MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790

Total Repeats: 16658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008212	GCG	2	6	1209105	1209110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_008212	CTC	2	6	1209187	1209192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6003	NC_008212	CCT	2	6	1209197	1209202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6004	NC_008212	AGT	2	6	1209204	1209209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_008212	CCG	2	6	1209244	1209249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6006	NC_008212	TCG	2	6	1209315	1209320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_008212	CGC	2	6	1209395	1209400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6008	NC_008212	ACG	2	6	1209412	1209417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_008212	TTAA	2	8	1209460	1209467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_008212	CA	3	6	1209497	1209502	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6011	NC_008212	CG	3	6	1209504	1209509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6012	NC_008212	TGG	2	6	1209560	1209565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_008212	CGC	2	6	1209630	1209635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6014	NC_008212	TAT	2	6	1209714	1209719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_008212	TTCA	2	8	1209756	1209763	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6016	NC_008212	CGTA	2	8	1209774	1209781	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6017	NC_008212	ATA	2	6	1209798	1209803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_008212	TAGT	2	8	1209811	1209818	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_008212	TGTA	2	8	1209901	1209908	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_008212	AT	3	6	1209956	1209961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_008212	GTTTAT	2	12	1209976	1209987	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_008212	AT	3	6	1209986	1209991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_008212	TA	3	6	1210047	1210052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_008212	TAT	3	9	1210083	1210091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_008212	GTC	2	6	1210093	1210098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_008212	ATT	2	6	1210133	1210138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_008212	TAA	2	6	1210168	1210173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_008212	TTA	3	9	1210347	1210355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_008212	ATT	2	6	1210378	1210383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_008212	AAT	2	6	1210403	1210408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_008212	AATAT	2	10	1211140	1211149	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_008212	ATTA	2	8	1211428	1211435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_008212	TA	3	6	1211434	1211439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_008212	TCT	2	6	1211459	1211464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_008212	TGGT	2	8	1211502	1211509	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_008212	CT	3	6	1211557	1211562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6037	NC_008212	GT	3	6	1211637	1211642	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_008212	CA	4	8	1211697	1211704	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6039	NC_008212	ATT	2	6	1211710	1211715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_008212	TTA	2	6	1211724	1211729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_008212	ATT	2	6	1211747	1211752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_008212	CTTCC	2	10	1211784	1211793	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
6043	NC_008212	TTC	2	6	1211812	1211817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_008212	ATAA	2	8	1211869	1211876	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_008212	GGT	2	6	1211986	1211991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_008212	GT	3	6	1212001	1212006	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_008212	CAT	2	6	1212048	1212053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_008212	TCT	2	6	1212063	1212068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_008212	TCCTC	2	10	1212178	1212187	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
6050	NC_008212	TC	3	6	1212199	1212204	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6051	NC_008212	AATCA	2	10	1213934	1213943	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6052	NC_008212	TAAT	2	8	1213947	1213954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_008212	GA	3	6	1213967	1213972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_008212	TA	3	6	1213984	1213989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_008212	ACTC	2	8	1214893	1214900	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6056	NC_008212	TCG	2	6	1214922	1214927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_008212	AG	3	6	1214945	1214950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_008212	ATA	2	6	1214959	1214964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_008212	TGA	2	6	1215747	1215752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_008212	CA	3	6	1215753	1215758	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6061	NC_008212	AG	3	6	1215861	1215866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_008212	AT	3	6	1215957	1215962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_008212	CAT	2	6	1215995	1216000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_008212	CAT	2	6	1216008	1216013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_008212	CAG	2	6	1216516	1216521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_008212	ATAAA	2	10	1216536	1216545	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_008212	GGA	2	6	1216563	1216568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_008212	GCG	2	6	1216610	1216615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_008212	