MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790

Total Repeats: 16658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008212	TCGT	2	8	957507	957514	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4502	NC_008212	AGCG	2	8	957664	957671	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4503	NC_008212	TGG	2	6	957697	957702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_008212	CCA	2	6	957744	957749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4505	NC_008212	AAG	2	6	957753	957758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_008212	GAC	2	6	957795	957800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_008212	GTT	3	9	957807	957815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_008212	CGT	2	6	957924	957929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_008212	TG	3	6	957955	957960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_008212	TGT	2	6	957999	958004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_008212	AAT	2	6	958262	958267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_008212	T	6	6	958342	958347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_008212	GACGAA	2	12	958455	958466	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4514	NC_008212	GAC	2	6	958467	958472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_008212	GTG	2	6	958600	958605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_008212	ACG	2	6	958635	958640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_008212	GAG	2	6	958682	958687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_008212	GTA	2	6	958729	958734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_008212	AGA	2	6	958741	958746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_008212	AGT	2	6	958779	958784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_008212	TC	3	6	958785	958790	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4522	NC_008212	TTG	2	6	958824	958829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_008212	ACG	2	6	958956	958961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_008212	GAG	2	6	959013	959018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_008212	AC	3	6	959022	959027	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4526	NC_008212	TAA	2	6	961871	961876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_008212	GGTT	2	8	961904	961911	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_008212	ACG	2	6	961927	961932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_008212	TCG	2	6	961942	961947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_008212	ATT	2	6	962234	962239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_008212	GTT	2	6	962340	962345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_008212	AT	3	6	962368	962373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_008212	GCG	2	6	962520	962525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_008212	ATC	2	6	962546	962551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_008212	GTC	2	6	962666	962671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_008212	ATAC	2	8	962691	962698	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4537	NC_008212	CA	3	6	962717	962722	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4538	NC_008212	CGA	2	6	962766	962771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_008212	GGC	2	6	962773	962778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_008212	ATC	2	6	962803	962808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_008212	CGGT	2	8	962826	962833	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4542	NC_008212	AAC	2	6	962928	962933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_008212	CGC	2	6	962941	962946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4544	NC_008212	TAGGAG	2	12	962960	962971	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_008212	CGG	2	6	962975	962980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_008212	CAG	2	6	962992	962997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_008212	CACCCG	3	18	963001	963018	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
4548	NC_008212	AAC	2	6	963031	963036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_008212	CTGG	2	8	963051	963058	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4550	NC_008212	GGTGGG	2	12	963065	963076	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_008212	TCC	2	6	963110	963115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4552	NC_008212	GGA	3	9	963126	963134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_008212	AAAAC	2	10	963140	963149	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4554	NC_008212	GAT	2	6	965381	965386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_008212	AT	3	6	965415	965420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_008212	GA	3	6	965434	965439	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_008212	TGC	2	6	965461	965466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4558	NC_008212	ATT	2	6	965475	965480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_008212	ATG	2	6	965496	965501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_008212	AAT	2	6	965519	965524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_008212	TAT	2	6	965532	965537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_008212	ATT	2	6	966504	966509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_008212	GACA	2	8	966518	966525	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4564	NC_008212	TCA	2	6	966587	966592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_008212	TTA	2	6	969246	969251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_008212	TATG	2	8	969267	969274	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_008212	ACA	2	6	969275	969280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4568	NC_008212	CATA	2	8	969968	969975	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4569	NC_008212	A	7	7	969975	969981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_008212	AT	3	6	970095	970100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_008212	GTTC	2	8	970104	970111	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4572	NC_008212	GAAT	2	8	970112	970119	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_008212	CTGT	2	8	970132	970139	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4574	NC_008212	CGT	2	6	970620	970625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_008212	TA	3	6	970656	970661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_008212	CTT	2	6	970669	970674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4577	NC_008212	GAT	2	6	970717	970722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_008212	AT	3	6	970761	970766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_008212	AT	3	6	970771	970776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_008212	TAT	2	6	970789	970794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_008212	ATC	2	6	971026	971031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_008212	AT	3	6	971065	971070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_008212	TA	3	6	972490	972495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_008212	CATTCA	2	12	972551	972562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4585	NC_008212	A	6	6	972595	972600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_008212	CTG	2	6	972674	972679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_008212	TGA	2	6	973480	973485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_008212	ATA	2	6	973509	973514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_008212	ATATA	2	10	973528	973537	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_008212	TTG	2	6	973539	973544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_008212	TAC	3	9	975150	975158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4592	NC_008212	ATC	2	6	975179	975184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_008212	TTTCG	2	10	975192	975201	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4594	NC_008212	TTA	2	6	975243	975248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_008212	GT	3	6	975325	975330	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_008212	T	7	7	975374	975380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_008212	ATA	2	6	976695	976700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_008212	TGA	2	6	976724	976729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_008212	ATT	2	6	979126	979131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_008212	TTCA	2	8	979148	979155	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4601	NC_008212	ACG	2	6	979157	979162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_008212	GCTA	2	8	979209	979216	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4603	NC_008212	CAA	2	6	979228	979233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_008212	AT	4	8	979333	979340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_008212	AT	3	6	979358	979363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_008212	CTA	2	6	981161	981166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_008212	ATT	3	9	981180	981188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_008212	CTG	2	6	981209	981214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_008212	ATGAC	2	10	981216	981225	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4610	NC_008212	GCA	2	6	981915	981920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_008212	CATG	2	8	982809	982816	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4612	NC_008212	AAC	2	6	982863	982868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_008212	ATA	2	6	982910	982915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_008212	TAC	2	6	985104	985109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_008212	TCC	2	6	986188	986193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4616	NC_008212	T	6	6	986212	986217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_008212	AC	3	6	986548	986553	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4618	NC_008212	GTTA	2	8	986556	986563	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_008212	ATT	2	6	986579	986584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_008212	GCT	2	6	986891	986896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_008212	TA	3	6	986897	986902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_008212	TA	3	6	986914	986919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_008212	ATGC	2	8	986920	986927	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4624	NC_008212	ATT	2	6	986948	986953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_008212	ATA	2	6	987038	987043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_008212	GGT	2	6	987093	987098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_008212	TAT	2	6	987261	987266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_008212	AT	3	6	987265	987270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_008212	ATG	2	6	988076	988081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_008212	ACC	2	6	988122	988127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4631	NC_008212	CAT	2	6	988166	988171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4632	NC_008212	GACT	2	8	988266	988273	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4633	NC_008212	GTT	2	6	988275	988280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4635	NC_008212	ATT	2	6	989002	989007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4755	NC_008212	TCTAT	2	10	1006515	1006524	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4756	NC_008212	A	6	6	1006547	1006552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4757	NC_008212	AT	3	6	1006576	1006581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4758	NC_008212	TTAT	2	8	1006619	1006626	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4759	NC_008212	CTCA	2	8	1006642	1006649	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4760	NC_008212	TAAT	2	8	1006650	1006657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4761	NC_008212	TA	3	6	1006743	1006748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4762	NC_008212	A	6	6	1006752	1006757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4766	NC_008212	TTCC	2	8	1006962	1006969	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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