MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori HPAG1 chromosome

Total Repeats: 432

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008086	AAAC	2	8	1308	1315	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008086	ATGC	2	8	5809	5816	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_008086	TAAG	2	8	8648	8655	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008086	TTTG	2	8	8742	8749	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008086	ATAA	2	8	10956	10963	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008086	TATT	2	8	11155	11162	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008086	ATTC	2	8	11170	11177	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_008086	AAAG	2	8	11206	11213	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008086	TTAA	2	8	14982	14989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008086	ATCA	2	8	24008	24015	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_008086	GCTT	2	8	24393	24400	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008086	TTTG	2	8	24478	24485	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008086	GATT	2	8	26705	26712	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008086	TAAG	2	8	26743	26750	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008086	GCTT	2	8	27112	27119	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_008086	GGTT	2	8	33035	33042	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008086	CAAA	2	8	45319	45326	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_008086	TTGA	2	8	53538	53545	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008086	AAAT	2	8	53577	53584	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008086	TTTA	2	8	58900	58907	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008086	TAAT	2	8	59000	59007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008086	AAAT	2	8	59109	59116	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008086	ACAA	2	8	59198	59205	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_008086	CTTT	2	8	59744	59751	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008086	CAAA	2	8	73026	73033	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_008086	TGTA	2	8	75689	75696	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008086	TAGA	2	8	77824	77831	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008086	TATT	2	8	79518	79525	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008086	CGTT	2	8	84035	84042	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008086	TTTG	2	8	87204	87211	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008086	GGTG	2	8	94436	94443	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008086	TCCC	2	8	94506	94513	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_008086	TTCA	2	8	100003	100010	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_008086	TGAT	2	8	101647	101654	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008086	AACA	2	8	108387	108394	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008086	TTCA	2	8	110854	110861	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_008086	AACA	2	8	112972	112979	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008086	AGCA	2	8	113822	113829	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_008086	CCGC	2	8	113844	113851	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40	NC_008086	AAAT	2	8	115757	115764	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008086	ATTT	2	8	117289	117296	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008086	TGAA	2	8	120280	120287	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008086	TCAT	2	8	121965	121972	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_008086	GATT	2	8	128067	128074	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008086	TATT	2	8	128075	128082	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008086	GTTA	2	8	130687	130694	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008086	AAAG	2	8	133608	133615	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008086	AAAG	2	8	134103	134110	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008086	GAAG	2	8	134160	134167	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008086	AATC	2	8	135327	135334	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008086	CTTG	2	8	135943	135950	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_008086	GTGG	2	8	135951	135958	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008086	TAAA	2	8	137515	137522	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008086	TTGT	2	8	137616	137623	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008086	ATTT	2	8	140394	140401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008086	TAAG	2	8	145956	145963	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008086	TTAA	2	8	164411	164418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008086	ATTT	2	8	164436	164443	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008086	TCAA	2	8	165870	165877	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_008086	ATAC	2	8	176827	176834	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_008086	GAAA	2	8	180162	180169	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008086	GATT	2	8	183495	183502	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008086	ATCA	2	8	189070	189077	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_008086	TAAG	2	8	199483	199490	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008086	CAAC	2	8	202781	202788	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008086	AAAC	2	8	202982	202989	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_008086	GAGC	2	8	211565	211572	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_008086	GTTT	2	8	211583	211590	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008086	GTTT	2	8	216222	216229	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008086	TTGA	2	8	216238	216245	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008086	TATT	2	8	225074	225081	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008086	AAGA	2	8	234711	234718	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008086	TTTA	2	8	237643	237650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008086	AACA	2	8	242399	242406	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_008086	GGTT	2	8	242573	242580	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008086	CTTT	2	8	252890	252897	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_008086	TAAT	2	8	258867	258874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008086	AAAG	2	8	258912	258919	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008086	TGAT	2	8	268573	268580	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008086	ATGA	2	8	269200	269207	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008086	CATT	2	8	308444	308451	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_008086	AACA	2	8	312145	312152	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_008086	TTAA	2	8	312965	312972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008086	GTTT	2	8	320476	320483	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008086	ACTG	2	8	325095	325102	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_008086	TGAA	2	8	329668	329675	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008086	CATT	2	8	333628	333635	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_008086	TTGG	2	8	336571	336578	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008086	AAAT	2	8	344907	344914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008086	TGAA	2	8	354365	354372	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008086	AGAA	2	8	363458	363465	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008086	TTAA	2	8	376381	376388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008086	TAAA	2	8	376392	376399	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008086	TTAT	2	8	380916	380923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008086	TTTG	2	8	380982	380989	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008086	CAAA	2	8	386424	386431	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_008086	GTTT	2	8	393354	393361	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008086	AAAG	2	8	393437	393444	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008086	TTTC	2	8	397651	397658	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_008086	GGGT	2	8	399541	399548	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008086	GAAA	2	8	399599	399606	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008086	AACA	2	8	399612	399619	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_008086	TTGA	2	8	410287	410294	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008086	AGGG	2	8	412401	412408	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008086	CCAA	2	8	413759	413766	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_008086	AAAT	2	8	414821	414828	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008086	AAGC	2	8	414964	414971	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_008086	AAAT	2	8	420298	420305	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008086	TCAA	2	8	429260	429267	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_008086	TCAA	2	8	431793	431800	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_008086	TTTG	2	8	446890	446897	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008086	CACC	2	8	446981	446988	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
113	NC_008086	AAAT	2	8	447136	447143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008086	TCTT	2	8	452504	452511	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_008086	TAAA	2	8	461496	461503	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008086	ATTT	2	8	482362	482369	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008086	ACCA	2	8	482415	482422	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_008086	TCAT	2	8	482655	482662	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_008086	AAAT	2	8	483863	483870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008086	TTGA	2	8	493391	493398	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008086	GATT	2	8	497512	497519	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008086	GAAT	2	8	497527	497534	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008086	CTAA	2	8	503199	503206	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_008086	TTAG	2	8	503223	503230	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008086	TTTA	2	8	503319	503326	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008086	TGAT	2	8	505277	505284	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008086	TTAC	2	8	507522	507529	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_008086	TCAA	2	8	511813	511820	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_008086	GTTG	2	8	530198	530205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008086	GTTT	2	8	532256	532263	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008086	CAAA	2	8	533243	533250	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_008086	CAAA	2	8	533773	533780	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_008086	AGCT	2	8	533997	534004	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_008086	TGTT	2	8	534393	534400	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008086	TTTG	2	8	534608	534615	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008086	CAAA	2	8	534623	534630	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_008086	CAAG	2	8	534741	534748	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_008086	TTAC	2	8	534777	534784	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_008086	AATC	2	8	545266	545273	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_008086	TTTG	2	8	545354	545361	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008086	ATTA	2	8	550925	550932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008086	ATTG	2	8	556119	556126	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008086	TTTC	2	8	556608	556615	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_008086	TTCA	2	8	556667	556674	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_008086	CAAA	2	8	556708	556715	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_008086	GTTG	2	8	556820	556827	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008086	CATT	2	8	559832	559839	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_008086	ACTA	2	8	562521	562528	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_008086	CGTT	2	8	562800	562807	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_008086	ATTT	2	8	590776	590783	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008086	CCAT	2	8	592777	592784	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_008086	TTTA	2	8	599817	599824	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.