MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Hyphomonas neptunium ATCC 15444 chromosome

Total Repeats: 6930

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008358	C	6	6	2713435	2713440	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5002	NC_008358	GCG	2	6	2713515	2713520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_008358	GCG	2	6	2713530	2713535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_008358	GGAA	2	8	2713559	2713566	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_008358	GTG	2	6	2714533	2714538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_008358	GAC	2	6	2714557	2714562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_008358	G	6	6	2714571	2714576	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_008358	AGGC	2	8	2714577	2714584	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5009	NC_008358	AGG	2	6	2714633	2714638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_008358	ACC	2	6	2715186	2715191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5011	NC_008358	AAT	2	6	2716345	2716350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_008358	GA	3	6	2716359	2716364	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_008358	GAT	2	6	2717427	2717432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_008358	AAG	2	6	2719826	2719831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_008358	CAA	2	6	2719863	2719868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_008358	TGC	2	6	2719943	2719948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_008358	TCG	2	6	2719960	2719965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_008358	CATTGC	2	12	2719976	2719987	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_008358	TCGC	2	8	2720038	2720045	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5020	NC_008358	CGC	2	6	2720085	2720090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5021	NC_008358	C	6	6	2723214	2723219	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5022	NC_008358	TCCCC	2	10	2723254	2723263	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
5023	NC_008358	GCG	2	6	2725136	2725141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_008358	TGC	2	6	2725284	2725289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_008358	CTGTT	2	10	2727301	2727310	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5026	NC_008358	ACGC	2	8	2727427	2727434	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5027	NC_008358	CGG	2	6	2727441	2727446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_008358	CTT	2	6	2727530	2727535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_008358	CG	3	6	2728169	2728174	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5030	NC_008358	CT	4	8	2728185	2728192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5031	NC_008358	CAAA	2	8	2728193	2728200	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5032	NC_008358	CACCC	2	10	2728286	2728295	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
5033	NC_008358	TCA	2	6	2728345	2728350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_008358	GCCC	2	8	2729467	2729474	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5035	NC_008358	TCCC	2	8	2729492	2729499	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5036	NC_008358	C	6	6	2729497	2729502	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5037	NC_008358	TCC	2	6	2729561	2729566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5038	NC_008358	CG	3	6	2729605	2729610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5039	NC_008358	TCC	2	6	2729669	2729674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5040	NC_008358	GAG	2	6	2729708	2729713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_008358	GGA	2	6	2729722	2729727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_008358	CGG	2	6	2729915	2729920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_008358	GCG	2	6	2729927	2729932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_008358	CAACA	2	10	2729952	2729961	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
5045	NC_008358	GCG	2	6	2729978	2729983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_008358	CGC	2	6	2729986	2729991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5047	NC_008358	TGA	2	6	2730086	2730091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_008358	CAT	2	6	2730103	2730108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_008358	CAA	2	6	2732652	2732657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_008358	GCC	2	6	2732731	2732736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5051	NC_008358	TCC	2	6	2735198	2735203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5052	NC_008358	GGA	2	6	2735224	2735229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_008358	CGCC	2	8	2735271	2735278	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5054	NC_008358	CCT	2	6	2735714	2735719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5055	NC_008358	GA	3	6	2735720	2735725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_008358	TGC	2	6	2735748	2735753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_008358	A	6	6	2736707	2736712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_008358	ATG	2	6	2736726	2736731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_008358	ATT	3	9	2736734	2736742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_008358	GCA	2	6	2739672	2739677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_008358	TGT	2	6	2739716	2739721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_008358	TTC	2	6	2742542	2742547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_008358	ATA	2	6	2742581	2742586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_008358	GAT	2	6	2742650	2742655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_008358	GCC	2	6	2742687	2742692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5066	NC_008358	GCA	2	6	2742714	2742719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_008358	CGC	2	6	2744367	2744372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5068	NC_008358	CCT	2	6	2749776	2749781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5069	NC_008358	T	6	6	2749781	2749786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_008358	GCTG	2	8	2752877	2752884	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5071	NC_008358	T	7	7	2752930	2752936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_008358	GCCC	2	8	2752953	2752960	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5073	NC_008358	CAA	2	6	2752970	2752975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_008358	TCG	2	6	2755497	2755502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_008358	CT	3	6	2757369	2757374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5076	NC_008358	GATA	2	8	2757481	2757488	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_008358	CGCCC	2	10	2757506	2757515	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
