MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halorhodospira halophila SL1 chromosome

Total Repeats: 5010

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008789	GGT	2	6	690269	690274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_008789	CCG	2	6	690326	690331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1503	NC_008789	TCG	2	6	690340	690345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_008789	CCG	2	6	690366	690371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1505	NC_008789	GAC	2	6	690375	690380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_008789	AGC	2	6	690427	690432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_008789	CCA	2	6	690475	690480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1508	NC_008789	AGGT	2	8	690513	690520	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_008789	TTCC	2	8	690543	690550	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1510	NC_008789	TGC	2	6	690577	690582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_008789	TCG	2	6	690885	690890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_008789	TCA	2	6	690891	690896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_008789	GCT	2	6	690898	690903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_008789	TCGC	2	8	690959	690966	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1515	NC_008789	TG	3	6	690970	690975	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_008789	GTC	2	6	691042	691047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_008789	GTA	2	6	691090	691095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_008789	AGC	2	6	691212	691217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_008789	TGC	2	6	691233	691238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_008789	TGA	2	6	691257	691262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_008789	G	6	6	691417	691422	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_008789	G	6	6	691486	691491	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_008789	TGG	2	6	691508	691513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_008789	GCG	2	6	691544	691549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1526	NC_008789	GA	3	6	691587	691592	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_008789	GCG	2	6	693076	693081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1529	NC_008789	CAC	2	6	693147	693152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1530	NC_008789	GA	3	6	693154	693159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_008789	TCG	2	6	694897	694902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_008789	CCT	2	6	695935	695940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_008789	GCT	2	6	696040	696045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1552	NC_008789	GCC	2	6	701447	701452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1553	NC_008789	AG	3	6	701489	701494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1555	NC_008789	CTC	2	6	701520	701525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1557	NC_008789	TGC	2	6	701608	701613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_008789	AGCC	2	8	711401	711408	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1559	NC_008789	GATGCA	2	12	711469	711480	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1560	NC_008789	ACT	2	6	711492	711497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_008789	CTG	2	6	711533	711538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_008789	GAG	2	6	711561	711566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_008789	TGG	2	6	711621	711626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_008789	GCT	2	6	711724	711729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_008789	AGC	2	6	711857	711862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_008789	TAT	2	6	711865	711870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_008789	CAC	2	6	712029	712034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1568	NC_008789	GCG	2	6	712053	712058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_008789	CCG	2	6	712118	712123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1570	NC_008789	GCC	2	6	713377	713382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_008789	CGCGC	2	10	713396	713405	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1572	NC_008789	GCT	2	6	713492	713497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_008789	ACGTC	2	10	713515	713524	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1574	NC_008789	G	6	6	714097	714102	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_008789	ACGG	2	8	714171	714178	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1578	NC_008789	ACGA	2	8	714303	714310	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1579	NC_008789	GAG	2	6	714360	714365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1582	NC_008789	GAC	3	9	714591	714599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1584	NC_008789	AAT	2	6	714647	714652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1588	NC_008789	CACCC	2	10	714729	714738	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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1596	NC_008789	TAT	2	6	715259	715264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_008789	ATT	2	6	715334	715339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_008789	GGC	2	6	715425	715430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_008789	CTCGC	2	10	715483	715492	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1600	NC_008789	AGG	2	6	715520	715525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_008789	GTTGG	2	10	715574	715583	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_008789	CGG	2	6	715631	715636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_008789	GAGAGC	2	12	715646	715657	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1604	NC_008789	CCA	2	6	716404	716409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1605	NC_008789	C	6	6	719348	719353	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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1607	NC_008789	CCA	2	6	721407	721412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1608	NC_008789	CAT	2	6	721429	721434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_008789	AGGT	2	8	721445	721452	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_008789	TTCC	2	8	721475	721482	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1611	NC_008789	TCG	2	6	721817	721822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_008789	TCA	2	6	721823	721828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_008789	GCT	2	6	721830	721835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_008789	TCGC	2	8	721891	721898	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1615	NC_008789	TG	3	6	721902	721907	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_008789	AGC	2	6	721941	721946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_008789	GCG	3	9	721967	721975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_008789	CCT	2	6	721994	721999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1619	NC_008789	C	6	6	722002	722007	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1620	NC_008789	CGG	2	6	722034	722039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_008789	ACG	2	6	722047	722052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_008789	GCT	2	6	722079	722084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_008789	GC	3	6	722239	722244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1624	NC_008789	GAG	2	6	722342	722347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_008789	GC	4	8	722388	722395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1626	NC_008789	TGT	2	6	722668	722673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_008789	TCG	2	6	722772	722777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_008789	CCAG	2	8	722908	722915	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1629	NC_008789	GCT	2	6	723034	723039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_008789	CGT	2	6	723071	723076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_008789	C	6	6	723134	723139	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1632	NC_008789	TCG	2	6	723252	723257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1634	NC_008789	CCT	2	6	723361	723366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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