569672	1569679	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4058	NC_009138	AAG	2	6	1574787	1574792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_009138	ATC	2	6	1574904	1574909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_009138	TCT	2	6	1575278	1575283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_009138	CCA	2	6	1575945	1575950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4062	NC_009138	CAT	2	6	1580754	1580759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_009138	TGG	2	6	1583037	1583042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_009138	TGA	2	6	1583112	1583117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_009138	CAAA	2	8	1583134	1583141	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4066	NC_009138	CCG	2	6	1583838	1583843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4067	NC_009138	CCG	2	6	1583865	1583870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4068	NC_009138	TAG	2	6	1583885	1583890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_009138	TAG	2	6	1583930	1583935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_009138	T	6	6	1587031	1587036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_009138	A	6	6	1587099	1587104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_009138	AT	3	6	1587159	1587164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_009138	TC	3	6	1587165	1587170	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4074	NC_009138	TC	3	6	1587593	1587598	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4075	NC_009138	GTC	2	6	1587625	1587630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_009138	ATC	2	6	1594163	1594168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_009138	ATTGG	2	10	1594238	1594247	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_009138	ATT	2	6	1594700	1594705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_009138	GAG	2	6	1594736	1594741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_009138	A	6	6	1594742	1594747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_009138	GTG	2	6	1594772	1594777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_009138	GTC	2	6	1594784	1594789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_009138	G	6	6	1594853	1594858	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_009138	AAAT	2	8	1594893	1594900	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_009138	TTTG	2	8	1594925	1594932	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_009138	ACA	2	6	1595903	1595908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_009138	AT	3	6	1595910	1595915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_009138	TA	3	6	1595930	1595935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_009138	GCT	2	6	1595971	1595976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_009138	TGT	2	6	1595977	1595982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_009138	TAA	2	6	1596046	1596051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_009138	AGC	2	6	1596069	1596074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_009138	A	7	7	1596088	1596094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_009138	GTA	2	6	1596096	1596101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_009138	A	6	6	1596106	1596111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_009138	GATT	2	8	1596654	1596661	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_009138	ATGC	2	8	1596671	1596678	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4098	NC_009138	TG	3	6	1596717	1596722	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_009138	T	6	6	1596732	1596737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_009138	TGC	2	6	1597846	1597851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_009138	CTG	2	6	1597884	1597889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_009138	ACC	2	6	1597922	1597927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4103	NC_009138	AAAT	2	8	1597999	1598006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_009138	AAG	2	6	1598033	1598038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_009138	GAAAT	2	10	1598061	1598070	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_009138	ACC	2	6	1598078	1598083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4107	NC_009138	TTG	2	6	1598084	1598089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_009138	CA	3	6	1598110	1598115	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4109	NC_009138	TTTA	2	8	1598211	1598218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_009138	G	6	6	1599283	1599288	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_009138	ATC	2	6	1599306	1599311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_009138	GCA	2	6	1599484	1599489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_009138	TCCT	2	8	1599538	1599545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4114	NC_009138	TTA	2	6	1599567	1599572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_009138	CTGCCA	2	12	1599578	1599589	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4116	NC_009138	TCATT	2	10	1599590	1599599	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4117	NC_009138	GC	3	6	1599631	1599636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4118	NC_009138	GCT	2	6	1599663	1599668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_009138	CGC	2	6	1599691	1599696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4120	NC_009138	GAA	2	6	1599715	1599720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_009138	CCA	2	6	1599888	1599893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4122	NC_009138	TTCG	2	8	1599918	1599925	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4123	NC_009138	GC	3	6	1599936	1599941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4124	NC_009138	CG	3	6	1599990	1599995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4125	NC_009138	GTG	2	6	1600019	1600024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_009138	GTC	2	6	1600037	1600042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_009138	TGG	2	6	1600047	1600052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_009138	GCT	2	6	1600060	1600065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_009138	ATT	2	6	1600142	1600147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_009138	CG	3	6	1600205	1600210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4131	NC_009138	TCG	2	6	1600278	1600283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_009138	CGT	2	6	1600327	1600332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_009138	GCA	2	6	1600334	1600339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4134	NC_009138	TTG	2	6	1600419	1600424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_009138	GTG	2	6	1600440	1600445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_009138	GCGT	2	8	1600491	1600498	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4137	NC_009138	CGT	2	6	1600501	1600506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4140	NC_009138	GAA	2	6	1600601	1600606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4141	NC_009138	GCC	2	6	1600628	1600633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4142	NC_009138	AC	3	6	1600683	1600688	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4143	NC_009138	GAA	2	6	1600712	1600717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4144	NC_009138	TGG	2	6	1600833	1600838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4145	NC_009138	GGT	2	6	1600861	1600866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4146	NC_009138	ATG	2	6	1600890	1600895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4151	NC_009138	AG	3	6	1601250	1601255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4154	NC_009138	TA	3	6	1603729	1603734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4161	NC_009138	TAA	2	6	1603959	1603964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4162	NC_009138	T	6	6	1603987	1603992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4163	NC_009138	TG	4	8	1604060	1604067	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4164	NC_009138	CTGC	2	8	1604094	1604101	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4174	NC_009138	TTTC	2	8	1614115	1614122	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4202	NC_009138	TGA	3	9	1635053	1635061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4250	NC_009138	T	6	6	1668648	1668653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4251	NC_009138	TGCA	2	8	1668686	1668693	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4252	NC_009138	GAAT	2	8	1668710	1668717	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4253	NC_009138	TTCA	2	8	1668762	1668769	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4254	NC_009138	CCAG	2	8	1671408	1671415	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4255	NC_009138	TTG	2	6	1671446	1671451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4257	NC_009138	CGG	2	6	1671496	1671501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4258	NC_009138	T	6	6	1671502	1671507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_009138	AAG	2	6	1674352	1674357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4260	NC_009138	TTCG	2	8	1674383	1674390	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4262	NC_009138	T	6	6	1674452	1674457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4263	NC_009138	T	6	6	1674466	1674471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4376	NC_009138	CAA	2	6	1726333	1726338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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