CACGG	2	10	1216687	1216696	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6070	NC_008212	CGG	2	6	1216704	1216709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_008212	GAT	2	6	1216771	1216776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_008212	TCT	2	6	1216860	1216865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_008212	ATCCT	2	10	1216904	1216913	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6074	NC_008212	CAT	2	6	1217011	1217016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_008212	TGT	2	6	1217020	1217025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_008212	TTA	2	6	1217539	1217544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_008212	ATC	2	6	1217643	1217648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_008212	CTG	2	6	1217718	1217723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_008212	CA	3	6	1217751	1217756	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6080	NC_008212	GCT	2	6	1217841	1217846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_008212	ATA	2	6	1217884	1217889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_008212	AAC	2	6	1217891	1217896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6083	NC_008212	CTAT	2	8	1217934	1217941	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6084	NC_008212	ACGG	2	8	1217991	1217998	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6085	NC_008212	A	7	7	1218045	1218051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_008212	TTGAT	2	10	1218066	1218075	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_008212	CGG	2	6	1218979	1218984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_008212	CT	3	6	1219037	1219042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6089	NC_008212	ATT	2	6	1219332	1219337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_008212	ATG	2	6	1219353	1219358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_008212	TGT	2	6	1221066	1221071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_008212	TCA	2	6	1221089	1221094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_008212	AAAG	2	8	1221101	1221108	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_008212	AGCA	2	8	1221117	1221124	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6095	NC_008212	TGGGTC	2	12	1223615	1223626	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6096	NC_008212	TA	3	6	1223650	1223655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_008212	TCC	2	6	1224537	1224542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6098	NC_008212	CAT	3	9	1224621	1224629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_008212	CTT	2	6	1224717	1224722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_008212	CGG	2	6	1224762	1224767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_008212	CGTT	2	8	1224814	1224821	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6102	NC_008212	CAGTTT	2	12	1224822	1224833	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6103	NC_008212	ATT	2	6	1224841	1224846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_008212	ATAA	2	8	1224886	1224893	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_008212	CACT	2	8	1224928	1224935	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6106	NC_008212	TCG	2	6	1225012	1225017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_008212	TG	3	6	1225035	1225040	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_008212	ATTC	2	8	1225073	1225080	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6109	NC_008212	TC	3	6	1225991	1225996	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6110	NC_008212	ATTT	2	8	1226011	1226018	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_008212	ATCA	2	8	1226019	1226026	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6112	NC_008212	TGA	2	6	1226038	1226043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_008212	TCA	2	6	1226101	1226106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_008212	CAT	2	6	1226145	1226150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_008212	TG	3	6	1226155	1226160	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_008212	AAG	2	6	1226183	1226188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_008212	TGT	2	6	1226203	1226208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_008212	AGTTG	2	10	1226298	1226307	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_008212	CGCCT	3	15	1226423	1226437	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6120	NC_008212	CGAG	2	8	1226438	1226445	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6121	NC_008212	TA	3	6	1226492	1226497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_008212	TGC	2	6	1226558	1226563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_008212	CATG	2	8	1226647	1226654	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6124	NC_008212	GCG	2	6	1226704	1226709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_008212	AGCG	2	8	1226718	1226725	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6126	NC_008212	ATT	2	6	1226825	1226830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_008212	CTC	2	6	1226888	1226893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6128	NC_008212	CAC	2	6	1226919	1226924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6129	NC_008212	CGA	2	6	1226942	1226947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6130	NC_008212	TA	3	6	1227029	1227034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_008212	ACA	2	6	1227083	1227088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6132	NC_008212	GGA	2	6	1227161	1227166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6133	NC_008212	TAG	2	6	1227463	1227468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6135	NC_008212	GTT	2	6	1230225	1230230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6136	NC_008212	TAG	2	6	1230263	1230268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6154	NC_008212	CAACT	2	10	1235677	1235686	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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6263	