MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome II

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006397	GTGGC	2	10	777	786	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_006397	ACCCA	2	10	5610	5619	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
3	NC_006397	GGGAG	2	10	5688	5697	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006397	TCCAA	2	10	9310	9319	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_006397	CTGGC	2	10	11379	11388	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_006397	TGGGA	2	10	11777	11786	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006397	GTAGA	2	10	14273	14282	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006397	TGAAA	2	10	14348	14357	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006397	CACGA	2	10	25372	25381	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_006397	AGATG	2	10	27453	27462	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006397	TAGAA	2	10	35650	35659	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006397	TGTGC	2	10	35774	35783	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_006397	TTGAG	2	10	40703	40712	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006397	ATAGA	2	10	40753	40762	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006397	CGGAT	2	10	47435	47444	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_006397	GCTGC	2	10	52085	52094	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_006397	AACAT	2	10	52300	52309	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_006397	CGTCT	2	10	60095	60104	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_006397	TACGA	2	10	67971	67980	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_006397	CGCTC	2	10	71669	71678	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_006397	AGGTT	2	10	71852	71861	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006397	CATAG	2	10	74382	74391	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_006397	TAGAG	2	10	80818	80827	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006397	TCCGA	2	10	82518	82527	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_006397	ACCGG	2	10	85182	85191	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_006397	GTCGA	2	10	115915	115924	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_006397	AGCTT	2	10	117889	117898	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_006397	GTCCA	2	10	122093	122102	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_006397	ACACT	2	10	155160	155169	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_006397	GACCA	2	10	157822	157831	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_006397	ACTGA	2	10	158186	158195	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_006397	GCCAT	2	10	158680	158689	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_006397	GCAGG	2	10	164382	164391	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
34	NC_006397	AATAG	2	10	186460	186469	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006397	CCCGA	2	10	196023	196032	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
36	NC_006397	CCCAC	2	10	225385	225394	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
37	NC_006397	CCACC	2	10	225410	225419	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
38	NC_006397	TAGCG	2	10	228955	228964	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_006397	ACAAA	2	10	234605	234614	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_006397	CGGGG	2	10	235505	235514	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
41	NC_006397	TTGTT	2	10	243857	243866	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006397	CGGGA	2	10	260138	260147	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
43	NC_006397	TGGAT	2	10	277491	277500	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006397	TCGGA	2	10	281020	281029	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_006397	ACACA	2	10	283367	283376	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.