MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome I

Total Repeats: 5419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006396	GCG	2	6	1001	1006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_006396	TCG	2	6	4681	4686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_006396	CGA	2	6	4714	4719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_006396	CGT	2	6	4726	4731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_006396	CCA	2	6	4803	4808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_006396	ATT	2	6	4944	4949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006396	CGG	2	6	4972	4977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_006396	GAA	2	6	5011	5016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006396	ACC	2	6	5118	5123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_006396	CGC	2	6	5232	5237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_006396	CGA	2	6	5660	5665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_006396	GTA	2	6	6507	6512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006396	AAT	2	6	6516	6521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006396	GAT	2	6	6620	6625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006396	CCG	2	6	7739	7744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_006396	GCC	2	6	8020	8025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_006396	GCT	2	6	8043	8048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_006396	CGA	2	6	8070	8075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_006396	GAA	2	6	8110	8115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006396	ACC	2	6	9516	9521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_006396	CCG	2	6	9543	9548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_006396	ACA	2	6	9584	9589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_006396	GCC	2	6	9618	9623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_006396	GAC	2	6	9647	9652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_006396	CCA	2	6	9698	9703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_006396	TAG	2	6	10433	10438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006396	CGA	2	6	10486	10491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_006396	ATC	2	6	11689	11694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_006396	AAC	2	6	11709	11714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_006396	TTA	2	6	11718	11723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006396	CGA	2	6	14822	14827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_006396	ACG	2	6	14899	14904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_006396	CGG	2	6	15355	15360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_006396	GGC	2	6	20357	20362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_006396	TGA	2	6	20423	20428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006396	CGC	3	9	23535	23543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_006396	ACA	2	6	24704	24709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_006396	TAT	2	6	24733	24738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006396	CTA	2	6	24797	24802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_006396	GGC	2	6	25402	25407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_006396	CAG	2	6	25445	25450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_006396	CGT	2	6	25581	25586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_006396	GCG	2	6	25590	25595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_006396	CCA	2	6	27244	27249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_006396	TAT	2	6	27311	27316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006396	CGG	2	6	27410	27415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_006396	TGC	2	6	27421	27426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_006396	CGT	2	6	27427	27432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_006396	CGC	2	6	27500	27505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_006396	ACG	3	9	27526	27534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_006396	CGC	2	6	27565	27570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_006396	GAC	2	6	31933	31938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_006396	GCG	2	6	31966	31971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_006396	GCC	2	6	32546	32551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_006396	GTC	2	6	32595	32600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_006396	GTA	2	6	33495	33500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006396	GTC	2	6	33543	33548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_006396	TAT	2	6	33675	33680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006396	CCG	2	6	34043	34048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_006396	ACG	2	6	34074	34079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_006396	CGG	2	6	36199	36204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_006396	GAA	2	6	36799	36804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006396	CGT	2	6	36833	36838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_006396	CGT	2	6	37624	37629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_006396	CGT	3	9	37653	37661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_006396	TCC	2	6	37821	37826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_006396	CTG	2	6	37832	37837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_006396	CGT	2	6	37871	37876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_006396	TCG	2	6	37942	37947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_006396	CTG	2	6	38844	38849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_006396	CAG	2	6	38885	38890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_006396	ACA	2	6	38949	38954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_006396	CAA	2	6	41385	41390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_006396	TGC	2	6	45761	45766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_006396	ACG	2	6	45818	45823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_006396	CGG	2	6	47267	47272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_006396	GTC	2	6	47293	47298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_006396	TTC	2	6	47611	47616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_006396	GCA	2	6	48744	48749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_006396	GAC	2	6	48758	48763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_006396	TGA	2	6	49209	49214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006396	TGC	2	6	49376	49381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_006396	ACG	2	6	49485	49490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_006396	CAC	2	6	51753	51758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_006396	GGA	2	6	51932	51937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006396	CGG	2	6	56008	56013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_006396	ACT	2	6	56036	56041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_006396	AGT	2	6	56495	56500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006396	CGT	2	6	57867	57872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_006396	GTC	2	6	62212	62217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_006396	CGT	2	6	62329	62334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_006396	AAG	2	6	63880	63885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006396	GCC	2	6	63918	63923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_006396	GGC	2	6	63939	63944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_006396	CGG	2	6	63952	63957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_006396	CGT	2	6	64066	64071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_006396	CGG	2	6	67868	67873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_006396	GCG	2	6	67879	67884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_006396	GAC	2	6	67892	67897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_006396	CGG	2	6	67930	67935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_006396	CGG	2	6	68003	68008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_006396	GTG	2	6	68881	68886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006396	CGA	2	6	68906	68911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_006396	GGT	2	6	68919	68924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006396	GCC	2	6	70705	70710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_006396	TCG	2	6	73165	73170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_006396	AGA	2	6	73214	73219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006396	GGT	2	6	73287	73292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006396	GTT	2	6	73321	73326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006396	CAG	2	6	73858	73863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_006396	CGT	2	6	73879	73884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_006396	TTA	2	6	75440	75445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006396	TAA	2	6	81828	81833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006396	CCG	2	6	81871	81876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_006396	ATT	3	9	83515	83523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006396	TTC	2	6	83529	83534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_006396	CAG	2	6	83598	83603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_006396	TGA	2	6	87704	87709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006396	CGG	2	6	87770	87775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_006396	AGG	2	6	87796	87801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006396	CCG	2	6	89243	89248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_006396	ACC	2	6	89265	89270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_006396	CGA	2	6	89736	89741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_006396	CGC	2	6	89778	89783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_006396	CGA	2	6	89805	89810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_006396	AGC	2	6	89813	89818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_006396	CGG	2	6	89848	89853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_006396	GTG	2	6	89941	89946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_006396	CGA	2	6	90018	90023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_006396	CAG	2	6	90028	90033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_006396	CGA	2	6	90036	90041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_006396	GGT	2	6	90161	90166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_006396	TCG	2	6	90182	90187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_006396	CGT	2	6	90204	90209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_006396	TCG	2	6	90218	90223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_006396	GGT	2	6	90281	90286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_006396	GGC	2	6	90791	90796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_006396	AAT	2	6	94041	94046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006396	ACC	2	6	94326	94331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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