MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Hyperthermus butylicus DSM 5456 chromosome

Total Repeats: 6547

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008818	CTAGA	2	10	852705	852714	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3502	NC_008818	AGG	2	6	852753	852758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_008818	GAA	2	6	852765	852770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_008818	TGA	2	6	852847	852852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_008818	AGC	2	6	854367	854372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_008818	ACG	2	6	854397	854402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_008818	AAGA	2	8	854498	854505	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_008818	TAC	2	6	855455	855460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_008818	AG	3	6	855465	855470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_008818	ATA	2	6	855511	855516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_008818	CTTCA	2	10	855517	855526	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3512	NC_008818	CCG	2	6	858557	858562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3513	NC_008818	AGT	2	6	858592	858597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_008818	CCA	2	6	858630	858635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3515	NC_008818	TGC	2	6	858730	858735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_008818	CTGA	2	8	858745	858752	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3517	NC_008818	TCCC	2	8	859289	859296	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3518	NC_008818	CT	3	6	860284	860289	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3519	NC_008818	CAA	2	6	860318	860323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_008818	AGT	2	6	860423	860428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_008818	ACC	2	6	860511	860516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3522	NC_008818	CTGAAG	2	12	860523	860534	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3523	NC_008818	AGG	3	9	860549	860557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_008818	TTA	2	6	861185	861190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_008818	GGT	2	6	861216	861221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_008818	AAC	2	6	863524	863529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_008818	GAT	2	6	863581	863586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_008818	TAA	2	6	863659	863664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_008818	AAC	2	6	863717	863722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_008818	AC	3	6	863732	863737	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3531	NC_008818	TCT	2	6	863754	863759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_008818	TA	3	6	863899	863904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_008818	AGT	2	6	863919	863924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_008818	TG	3	6	863952	863957	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_008818	GCT	2	6	865241	865246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_008818	TTTA	2	8	865305	865312	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_008818	GTA	2	6	865336	865341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_008818	CAA	2	6	865357	865362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_008818	TTTTAG	2	12	865363	865374	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_008818	GCTA	2	8	865403	865410	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3541	NC_008818	CAG	2	6	865420	865425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_008818	GCT	2	6	865447	865452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_008818	ACA	2	6	867202	867207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_008818	GCA	2	6	867283	867288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_008818	CCT	2	6	867301	867306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3546	NC_008818	TGA	2	6	867315	867320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_008818	CTC	2	6	868529	868534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3548	NC_008818	CTGA	2	8	868659	868666	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3549	NC_008818	TCC	2	6	869599	869604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3550	NC_008818	TCC	2	6	869677	869682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3551	NC_008818	TTC	2	6	869725	869730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_008818	AT	3	6	870354	870359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_008818	TGT	2	6	870373	870378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_008818	TGA	2	6	872755	872760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_008818	AGC	2	6	872771	872776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_008818	ATGCC	2	10	872800	872809	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3557	NC_008818	GATGGC	2	12	872812	872823	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3558	NC_008818	ACG	2	6	872827	872832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_008818	TGC	2	6	872887	872892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_008818	TAA	2	6	872956	872961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_008818	GAG	2	6	872993	872998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_008818	TCA	2	6	873864	873869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_008818	AGT	2	6	873913	873918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_008818	AC	3	6	875285	875290	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3565	NC_008818	C	6	6	875332	875337	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3566	NC_008818	GTG	2	6	876158	876163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_008818	ATAG	2	8	877026	877033	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_008818	TA	3	6	877082	877087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_008818	ACTAG	2	10	877089	877098	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3570	NC_008818	CAC	2	6	878137	878142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3571	NC_008818	GCT	2	6	878156	878161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_008818	AC	3	6	878437	878442	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3573	NC_008818	CCT	2	6	878475	878480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3574	NC_008818	GCCG	2	8	878513	878520	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3575	NC_008818	C	6	6	878539	878544	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3576	NC_008818	TGGG	2	8	878575	878582	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_008818	AAC	2	6	878645	878650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_008818	ATT	2	6	878656	878661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_008818	AAT	2	6	878663	878668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_008818	AT	3	6	878700	878705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_008818	AGA	2	6	878713	878718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_008818	AAT	2	6	878723	878728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_008818	CAA	2	6	878765	878770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_008818	AAT	2	6	878811	878816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_008818	AC	3	6	878849	878854	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3586	NC_008818	AAT	2	6	878857	878862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_008818	ATG	2	6	881480	881485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_008818	CGG	2	6	881584	881589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_008818	AGA	2	6	881618	881623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_008818	GCA	2	6	881707	881712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_008818	AAAG	2	8	882360	882367	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_008818	CT	3	6	882405	882410	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3593	NC_008818	TAGCT	2	10	882455	882464	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3594	NC_008818	GTAA	2	8	882515	882522	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_008818	TC	3	6	882640	882645	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3596	NC_008818	CTC	2	6	882737	882742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3597	NC_008818	TA	3	6	882816	882821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_008818	ACA	2	6	882842	882847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_008818	CAAG	2	8	882912	882919	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3600	NC_008818	CAA	2	6	883608	883613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_008818	GAA	2	6	883618	883623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_008818	GA	3	6	883668	883673	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_008818	CAG	2	6	883719	883724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_008818	GCTG	2	8	883758	883765	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3605	NC_008818	ATT	2	6	883769	883774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_008818	TGA	2	6	883840	883845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_008818	AGT	2	6	883939	883944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_008818	ATG	2	6	883955	883960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_008818	TTG	2	6	883979	883984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_008818	TGA	2	6	884009	884014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_008818	GAA	2	6	884015	884020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_008818	GGC	2	6	884042	884047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_008818	CGGC	2	8	884105	884112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3614	NC_008818	TCC	2	6	884187	884192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3615	NC_008818	GTT	2	6	884551	884556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_008818	CGA	2	6	884587	884592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_008818	T	6	6	884633	884638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_008818	CT	3	6	884643	884648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3619	NC_008818	CAA	2	6	884668	884673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_008818	CTT	2	6	884678	884683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_008818	TGT	2	6	884740	884745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_008818	TCT	2	6	884773	884778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_008818	CTCC	2	8	884837	884844	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3624	NC_008818	GCG	2	6	884854	884859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3629	NC_008818	CCAT	2	8	884983	884990	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3630	NC_008818	GCT	2	6	885070	885075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3631	NC_008818	GCG	2	6	885124	885129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3632	NC_008818	GAA	2	6	885156	885161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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