MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Haemophilus influenzae 86-028NP chromosome

Total Repeats: 309

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007146	AAAAC	2	10	17994	18003	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_007146	TTAAA	2	10	21203	21212	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007146	AACAT	2	10	27986	27995	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_007146	ATAAA	2	10	30164	30173	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007146	TATGA	2	10	56104	56113	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007146	ATTTA	2	10	79180	79189	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007146	CGTTA	2	10	96795	96804	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_007146	CTTTT	2	10	104331	104340	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_007146	GCCTT	2	10	104472	104481	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_007146	TCTTT	2	10	113650	113659	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_007146	TTTAA	2	10	129642	129651	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007146	GCCTT	2	10	134061	134070	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_007146	TATAT	2	10	137391	137400	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007146	AACAA	2	10	139921	139930	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_007146	ATTTC	2	10	141713	141722	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_007146	AAATG	2	10	142453	142462	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007146	AAAAT	2	10	148955	148964	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007146	CAATT	2	10	160208	160217	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_007146	GTTTT	2	10	160586	160595	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007146	CTGAA	2	10	160671	160680	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_007146	AAACT	2	10	188637	188646	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_007146	GTCTA	2	10	188674	188683	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_007146	TTAAT	2	10	189211	189220	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007146	TAACC	2	10	191080	191089	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_007146	CGACT	2	10	191523	191532	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_007146	TCGGT	2	10	191898	191907	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_007146	TCGCT	2	10	192125	192134	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_007146	GCTTC	2	10	193493	193502	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_007146	TTCAA	2	10	194747	194756	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_007146	AAGAT	2	10	195022	195031	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007146	AAAAG	2	10	197582	197591	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007146	AAAAG	2	10	203036	203045	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007146	TAACT	2	10	204654	204663	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_007146	AAATA	2	10	206004	206013	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007146	AAAGA	2	10	214084	214093	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007146	CTGTT	2	10	219865	219874	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_007146	TTAAT	2	10	223398	223407	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007146	TACAA	2	10	226688	226697	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_007146	TGGTC	2	10	233393	233402	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_007146	CAAAG	2	10	235590	235599	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_007146	ATCAA	2	10	235746	235755	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_007146	ATAAG	2	10	236712	236721	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007146	AAAAT	2	10	248888	248897	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007146	TCTTT	2	10	258955	258964	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_007146	GTTGA	2	10	262612	262621	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007146	TCACA	2	10	263182	263191	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_007146	TAATT	2	10	284307	284316	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007146	AATAA	2	10	286897	286906	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007146	TTCAA	2	10	287691	287700	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_007146	TAAAA	2	10	302943	302952	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007146	TAACC	2	10	307603	307612	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_007146	CGACT	2	10	308046	308055	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_007146	TCGGT	2	10	308421	308430	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_007146	TCGCT	2	10	308648	308657	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_007146	GCTTC	2	10	310016	310025	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_007146	TTCAA	2	10	311270	311279	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_007146	CTTTT	2	10	333449	333458	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_007146	TTGAA	2	10	337338	337347	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007146	ATCTT	2	10	342384	342393	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_007146	TTTTA	2	10	346061	346070	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007146	AATCT	2	10	350777	350786	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_007146	ATTTT	2	10	351027	351036	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007146	TTTTC	2	10	372002	372011	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_007146	TTTCT	2	10	375892	375901	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_007146	TTTAT	2	10	376750	376759	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007146	AATTA	2	10	408842	408851	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007146	TGTAT	2	10	408950	408959	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007146	AATAA	2	10	414270	414279	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007146	AATTA	2	10	414891	414900	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007146	TTATT	2	10	420698	420707	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007146	GTTTT	2	10	421620	421629	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007146	TAAAG	2	10	421684	421693	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007146	ATTTA	2	10	421702	421711	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007146	TGTTT	2	10	437822	437831	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007146	AATAA	2	10	447534	447543	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007146	TTTTC	2	10	448926	448935	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_007146	TGGAA	2	10	455733	455742	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007146	AAAAC	2	10	470905	470914	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_007146	AACAA	2	10	490954	490963	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_007146	ATCAT	2	10	501970	501979	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_007146	TTTTA	2	10	505217	505226	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007146	TTATA	2	10	505309	505318	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007146	TTTAT	2	10	