5078	NC_008358	GCG	2	6	2757537	2757542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_008358	TC	3	6	2757549	2757554	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5080	NC_008358	CCA	2	6	2762347	2762352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5081	NC_008358	CATTT	2	10	2762376	2762385	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5082	NC_008358	AGCGG	2	10	2762495	2762504	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5083	NC_008358	GCG	2	6	2762521	2762526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_008358	GCG	2	6	2762576	2762581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_008358	CGT	2	6	2763139	2763144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_008358	GCG	2	6	2763249	2763254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_008358	GCT	2	6	2764383	2764388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_008358	CTGG	2	8	2764445	2764452	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5089	NC_008358	CGG	2	6	2764516	2764521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_008358	AGG	2	6	2764573	2764578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_008358	GGA	2	6	2765273	2765278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_008358	GTT	2	6	2765349	2765354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_008358	CCCGCT	2	12	2765400	2765411	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
5094	NC_008358	CAG	2	6	2765439	2765444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_008358	GCC	3	9	2765448	2765456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5096	NC_008358	GGC	2	6	2765465	2765470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_008358	ATC	2	6	2766656	2766661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_008358	AAT	2	6	2766672	2766677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_008358	TTTG	2	8	2767852	2767859	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_008358	AC	3	6	2767958	2767963	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5101	NC_008358	CAGG	2	8	2769527	2769534	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5102	NC_008358	C	6	6	2769587	2769592	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5103	NC_008358	CGA	2	6	2769974	2769979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_008358	GCTTT	2	10	2769987	2769996	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5105	NC_008358	T	6	6	2770077	2770082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_008358	CCG	2	6	2770171	2770176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5107	NC_008358	TCA	2	6	2770243	2770248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_008358	CT	3	6	2770313	2770318	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5109	NC_008358	ATG	2	6	2770440	2770445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_008358	GGTA	2	8	2770484	2770491	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_008358	GCA	2	6	2770546	2770551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_008358	CGG	2	6	2771244	2771249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_008358	GAT	2	6	2775287	2775292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_008358	GCG	2	6	2775525	2775530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_008358	TGC	2	6	2776315	2776320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_008358	CCG	2	6	2777896	2777901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5117	NC_008358	CAG	2	6	2777902	2777907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_008358	A	6	6	2779154	2779159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_008358	GCCC	2	8	2779907	2779914	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5120	NC_008358	CGG	2	6	2779919	2779924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_008358	GCG	2	6	2780478	2780483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_008358	CCCCA	2	10	2780517	2780526	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
5123	NC_008358	TCCC	2	8	2780527	2780534	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5124	NC_008358	GGA	2	6	2780630	2780635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_008358	TGGGG	2	10	2781943	2781952	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_008358	CTC	2	6	2787846	2787851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5127	NC_008358	CAT	2	6	2787883	2787888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_008358	GGCGCT	2	12	2788409	2788420	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_008358	GCA	2	6	2788421	2788426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_008358	CAG	2	6	2788450	2788455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_008358	GTAT	2	8	2788524	2788531	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5133	NC_008358	CG	3	6	2790355	2790360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5139	NC_008358	TCC	2	6	2792807	2792812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5248	NC_008358	TCAG	2	8	2817804	2817811	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5249	NC_008358	TTG	2	6	2817816	2817821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5259	NC_008358	ACC	2	6	2818218	2818223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5260	NC_008358	GGC	2	6	2818256	2818261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5261	NC_008358	CGC	2	6	2818262	2818267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5263	NC_008358	ACGA	2	8	2818343	2818350	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5264	NC_008358	AAG	2	6	2818402	2818407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5265	NC_008358	AGG	2	6	2818468	2818473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5266	NC_008358	ATG	2	6	2818592	2818597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5268	NC_008358	GAC	2	6	2818692	2818697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5269	NC_008358	GT	3	6	2818754	2818759	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5270	NC_008358	TCC	2	6	2818805	2818810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5272	NC_008358	CACGA	2	10	2818906	2818915	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5273	NC_008358	GAC	2	6	2818919	2818924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5277	NC_008358	TGCC	2	8	2819146	2819153	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5281	NC_008358	GCT	2	6	2819463	2819468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5384	NC_008358	CCTCG	2	10	2860777	2860786	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5385	NC_008358	T	7	7	2860848	2860854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5391	NC_008358	AT	3	6	2861503	2861508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5392	NC_008358	A	9	9	2861520	2861528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5393	NC_008358	CAA	2	6	2861529	2861534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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