MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Haemophilus somnus 129PT chromosome

Total Repeats: 2616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008309	ATG	2	6	40	45	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008309	AAT	2	6	57	62	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008309	CTT	2	6	167	172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008309	ATT	2	6	200	205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008309	AAT	2	6	228	233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008309	TTA	3	9	289	297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008309	CAA	2	6	298	303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008309	GAA	2	6	335	340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008309	GGT	2	6	1363	1368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008309	CTC	2	6	1396	1401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_008309	CAG	2	6	1458	1463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008309	GAG	2	6	1464	1469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008309	TGT	2	6	1488	1493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008309	ATT	2	6	1511	1516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008309	CAA	2	6	1685	1690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008309	ATG	2	6	1777	1782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008309	AAT	2	6	1825	1830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008309	TAA	3	9	1834	1842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008309	GAT	2	6	3349	3354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008309	ATC	2	6	3367	3372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008309	TAT	2	6	3949	3954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008309	TAA	2	6	3971	3976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008309	AAC	2	6	5585	5590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008309	TAA	2	6	8183	8188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008309	CAA	2	6	10255	10260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008309	AAT	2	6	10275	10280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008309	ATT	2	6	12175	12180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008309	AAT	2	6	12186	12191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008309	AAT	2	6	12196	12201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008309	GAG	2	6	18453	18458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008309	TGT	2	6	18498	18503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008309	TGA	2	6	18526	18531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008309	TTC	2	6	18718	18723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008309	TCA	2	6	18743	18748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008309	ATA	2	6	18771	18776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008309	ATT	3	9	18828	18836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008309	AGG	2	6	18899	18904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008309	GAG	2	6	21280	21285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008309	ATT	2	6	21320	21325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008309	ACA	2	6	21326	21331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008309	GAC	2	6	22377	22382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008309	TAA	2	6	23467	23472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008309	TTA	2	6	26280	26285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008309	TAA	2	6	26355	26360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008309	GAT	2	6	30089	30094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008309	GAT	2	6	30218	30223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008309	CAA	2	6	30299	30304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008309	CTT	2	6	31211	31216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008309	GAA	2	6	31228	31233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008309	AGG	2	6	32253	32258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008309	TGT	2	6	37281	37286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008309	TAA	2	6	37328	37333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008309	ATT	2	6	39236	39241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008309	ATT	2	6	39734	39739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008309	GAG	2	6	48636	48641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008309	TTG	2	6	48648	48653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008309	TAA	2	6	48661	48666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008309	GAA	2	6	49386	49391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008309	ATA	2	6	49421	49426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008309	TCC	2	6	49440	49445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_008309	TGA	2	6	53256	53261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008309	GTT	2	6	53262	53267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008309	TTG	2	6	53269	53274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008309	AAT	2	6	53334	53339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008309	GAA	2	6	53384	53389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008309	TCC	2	6	55073	55078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_008309	TAT	2	6	56074	56079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008309	ATG	2	6	59786	59791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008309	TTG	2	6	59831	59836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008309	GAG	2	6	59869	59874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008309	ATT	2	6	62890	62895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008309	CAC	2	6	62947	62952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_008309	GGA	2	6	63033	63038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008309	TTA	2	6	63452	63457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008309	GGA	2	6	65011	65016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008309	ATT	2	6	68219	68224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008309	ATT	2	6	68265	68270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008309	GTT	2	6	70915	70920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008309	CAG	2	6	70934	70939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008309	TGT	2	6	71000	71005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008309	GTA	2	6	79667	79672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008309	ATT	2	6	81688	81693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008309	TAA	2	6	81718	81723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008309	TTA	2	6	82044	82049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008309	GGT	2	6	82103	82108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008309	CAG	2	6	82156	82161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_008309	TAT	2	6	82220	82225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008309	GTT	3	9	82233	82241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008309	ATC	2	6	82273	82278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008309	TGA	2	6	82994	82999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008309	TTA	2	6	83038	83043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008309	GTT	2	6	85432	85437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008309	TGT	2	6	85448	85453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008309	TAT	2	6	85482	85487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008309	ACA	2	6	85504	85509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008309	ATG	2	6	85584	85589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008309	ATC	2	6	85681	85686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008309	ATT	2	6	85856	85861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008309	TTG	2	6	85916	85921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008309	GAA	2	6	85937	85942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008309	AAG	2	6	90813	90818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008309	CAT	2	6	90996	91001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008309	TCA	2	6	91610	91615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_008309	AAC	2	6	91651	91656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_008309	CGG	2	6	91982	91987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008309	TCT	2	6	92069	92074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008309	TTA	2	6	92099	92104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008309	GGT	2	6	92134	92139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008309	GAA	2	6	92248	92253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008309	AAG	2	6	92325	92330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008309	TGG	2	6	92371	92376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008309	TAT	2	6	92470	92475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008309	GTA	2	6	92514	92519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008309	TTG	2	6	92524	92529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008309	TAT	2	6	92544	92549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008309	TAA	2	6	92578	92583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008309	AAT	2	6	92631	92636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008309	TGT	2	6	92642	92647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008309	GAT	2	6	92668	92673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008309	ACA	2	6	92679	92684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008309	TTA	2	6	92999	93004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008309	TGA	2	6	93036	93041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008309	TAA	3	9	93993	94001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008309	TTA	2	6	95009	95014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008309	TGA	2	6	95026	95031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008309	GAA	2	6	95043	95048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008309	TAA	2	6	95056	95061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008309	CAA	2	6	95099	95104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_008309	TAC	2	6	95150	95155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008309	TTC	2	6	95304	95309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_008309	GCT	2	6	95373	95378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_008309	AAT	2	6	95400	95405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008309	TAA	2	6	99896	99901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008309	GCG	2	6	99958	99963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_008309	GAT	2	6	100003	100008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008309	ATG	2	6	100011	100016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008309	AAG	2	6	101816	101821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008309	GTT	2	6	102079	102084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008309	ATT	2	6	102516	102521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008309	TAG	2	6	102614	102619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008309	TAA	2	6	106433	106438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008309	TTG	2	6	109971	109976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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