MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome I

Total Repeats: 8735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_006396	GGA	2	6	1428968	1428973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_006396	AC	3	6	1429141	1429146	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4003	NC_006396	CTC	2	6	1429253	1429258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4004	NC_006396	ACC	2	6	1429331	1429336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4005	NC_006396	AGC	2	6	1429363	1429368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_006396	CGA	2	6	1437691	1437696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_006396	CGA	2	6	1437725	1437730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_006396	CGAACG	2	12	1437752	1437763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_006396	GTC	2	6	1437823	1437828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_006396	GAC	2	6	1437834	1437839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_006396	CGC	2	6	1437873	1437878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4012	NC_006396	GAC	2	6	1437879	1437884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_006396	CGA	2	6	1437899	1437904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_006396	TCGTG	2	10	1437907	1437916	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4015	NC_006396	CACG	2	8	1443620	1443627	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4016	NC_006396	GAT	2	6	1443752	1443757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_006396	GC	3	6	1443841	1443846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4018	NC_006396	ACC	2	6	1443859	1443864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4019	NC_006396	AAGC	2	8	1443888	1443895	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4020	NC_006396	GTAGT	2	10	1443900	1443909	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_006396	CAGC	2	8	1443955	1443962	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4022	NC_006396	GCG	2	6	1443989	1443994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_006396	CGC	2	6	1444005	1444010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4024	NC_006396	GAGC	2	8	1444078	1444085	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4025	NC_006396	CAGC	2	8	1444113	1444120	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4026	NC_006396	ACG	2	6	1444129	1444134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_006396	CGCGT	2	10	1444153	1444162	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4028	NC_006396	CGTC	2	8	1444229	1444236	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4029	NC_006396	TCGCG	2	10	1444248	1444257	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4030	NC_006396	GTC	2	6	1444362	1444367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_006396	ATT	2	6	1444397	1444402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_006396	TCC	2	6	1445102	1445107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4033	NC_006396	CAT	2	6	1445135	1445140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_006396	GC	3	6	1445157	1445162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4035	NC_006396	CCT	2	6	1448668	1448673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4036	NC_006396	TC	5	10	1448690	1448699	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4037	NC_006396	CGGA	2	8	1448711	1448718	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4038	NC_006396	GCC	2	6	1448791	1448796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4039	NC_006396	CTG	2	6	1448811	1448816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_006396	GCT	2	6	1448872	1448877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_006396	GT	3	6	1448897	1448902	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_006396	AG	3	6	1448951	1448956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_006396	CAG	2	6	1449026	1449031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_006396	GTTCGG	2	12	1449756	1449767	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4045	NC_006396	CCG	2	6	1450291	1450296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4046	NC_006396	GAC	2	6	1450301	1450306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_006396	ACC	2	6	1450323	1450328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4048	NC_006396	GCAC	2	8	1450357	1450364	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4049	NC_006396	TCCA	2	8	1450408	1450415	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4050	NC_006396	GAT	2	6	1450451	1450456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_006396	CAC	2	6	1450529	1450534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4052	NC_006396	CAC	2	6	1450592	1450597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4053	NC_006396	TTTCAC	2	12	1450662	1450673	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_006396	TCG	2	6	1450756	1450761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_006396	GCC	3	9	1450795	1450803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4056	NC_006396	AAG	2	6	1450815	1450820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_006396	CGC	2	6	1450849	1450854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4058	NC_006396	ACG	2	6	1450881	1450886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_006396	CGAC	2	8	1450895	1450902	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4060	NC_006396	GAG	3	9	1450919	1450927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_006396	CGC	3	9	1454034	1454042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4062	NC_006396	CGGATT	2	12	1454051	1454062	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4063	NC_006396	CGC	2	6	1454064	1454069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4064	NC_006396	CGCT	2	8	1454437	1454444	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4065	NC_006396	ACT	2	6	1459527	1459532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_006396	GAC	2	6	1459593	1459598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_006396	GGT	2	6	1459875	1459880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_006396	GCG	2	6	1459901	1459906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_006396	AGC	2	6	1459941	1459946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_006396	