MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Haemophilus somnus 129PT chromosome

Total Repeats: 468

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008309	TA	3	6	1878	1883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008309	TA	3	6	18986	18991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008309	GT	3	6	21352	21357	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008309	AT	3	6	30177	30182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008309	AG	3	6	31167	31172	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008309	TC	3	6	32247	32252	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008309	TA	3	6	38111	38116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008309	TA	3	6	39147	39152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008309	AT	3	6	52038	52043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008309	TA	3	6	60903	60908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008309	TA	3	6	68096	68101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008309	AG	3	6	73087	73092	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008309	TA	4	8	76648	76655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008309	AG	3	6	78192	78197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008309	TG	3	6	85824	85829	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008309	AC	3	6	90666	90671	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008309	AT	3	6	109859	109864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008309	AT	3	6	111232	111237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008309	AT	3	6	138006	138011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008309	GA	3	6	140574	140579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008309	TG	3	6	150414	150419	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008309	TA	4	8	151644	151651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008309	AG	3	6	155861	155866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008309	TA	3	6	162734	162739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008309	GT	3	6	163694	163699	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008309	AT	3	6	174570	174575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008309	AT	3	6	177548	177553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008309	TA	3	6	179904	179909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008309	TC	3	6	186265	186270	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008309	AC	3	6	194054	194059	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008309	TA	3	6	195205	195210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008309	CT	3	6	212440	212445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008309	AT	3	6	215401	215406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008309	TA	4	8	216953	216960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008309	TA	3	6	218728	218733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008309	AT	3	6	219029	219034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008309	TA	3	6	246048	246053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008309	AT	3	6	248294	248299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008309	AT	3	6	253112	253117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008309	TG	3	6	256304	256309	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008309	AT	3	6	256422	256427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008309	AT	3	6	261132	261137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008309	AG	3	6	275408	275413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008309	AT	3	6	280403	280408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008309	GA	3	6	280917	280922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008309	TA	3	6	282629	282634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008309	TA	3	6	285909	285914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008309	AC	3	6	289231	289236	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008309	GT	3	6	290561	290566	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008309	TA	3	6	290594	290599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008309	TA	4	8	293291	293298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008309	TA	3	6	295363	295368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008309	AT	3	6	304638	304643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008309	TA	3	6	304711	304716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008309	GA	3	6	304782	304787	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008309	AT	3	6	309554	309559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008309	AT	3	6	309610	309615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008309	GT	3	6	321521	321526	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008309	TA	3	6	321601	321606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008309	AT	3	6	326393	326398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008309	AT	4	8	336939	336946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008309	TA	3	6	344040	344045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008309	GA	3	6	344197	344202	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008309	TG	3	6	346993	346998	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008309	AT	3	6	348266	348271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008309	AG	3	6	380642	380647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008309	TC	3	6	390230	390235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008309	CA	3	6	390374	390379	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_008309	CT	3	6	406839	406844	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008309	TA	3	6	411721	411726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008309	AT	3	6	411732	411737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008309	TA	3	6	411742	411747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008309	TC	3	6	412911	412916	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_008309	TA	3	6	436698	436703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008309	TA	3	6	442863	442868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008309	AG	4	8	445511	445518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008309	AT	3	6	447063	447068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008309	AG	3	6	448247	448252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008309	CA	3	6	462156	462161	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_008309	AC	3	6	462358	462363	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_008309	AT	3	6	462787	462792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008309	AT	3	6	462909	462914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008309	AT	3	6	463069	463074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008309	AT	3	6	463092	463097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008309	CT	3	6	472097	472102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_008309	TA	3	6	473061	473066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008309	AC	3	6	480806	480811	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_008309	AC	3	6	491684	491689	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008309	AT	3	6	493810	493815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008309	TA	3	6	494476	494481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008309	AT	3	6	497702	497707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008309	AT	3	6	499264	499269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008309	TC	3	6	508990	508995	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_008309	TG	3	6	527025	527030	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008309	AC	3	6	529282	529287	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_008309	AT	3	6	536022	536027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008309	AT	3	6	536034	536039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008309	AT	3	6	541281	541286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008309	TC	3	6	544819	544824	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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102	NC_008309	TA	4	8	563972	563979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008309	CT	4	8	564942	564949	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_008309	CA	4	8	565012	565019	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_008309	AT	3	6	570741	570746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008309	TA	3	6	573827	573832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008309	AT	3	6	574658	574663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008309	AT	3	6	574734	574739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008309	AG	3	6	583801	583806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008309	AT	3	6	590348	590353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008309	AT	3	6	597093	597098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008309	GA	3	6	607028	607033	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008309	TA	3	6	607770	607775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008309	GA	3	6	611498	611503	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008309	GA	3	6	624568	624573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008309	AT	3	6	627659	627664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008309	AG	3	6	629004	629009	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008309	AT	3	6	629101	629106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008309	TA	3	6	637256	637261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008309	TA	3	6	644788	644793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008309	TA	3	6	644880	644885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008309	AG	3	6	646169	646174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008309	AT	3	6	658228	658233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008309	AT	3	6	666574	666579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008309	TA	3	6	671543	671548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008309	AT	3	6	671773	671778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008309	CT	3	6	671861	671866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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131	NC_008309	AT	3	6	684172	684177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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133	NC_008309	TG	3	6	696779	696784	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008309	TA	3	6	697777	697782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008309	AT	4	8	697788	697795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008309	TA	3	6	697805	697810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008309	GA	3	6	710813	710818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008309	AT	3	6	717978	717983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008309	AT	3	6	725258	725263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008309	GT	3	6	730469	730474	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008309	AT	3	6	730593	730598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008309	GA	3	6	735170	735175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008309	GA	3	6	735469	735474	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008309	CA	3	6	736904	736909	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_008309	TA	3	6	743203	743208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008309	TG	3	6	743268	743273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008309	AT	3	6	743306	743311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_008309	AT	3	6	762112	762117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008309	GA	3	6	762252	762257	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.