MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori HPAG1 chromosome

Total Repeats: 201

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008086	AC	3	6	60	65	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008086	CA	3	6	76	81	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008086	GA	8	16	8569	8584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008086	CA	3	6	17970	17975	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008086	AC	3	6	23994	23999	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008086	AG	3	6	27005	27010	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008086	TA	3	6	28641	28646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008086	AG	3	6	41693	41698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008086	TC	3	6	52654	52659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008086	TC	3	6	59726	59731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008086	AG	3	6	73158	73163	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008086	TA	5	10	79485	79494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008086	TC	3	6	81742	81747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008086	AG	3	6	86207	86212	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008086	AG	3	6	86232	86237	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008086	AG	3	6	94644	94649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008086	TA	3	6	98153	98158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008086	TG	3	6	104917	104922	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008086	TA	4	8	126543	126550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008086	AG	3	6	136155	136160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008086	GC	3	6	140388	140393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008086	GA	3	6	142426	142431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008086	TG	3	6	164500	164505	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008086	TC	3	6	165510	165515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008086	CA	3	6	165652	165657	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008086	TC	3	6	167693	167698	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008086	TA	3	6	176705	176710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008086	AT	3	6	176789	176794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008086	AT	3	6	183623	183628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008086	GA	3	6	183629	183634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008086	TC	3	6	188529	188534	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008086	TA	3	6	202694	202699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008086	AT	3	6	203497	203502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008086	AT	3	6	208290	208295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008086	GC	3	6	213042	213047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_008086	GT	3	6	236032	236037	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008086	AG	3	6	305782	305787	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008086	GA	3	6	330097	330102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008086	TA	3	6	331020	331025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008086	AG	3	6	331242	331247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008086	TG	3	6	333739	333744	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008086	AG	3	6	340174	340179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008086	TA	3	6	363874	363879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008086	TA	3	6	380888	380893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008086	AT	3	6	382832	382837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008086	AG	3	6	384525	384530	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008086	GA	4	8	394073	394080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008086	GT	3	6	418478	418483	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008086	AT	3	6	434084	434089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008086	GA	3	6	434151	434156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008086	TA	3	6	446905	446910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008086	GC	3	6	446997	447002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008086	TA	4	8	461520	461527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008086	AT	3	6	475020	475025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008086	GA	3	6	495758	495763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008086	TG	3	6	503138	503143	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008086	AT	3	6	520203	520208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008086	AT	4	8	530292	530299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008086	AG	4	8	530506	530513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008086	AG	3	6	532105	532110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008086	AC	3	6	533896	533901	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_008086	GA	3	6	534206	534211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008086	CT	3	6	544268	544273	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008086	AT	3	6	545645	545650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008086	AC	4	8	545668	545675	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008086	GT	3	6	545971	545976	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008086	CT	3	6	550038	550043	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008086	AC	3	6	556982	556987	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_008086	AT	3	6	561087	561092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008086	TA	3	6	566741	566746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008086	TA	3	6	573973	573978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008086	TC	3	6	590731	590736	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_008086	AT	3	6	592489	592494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008086	TA	3	6	664085	664090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008086	AT	3	6	664091	664096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008086	TA	3	6	679640	679645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008086	TA	3	6	703944	703949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008086	CG	4	8	707055	707062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_008086	AG	3	6	730052	730057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008086	CT	8	16	741756	741771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_008086	CT	3	6	743642	743647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_008086	AG	3	6	776143	776148	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008086	GA	4	8	802514	802521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008086	TC	3	6	807430	807435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_008086	TC	3	6	816966	816971	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_008086	AT	3	6	844918	844923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008086	GC	3	6	870922	870927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_008086	TG	3	6	870987	870992	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008086	AC	3	6	890842	890847	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008086	TG	3	6	896882	896887	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008086	TG	3	6	897314	897319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008086	TA	3	6	904011	904016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008086	AT	3	6	911976	911981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008086	TG	3	6	912661	912666	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008086	GC	3	6	919082	919087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_008086	CT	3	6	954401	954406	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_008086	AG	3	6	962250	962255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008086	TC	3	6	962268	962273	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_008086	GC	3	6	963602	963607	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_008086	TA	3	6	963872	963877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008086	AG	3	6	972247	972252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008086	CT	3	6	972656	972661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_008086	CT	3	6	985557	985562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_008086	AG	5	10	992332	992341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008086	CT	3	6	1004895	1004900	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_008086	GA	3	6	1010119	1010124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008086	GT	3	6	1011441	1011446	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008086	CT	3	6	1011683	1011688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_008086	CT	3	6	1011954	1011959	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_008086	TA	3	6	1011989	1011994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008086	TA	3	6	1013104	1013109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008086	CT	3	6	1013629	1013634	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_008086	CA	3	6	1013751	1013756	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_008086	GT	3	6	1013854	1013859	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008086	CA	3	6	1014175	1014180	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_008086	AT	3	6	1015283	1015288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008086	CA	3	6	1015523	1015528	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_008086	AT	3	6	1015735	1015740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008086	CT	3	6	1016419	1016424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_008086	CT	3	6	1016539	1016544	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_008086	TC	3	6	1017864	1017869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_008086	CT	3	6	1021382	1021387	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_008086	GT	3	6	1076707	1076712	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008086	AT	3	6	1088077	1088082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008086	AT	3	6	1094074	1094079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008086	TG	3	6	1106435	1106440	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008086	GA	3	6	1113005	1113010	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008086	CT	3	6	1114885	1114890	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_008086	AC	3	6	1118384	1118389	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_008086	TG	4	8	1138567	1138574	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008086	GT	3	6	1138810	1138815	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008086	TC	3	6	1139041	1139046	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_008086	GA	3	6	1139195	1139200	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008086	GT	3	6	1139705	1139710	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008086	AG	3	6	1140651	1140656	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008086	AT	3	6	1163285	1163290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008086	AG	3	6	1163308	1163313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008086	TC	3	6	1164973	1164978	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_008086	AT	3	6	1170505	1170510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008086	GA	3	6	1174205	1174210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008086	TA	3	6	1188668	1188673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008086	TA	4	8	1190114	1190121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008086	TA	3	6	1191464	1191469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008086	CT	3	6	1191637	1191642	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_008086	TC	3	6	1191692	1191697	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_008086	AG	3	6	1196135	1196140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008086	AG	3	6	1196225	1196230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008086	TA	3	6	1213010	1213015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008086	CT	3	6	1217726	1217731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_008086	AT	3	6	1218335	1218340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008086	CT	3	6	1218458	1218463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_008086	AC	3	6	1232121	1232126	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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154	NC_008086	TC	3	6	1244254	1244259	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.