NC_008212	GCCC	2	8	1249919	1249926	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6264	NC_008212	ACTG	2	8	1249981	1249988	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6265	NC_008212	ACT	2	6	1249995	1250000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6267	NC_008212	GGA	2	6	1250113	1250118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6268	NC_008212	GGA	2	6	1250139	1250144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6272	NC_008212	TCG	2	6	1252639	1252644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6274	NC_008212	TC	3	6	1252697	1252702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6275	NC_008212	ACC	2	6	1252733	1252738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6276	NC_008212	GTG	2	6	1254249	1254254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6283	NC_008212	GCTAT	2	10	1256617	1256626	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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6332	NC_008212	TCATA	2	10	1263932	1263941	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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6334	NC_008212	GTTG	2	8	1264086	1264093	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6380	NC_008212	GTCT	2	8	1270887	1270894	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6381	NC_008212	T	6	6	1270912	1270917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6384	NC_008212	ATCTC	2	10	1271641	1271650	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6385	NC_008212	CAG	2	6	1271651	1271656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6386	NC_008212	AGT	2	6	1271709	1271714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6387	NC_008212	TTAAT	2	10	1271717	1271726	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6388	NC_008212	T	6	6	1271757	1271762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6389	NC_008212	AT	3	6	1271767	1271772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6390	NC_008212	ATC	2	6	1271792	1271797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6392	NC_008212	ATC	2	6	1271946	1271951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6393	NC_008212	CGC	2	6	1272055	1272060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6394	NC_008212	TCA	2	6	1272078	1272083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6395	NC_008212	CAA	2	6	1272172	1272177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6396	NC_008212	CTC	2	6	1272178	1272183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6397	NC_008212	ACA	2	6	1272239	1272244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6398	NC_008212	CGC	2	6	1272248	1272253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6399	NC_008212	GCGGT	2	10	1273618	1273627	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6400	NC_008212	TCC	2	6	1273638	1273643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6401	NC_008212	GGA	3	9	1273654	1273662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6402	NC_008212	C	6	6	1274985	1274990	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6403	NC_008212	TAT	2	6	1275058	1275063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6404	NC_008212	TCGTAT	3	18	1275064	1275081	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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6406	NC_008212	TGATAT	4	24	1275169	1275192	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6407	NC_008212	AACA	2	8	1275326	1275333	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6408	NC_008212	GCA	2	6	1275336	1275341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6411	NC_008212	CTA	2	6	1275383	1275388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6414	NC_008212	A	8	8	1277267	1277274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6415	NC_008212	GAA	2	6	1277279	1277284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6416	NC_008212	TAT	3	9	1277289	1277297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6417	NC_008212	ATCA	2	8	1277311	1277318	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6418	NC_008212	GCGAG	2	10	1277343	1277352	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6419	NC_008212	CGTT	2	8	1277363	1277370	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6420	NC_008212	TAA	2	6	1277371	1277376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6423	NC_008212	GTG	2	6	1277583	1277588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6424	NC_008212	TTG	2	6	1278054	1278059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6425	NC_008212	AT	3	6	1278076	1278081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6426	NC_008212	GATCA	2	10	1278138	1278147	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6427	NC_008212	CAC	2	6	1278185	1278190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6429	NC_008212	CGT	2	6	1278277	1278282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6434	NC_008212	GTC	2	6	1278576	1278581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6452	NC_008212	CCG	2	6	1280078	1280083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6453	NC_008212	TGC	2	6	1280086	1280091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6480	NC_008212	AT	4	8	1282483	1282490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6487	NC_008212	CAGTC	2	10	1283319	1283328	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6488	NC_008212	TC	3	6	1283337	1283342	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6489	NC_008212	TCT	2	6	1283462	1283467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6496	NC_008212	GA	3	6	1284004	1284009	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6497	NC_008212	GTTGA	2	10	1284012	1284021	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6498	NC_008212	TTTCTG	5	30	1285147	1285176	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6499	NC_008212	AATGAC	7	42	1285198	1285239	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6500	NC_008212	GTT	2	6	1285283	1285288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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