MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790

Total Repeats: 16658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008212	CTT	2	6	84687	84692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_008212	CAT	2	6	84701	84706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_008212	AGC	2	6	84711	84716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_008212	ATG	2	6	84742	84747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_008212	CCCG	2	8	85239	85246	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
506	NC_008212	TCTG	2	8	85267	85274	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
507	NC_008212	CTG	2	6	85317	85322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_008212	CA	3	6	85379	85384	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
509	NC_008212	AT	3	6	85415	85420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_008212	TTG	2	6	85985	85990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_008212	TATC	2	8	86061	86068	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
512	NC_008212	CAA	2	6	86090	86095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_008212	ATCA	2	8	86127	86134	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
514	NC_008212	GTT	2	6	86144	86149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_008212	AAT	2	6	86155	86160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_008212	TGT	2	6	87501	87506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_008212	AT	6	12	87529	87540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_008212	ACATAT	2	12	87549	87560	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
519	NC_008212	AT	3	6	87565	87570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_008212	AT	3	6	87573	87578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_008212	ATC	2	6	87588	87593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_008212	CTG	2	6	88175	88180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_008212	TCATA	2	10	88181	88190	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
524	NC_008212	ATC	2	6	88198	88203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_008212	AT	3	6	88225	88230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_008212	AT	3	6	88261	88266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_008212	TAAT	2	8	88278	88285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_008212	ATAA	2	8	88335	88342	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_008212	AGT	2	6	88754	88759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_008212	ATA	2	6	88765	88770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_008212	AAT	2	6	88776	88781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_008212	GACGAG	2	12	88816	88827	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
533	NC_008212	G	6	6	88834	88839	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
534	NC_008212	TGG	2	6	88987	88992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
535	NC_008212	TCC	2	6	89044	89049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_008212	GAG	2	6	89061	89066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_008212	CAGGTT	2	12	89077	89088	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
538	NC_008212	TTA	2	6	89131	89136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_008212	TAT	2	6	90199	90204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_008212	GAT	2	6	90225	90230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_008212	AGA	2	6	90239	90244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_008212	TGG	2	6	90290	90295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_008212	TAG	2	6	90304	90309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_008212	ATT	2	6	90381	90386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_008212	TTCA	2	8	90393	90400	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
546	NC_008212	ATT	2	6	90407	90412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_008212	GAA	2	6	90448	90453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_008212	ATGG	2	8	90508	90515	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
549	NC_008212	AT	3	6	90539	90544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_008212	TAT	2	6	90565	90570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_008212	ATGA	2	8	90625	90632	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
552	NC_008212	AT	3	6	91333	91338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_008212	CTGG	2	8	91340	91347	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
554	NC_008212	CT	4	8	91368	91375	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
555	NC_008212	CGA	2	6	91395	91400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_008212	GTC	2	6	91424	91429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_008212	TAC	2	6	91470	91475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_008212	GAT	2	6	91483	91488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_008212	AT	3	6	91524	91529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_008212	AAT	2	6	91552	91557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_008212	AAC	2	6	91566	91571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_008212	GAC	2	6	94138	94143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_008212	TCA	2	6	94240	94245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_008212	TAT	2	6	94265	94270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_008212	GAG	2	6	95505	95510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
566	NC_008212	CTC	2	6	95518	95523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_008212	AG	3	6	95524	95529	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
568	NC_008212	CAA	2	6	95634	95639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_008212	ACT	2	6	95672	95677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_008212	GAATC	2	10	95686	95695	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
571	NC_008212	ATT	2	6	97272	97277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_008212	CTGATC	2	12	97298	97309	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_008212	ATT	2	6	97321	97326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_008212	TA	3	6	97346	97351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_008212	AAT	2	6	97354	97359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_008212	TCTAA	2	10	97360	97369	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
577	NC_008212	AT	3	6	97448	97453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_008212	CGA	2	6	97480	97485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_008212	AT	3	6	97519	97524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_008212	TACC	2	8	97732	97739	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
581	NC_008212	TTC	2	6	97879	97884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_008212	TGA	3	9	98051	98059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_008212	GGAC	2	8	98113	98120	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
584	NC_008212	CTG	2	6	98911	98916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_008212	TAC	2	6	98962	98967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_008212	GTG	2	6	99014	99019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
587	NC_008212	TC	3	6	99081	99086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
588	NC_008212	ACT	2	6	99128	99133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_008212	TCA	2	6	99174	99179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_008212	TTGT	2	8	99183	99190	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
591	NC_008212	T	6	6	99235	99240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_008212	TAG	2	6	99252	99257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_008212	AAG	2	6	99264	99269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_008212	CCT	2	6	99317	99322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_008212	AAGT	2	8	99328	99335	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
596	NC_008212	TGC	2	6	99533	99538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_008212	TA	3	6	99548	99553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_008212	GAC	2	6	99579	99584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_008212	AGC	2	6	99614	99619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_008212	CAGTG	2	10	99680	99689	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
601	NC_008212	GAA	2	6	99726	99731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_008212	TAA	2	6	99766	99771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_008212	CCG	2	6	99807	99812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_008212	AG	3	6	99895	99900	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
605	NC_008212	GA	3	6	99927	99932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
606	NC_008212	A	6	6	99948	99953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_008212	CGGA	2	8	99968	99975	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
608	NC_008212	TCG	2	6	100016	100021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_008212	GAG	2	6	100036	100041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_008212	CCT	2	6	100062	100067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_008212	CAG	2	6	100107	100112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_008212	GTT	2	6	100577	100582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_008212	CTT	2	6	100612	100617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_008212	AAC	2	6	100633	100638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_008212	AAT	2	6	100725	100730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_008212	ATAG	2	8	100742	100749	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
617	NC_008212	CAT	2	6	100816	100821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_008212	GAA	2	6	100849	100854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_008212	GAT	2	6	100984	100989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_008212	CAA	2	6	101003	101008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_008212	ATG	2	6	101092	101097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_008212	CTGC	2	8	101149	101156	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
623	NC_008212	ATA	2	6	101166	101171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_008212	GAT	2	6	101198	101203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_008212	GATT	2	8	101306	101313	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
626	NC_008212	ACCCG	2	10	101344	101353	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
627	NC_008212	GCT	2	6	101496	101501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_008212	TA	3	6	101504	101509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_008212	ATT	2	6	101515	101520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_008212	AATGA	2	10	101541	101550	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
631	NC_008212	ACA	2	6	101578	101583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_008212	CTTT	2	8	101617	101624	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
633	NC_008212	AAG	2	6	101652	101657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_008212	GA	3	6	101715	101720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
635	NC_008212	TCA	2	6	101858	101863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_008212	TGA	2	6	102022	102027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_008212	ATA	2	6	102058	102063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_008212	GCG	2	6	102090	102095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_008212	AC	3	6	102189	102194	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
640	NC_008212	ACAT	2	8	102199	102206	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
641	NC_008212	AG	4	8	130543	130550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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931	NC_008212	CT	3	6	197829	197834	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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952	NC_008212	ATA	2	6	202042	202047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
953	NC_008212	TTA	2	6	202568	202573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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