MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790

Total Repeats: 16658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_008212	TTA	2	6	520654	520659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_008212	CGA	3	9	520673	520681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2503	NC_008212	TCAG	2	8	520919	520926	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2504	NC_008212	GC	3	6	520964	520969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2505	NC_008212	T	6	6	521000	521005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_008212	AC	3	6	521087	521092	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2507	NC_008212	TTA	2	6	521142	521147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_008212	TA	3	6	521169	521174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_008212	TCA	2	6	521217	521222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_008212	AAT	2	6	521223	521228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_008212	AG	3	6	522204	522209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_008212	CAAG	2	8	522239	522246	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2513	NC_008212	TAAA	2	8	522295	522302	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_008212	A	6	6	522333	522338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_008212	AC	3	6	522430	522435	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2516	NC_008212	GAA	2	6	522542	522547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_008212	TTA	2	6	522665	522670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_008212	GCT	2	6	522744	522749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2519	NC_008212	TCAAA	2	10	522778	522787	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2520	NC_008212	GTG	2	6	522801	522806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_008212	TAAG	2	8	522843	522850	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_008212	CTA	2	6	522875	522880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2523	NC_008212	ATC	2	6	522944	522949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2524	NC_008212	T	7	7	522979	522985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_008212	AAG	2	6	523043	523048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_008212	ATA	2	6	524944	524949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_008212	AGAT	2	8	524954	524961	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_008212	TCT	2	6	524979	524984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2529	NC_008212	AAT	2	6	525001	525006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_008212	AT	3	6	525034	525039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_008212	GATT	2	8	525074	525081	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_008212	ATG	2	6	526181	526186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_008212	TTTTA	2	10	526217	526226	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_008212	TAG	2	6	526232	526237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_008212	ATT	2	6	526339	526344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_008212	AT	3	6	526353	526358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_008212	TA	4	8	526413	526420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_008212	GAC	2	6	526518	526523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2539	NC_008212	GTG	2	6	526566	526571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_008212	TAC	2	6	527173	527178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2541	NC_008212	T	6	6	527208	527213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_008212	TTGA	2	8	527215	527222	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_008212	AGGACT	2	12	528190	528201	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2544	NC_008212	GAT	2	6	528217	528222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_008212	TAC	2	6	528243	528248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2546	NC_008212	AT	3	6	529259	529264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_008212	TA	3	6	529792	529797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_008212	AAT	2	6	529813	529818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_008212	ATCT	2	8	529821	529828	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2550	NC_008212	CGG	2	6	529851	529856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2551	NC_008212	AAT	2	6	529892	529897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_008212	CCA	2	6	529947	529952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2553	NC_008212	AGG	2	6	530149	530154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_008212	GAG	2	6	530175	530180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_008212	ATA	2	6	530202	530207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_008212	CAGTC	2	10	530228	530237	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2557	NC_008212	GC	3	6	530239	530244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2558	NC_008212	GGA	2	6	530248	530253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_008212	CGA	2	6	530287	530292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2560	NC_008212	ACT	2	6	530325	530330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2561	NC_008212	CGA	2	6	530332	530337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2562	NC_008212	GCC	2	6	530343	530348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2563	NC_008212	GAA	2	6	530357	530362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_008212	CGACA	2	10	530402	530411	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2565	NC_008212	CTTT	2	8	530531	530538	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2566	NC_008212	ATA	2	6	530544	530549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_008212	GTACTC	2	12	530626	530637	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2568	NC_008212	TAT	3	9	530768	530776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_008212	TA	3	6	530805	530810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_008212	TGG	2	6	530840	530845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_008212	AGA	2	6	531112	531117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_008212	ATA	2	6	531519	531524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_008212	TTA	2	6	531605	531610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_008212	AT	4	8	532060	532067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_008212	CTG	2	6	532130	532135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2576	NC_008212	TGA	2	6	532196	532201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_008212	CAT	2	6	532254	532259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2578	NC_008212	TGTC	2	8	532284	532291	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2579	NC_008212	TAT	2	6	532351	532356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_008212	TTA	2	6	535312	535317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_008212	TAT	2	6	535321	535326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_008212	ATTC	2	8	536467	536474	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2583	NC_008212	TGCA	2	8	536560	536567	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2584	NC_008212	ATT	2	6	536619	536624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_008212	ATT	3	9	536696	536704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_008212	A	6	6	536718	536723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_008212	CTACC	2	10	536790	536799	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2588	NC_008212	AT	3	6	536820	536825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_008212	TCC	2	6	536870	536875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2590	NC_008212	GAG	2	6	536943	536948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_008212	GCT	2	6	536997	537002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2592	NC_008212	TCG	2	6	537017	537022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2593	NC_008212	ATA	2	6	537064	537069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_008212	TAC	2	6	537081	537086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2595	NC_008212	TCG	2	6	537102	537107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2596	NC_008212	GAC	2	6	537109	537114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2597	NC_008212	GTAA	2	8	537117	537124	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_008212	CCAG	2	8	537268	537275	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2599	NC_008212	CCCA	2	8	537286	537293	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2600	NC_008212	CCCCG	2	10	537346	537355	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
2601	NC_008212	GAAT	2	8	537393	537400	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_008212	CAT	2	6	537420	537425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2603	NC_008212	CGATA	2	10	537438	537447	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2604	NC_008212	TGATA	2	10	537551	537560	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_008212	AAT	2	6	537584	537589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_008212	CTA	2	6	537599	537604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2607	NC_008212	CGAC	2	8	537615	537622	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2608	NC_008212	TAC	2	6	539294	539299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_008212	TGT	2	6	539337	539342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_008212	TGA	2	6	539415	539420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_008212	TCA	2	6	539454	539459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2612	NC_008212	ATGT	2	8	539497	539504	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_008212	CTT	3	9	540980	540988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2614	NC_008212	CT	3	6	542436	542441	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2615	NC_008212	AT	4	8	542455	542462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_008212	GCT	2	6	542464	542469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2617	NC_008212	ATATT	2	10	542547	542556	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_008212	CGT	2	6	542586	542591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2619	NC_008212	GGT	2	6	542625	542630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_008212	CA	3	6	542680	542685	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2621	NC_008212	TAT	2	6	542765	542770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_008212	CAG	2	6	542783	542788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2623	NC_008212	GTGA	2	8	542790	542797	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_008212	ATGA	2	8	542806	542813	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_008212	TTG	2	6	542983	542988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_008212	CAA	2	6	543108	543113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2627	NC_008212	TCG	2	6	543199	543204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2628	NC_008212	AAT	2	6	543284	543289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2629	NC_008212	A	6	6	543330	543335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_008212	TGA	2	6	543396	543401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_008212	TGA	2	6	543417	543422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2632	NC_008212	TC	3	6	544007	544012	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2633	NC_008212	CATA	2	8	544037	544044	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2634	NC_008212	TGC	2	6	544057	544062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2635	NC_008212	TTC	2	6	544121	544126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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