505914	505923	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007146	CCTGA	2	10	509654	509663	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_007146	TGTTC	2	10	513283	513292	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_007146	TTTTC	2	10	513527	513536	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_007146	TTCAT	2	10	520296	520305	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_007146	TAAGT	2	10	546655	546664	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007146	AAAAT	2	10	546671	546680	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007146	TAAGT	2	10	547217	547226	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007146	TAGTC	2	10	556329	556338	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_007146	GAAAA	2	10	560202	560211	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007146	AAGTT	2	10	575384	575393	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007146	AAGGA	2	10	580448	580457	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007146	TTATC	2	10	587782	587791	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_007146	AATTT	2	10	594385	594394	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007146	AGTTA	2	10	610129	610138	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007146	GTTAA	2	10	616849	616858	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007146	AAAAT	2	10	621252	621261	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007146	AATTA	2	10	621272	621281	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007146	TTTTA	2	10	634985	634994	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007146	AAGAA	2	10	650949	650958	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007146	AAAGT	2	10	652748	652757	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007146	TGAAT	2	10	656325	656334	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007146	GAAAG	2	10	658849	658858	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007146	AGAAT	2	10	663405	663414	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007146	CTTTT	2	10	667220	667229	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_007146	ATTTG	2	10	677753	677762	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007146	TAACC	2	10	680458	680467	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_007146	CGACT	2	10	680901	680910	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_007146	TCGGT	2	10	681276	681285	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_007146	TCGCT	2	10	681503	681512	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_007146	GTTTT	2	10	682240	682249	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007146	AAATT	2	10	682406	682415	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007146	GCTTC	2	10	683110	683119	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_007146	TTCAA	2	10	684364	684373	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_007146	TTTTA	2	10	685555	685564	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007146	TATCA	2	10	688522	688531	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_007146	TAAAA	2	10	692602	692611	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007146	ATATT	2	10	694233	694242	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007146	CTCGC	2	10	694245	694254	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
122	NC_007146	ATTGG	2	10	695190	695199	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007146	TTGAA	2	10	695510	695519	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007146	TCAGT	2	10	696022	696031	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_007146	AAAAT	2	10	696052	696061	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007146	ATTTG	2	10	703759	703768	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007146	AAAAG	2	10	710804	710813	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007146	ATTTA	2	10	722076	722085	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007146	TAAAA	2	10	724542	724551	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007146	TTTTA	2	10	744434	744443	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007146	ATTAA	2	10	744598	744607	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007146	TTTCT	2	10	746067	746076	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_007146	TTTTA	2	10	748806	748815	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007146	TTTAT	2	10	755400	755409	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007146	GCAAA	2	10	755456	755465	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_007146	CAAAG	2	10	755814	755823	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_007146	ACATT	2	10	755951	755960	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_007146	AATAA	2	10	768122	768131	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007146	GCTTG	2	10	770256	770265	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_007146	TCTCT	2	10	781984	781993	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_007146	CTTTT	2	10	793053	793062	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_007146	AATTT	2	10	794570	794579	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007146	TTTTG	2	10	794651	794660	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007146	GAAAA	2	10	799545	799554	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007146	TTACA	2	10	802035	802044	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_007146	TTGAA	2	10	805802	805811	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007146	GAAGC	2	10	807056	807065	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
148	NC_007146	AGCGA	2	10	808424	808433	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
149	NC_007146	AGTCG	2	10	809026	809035	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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289	NC_007146	AGGGA	2	10	1830426	1830435	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
290	NC_007146	TAATT	2	10	1830484	1830493	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_007146	ATTTT	2	10	1835037	1835046	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_007146	TATGC	2	10	1841930	1841939	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
293	NC_007146	TAAAT	2	10	1849314	1849323	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_007146	TCAAA	2	10	1855071	1855080	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
295	NC_007146	GAAAA	2	10	1861694	1861703	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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297	NC_007146	CTAAA	2	10	1870376	1870385	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
298	NC_007146	TGGCG	2	10	1873236	1873245	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
299	NC_007146	CAAAA	2	10	1877088	1877097	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
300	NC_007146	CTTAT	2	10	1883044	1883053	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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307	NC_007146	AAATT	2	10	1904493	1904502	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
308	NC_007146	GCTTC	2	10	1905197	1905206	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
309	NC_007146	TTCAA	2	10	1906451	1906460	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.