MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Hahella chejuensis KCTC 2396 chromosome

Total Repeats: 208

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007645	AAAAAC	2	12	35708	35719	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_007645	AACAAG	2	12	52201	52212	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_007645	TTTTTG	2	12	62193	62204	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007645	ACTCCG	2	12	64662	64673	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_007645	ATATTA	2	12	73536	73547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007645	ATCAAA	2	12	95423	95434	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_007645	TACCCA	2	12	176826	176837	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_007645	TAGCGA	2	12	222371	222382	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_007645	AGACTT	2	12	241446	241457	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_007645	TCTTTT	2	12	288033	288044	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_007645	GATCAG	2	12	318108	318119	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_007645	AGGGGG	2	12	364948	364959	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007645	TCCCTG	2	12	431434	431445	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14	NC_007645	TGAGCG	2	12	431666	431677	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_007645	TGCGAG	2	12	440259	440270	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_007645	AAATAA	2	12	582784	582795	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007645	GCAGAC	2	12	585981	585992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007645	TTCTGT	2	12	589664	589675	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_007645	AAAGCC	2	12	605777	605788	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007645	TCTGTA	2	12	626638	626649	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_007645	TTGAGT	2	12	628824	628835	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007645	GAAAAA	2	12	638587	638598	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007645	CTGTGG	2	12	690853	690864	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_007645	CAATAA	2	12	752052	752063	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_007645	TATCCC	2	12	853227	853238	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_007645	AGCGCG	2	12	858063	858074	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007645	ATATTA	2	12	936512	936523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007645	TTATCA	2	12	952597	952608	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_007645	GTTGGG	2	12	970161	970172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007645	CTTTTC	2	12	992324	992335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007645	TTGTAT	2	12	1083870	1083881	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007645	TTGGCG	2	12	1277541	1277552	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_007645	TGGCGT	2	12	1301436	1301447	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_007645	GTATGA	2	12	1319346	1319357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007645	CTCCAG	2	12	1332828	1332839	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
36	NC_007645	GAATCG	2	12	1345556	1345567	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_007645	ATGCGC	2	12	1350761	1350772	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007645	AGGTGT	2	12	1350951	1350962	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007645	TTTAAA	2	12	1364940	1364951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007645	CTCTAT	2	12	1383980	1383991	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007645	AATAAA	2	12	1384560	1384571	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007645	AATGAT	2	12	1406098	1406109	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007645	CCTAAT	2	12	1456416	1456427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007645	TGAAAT	2	12	1592510	1592521	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007645	GGTTTG	2	12	1683057	1683068	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007645	CTTTAC	2	12	1688134	1688145	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007645	GTATTC	2	12	1718397	1718408	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_007645	AACGGC	2	12	1852237	1852248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007645	TTTACC	2	12	1855388	1855399	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007645	AGCTCA	2	12	1892032	1892043	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007645	TGAAAT	2	12	1904192	1904203	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007645	CGTCGA	2	12	1931258	1931269	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007645	AAGTCT	2	12	2017765	2017776	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_007645	AAATAA	2	12	2019703	2019714	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007645	TTATAT	2	12	2066246	2066257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007645	TTGGCG	2	12	2089627	2089638	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_007645	TATGGC	2	12	2147355	2147366	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_007645	TGTGAG	2	12	2162416	2162427	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007645	TGAAAT	2	12	2263642	2263653	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007645	ACAGCT	2	12	2302595	2302606	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007645	AATTAA	2	12	2302675	2302686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007645	CTGACA	2	12	2323650	2323661	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007645	GGAAGT	2	12	2455540	2455551	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007645	GGATTG	2	12	2455561	2455572	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007645	GGAAAT	2	12	2477837	2477848	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007645	AATTTT	2	12	2499307	2499318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007645	GTTAAC	2	12	2525569	2525580	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_007645	GTTAAC	2	12	2525705	2525716	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_007645	GAACTC	2	12	2529453	2529464	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007645	TACTGA	2	12	2545992	2546003	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_007645	CCGGGG	2	12	2633108	2633119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007645	GGTTGT	8	48	2635259	2635306	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007645	TGGGCA	2	12	2636907	2636918	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_007645	CTCTTT	2	12	2777606	2777617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007645	CTAAGC	2	12	2819210	2819221	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_007645	GGTATG	2	12	2845512	2845523	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007645	GAAGCG	2	12	2909530	2909541	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_007645	GAAAAA	2	12	2919985	2919996	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007645	CGGGAA	2	12	2948361	2948372	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_007645	TTATTG	2	12	3027720	3027731	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007645	CAGCGC	2	12	3094473	3094484	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007645	GTCGGA	2	12	3155117	3155128	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_007645	GATAAG	2	12	3162120	3162131	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007645	ACTGAA	2	12	3173691	3173702	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_007645	CGAAGG	2	12	3185710	3185721	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_007645	ATCAGA	2	12	3222818	3222829	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_007645	GTTTTT	2	12	3256290	3256301	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007645	ATTTAT	2	12	3268025	3268036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007645	CTTCGG	2	12	3278716	3278727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_007645	AATCTT	2	12	3337137	3337148	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_007645	GAGAGG	2	12	3363527	3363538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007645	TTAATA	2	12	3367062	3367073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007645	TTTCAA	2	12	3384249	3384260	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_007645	ATTTTA	2	12	3423578	3423589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007645	TGCGCA	2	12	3429418	3429429	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_007645	ATGCGC	2	12	3458252	3458263	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_007645	GAAACT	2	12	3458350	3458361	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_007645	ATTTTT	2	12	3484346	3484357	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007645	CAATCA	2	12	3491205	3491216	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007645	CGCATT	4	24	3491438	3491461	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007645	AAGTCG	2	12	3511336	3511347	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_007645	AGTGAT	2	12	3524924	3524935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007645	AAAGGC	2	12	3615655	3615666	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_007645	CGTCAT	2	12	3688083	3688094	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_007645	AAAACG	2	12	3707490	3707501	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_007645	CAATTC	2	12	3715952	3715963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007645	ACGCCA	2	12	3736811	3736822	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
108	NC_007645	CGCCTG	2	12	3747303	3747314	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
109	NC_007645	TGACGT	2	12	3831990	3832001	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_007645	CGTCGC	2	12	3848938	3848949	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
111	NC_007645	AGGTAT	2	12	3859314	3859325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007645	GCATTA	2	12	3924289	3924300	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_007645	CATTTG	2	12	3927008	3927019	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_007645	CAACCA	2	12	3934120	3934131	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_007645	TGGGTT	2	12	3952392	3952403	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007645	ATATTA	2	12	4007561	4007572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007645	AAATTA	2	12	4023480	4023491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007645	TCCTAT	2	12	4054374	4054385	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007645	ACGTAA	2	12	4081777	4081788	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_007645	GGAGGC	2	12	4126702	4126713	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_007645	TTTTAT	2	12	4130991	4131002	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007645	AAAATC	2	12	4144890	4144901	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_007645	AATAAC	2	12	4158689	4158700	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_007645	TTTCTT	2	12	4165408	4165419	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_007645	AGTTTC	2	12	4178208	4178219	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.