AGC	2	6	1459964	1459969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_006396	CGG	2	6	1460068	1460073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_006396	CTGC	2	8	1461087	1461094	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4073	NC_006396	GTG	2	6	1461103	1461108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_006396	AGC	2	6	1461396	1461401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_006396	GCG	2	6	1461450	1461455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_006396	CGT	2	6	1461477	1461482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_006396	GTT	2	6	1461489	1461494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_006396	GAC	2	6	1461994	1461999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_006396	GACG	2	8	1462003	1462010	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4080	NC_006396	TG	3	6	1462041	1462046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_006396	CGT	2	6	1462056	1462061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_006396	CAG	2	6	1462069	1462074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_006396	ACG	2	6	1462115	1462120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_006396	CCT	2	6	1462131	1462136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4085	NC_006396	CAC	2	6	1462143	1462148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4086	NC_006396	TTG	2	6	1462159	1462164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_006396	CCT	2	6	1462167	1462172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4088	NC_006396	CAG	2	6	1462229	1462234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_006396	GCG	2	6	1462331	1462336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_006396	TG	3	6	1462346	1462351	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_006396	CCG	2	6	1463301	1463306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4092	NC_006396	TAA	2	6	1463308	1463313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_006396	CGC	2	6	1463324	1463329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4094	NC_006396	GTA	2	6	1463337	1463342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_006396	CTG	2	6	1463755	1463760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_006396	AGT	2	6	1463782	1463787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_006396	CAG	2	6	1463811	1463816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_006396	CTCG	2	8	1463906	1463913	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4099	NC_006396	CCGA	2	8	1463916	1463923	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4100	NC_006396	TCG	2	6	1463946	1463951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_006396	GT	3	6	1464355	1464360	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_006396	GTC	2	6	1465315	1465320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_006396	GCG	2	6	1465335	1465340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_006396	GCC	2	6	1466510	1466515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4105	NC_006396	CTGG	2	8	1472446	1472453	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4106	NC_006396	TGC	2	6	1472459	1472464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_006396	TGC	2	6	1474073	1474078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_006396	AC	3	6	1474430	1474435	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4109	NC_006396	ATA	2	6	1474441	1474446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_006396	CCG	2	6	1474459	1474464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4111	NC_006396	GCC	2	6	1479419	1479424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4112	NC_006396	CGCCC	2	10	1479842	1479851	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
4113	NC_006396	GAACGA	2	12	1479917	1479928	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4114	NC_006396	CTT	2	6	1479929	1479934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_006396	CGG	2	6	1479956	1479961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_006396	GCC	2	6	1480034	1480039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4117	NC_006396	CAT	2	6	1480574	1480579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_006396	TA	3	6	1480595	1480600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_006396	CCGG	2	8	1480614	1480621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4120	NC_006396	ATTCCG	2	12	1484159	1484170	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_006396	TAT	2	6	1484174	1484179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_006396	TA	3	6	1484183	1484188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_006396	CGG	2	6	1484713	1484718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_006396	CAG	2	6	1484799	1484804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_006396	GGAG	2	8	1484808	1484815	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_006396	CGC	2	6	1484839	1484844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4127	NC_006396	CGG	2	6	1486158	1486163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_006396	GTA	2	6	1487084	1487089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_006396	TA	3	6	1487088	1487093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_006396	AC	3	6	1487096	1487101	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4131	NC_006396	CTA	2	6	1487111	1487116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_006396	AAACGA	2	12	1487122	1487133	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4133	NC_006396	CCTCG	2	10	1487208	1487217	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4134	NC_006396	GAAC	2	8	1487246	1487253	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4156	NC_006396	GA	3	6	1497126	1497131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4157	NC_006396	CG	3	6	1498944	1498949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4160	NC_006396	TG	3	6	1499953	1499958	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4161	NC_006396	CGG	2	6	1499963	1499968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4200	NC_006396	AG	3	6	1509563	1509568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4240	NC_006396	GGT	2	6	1523280	1523285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4241	NC_006396	A	6	6	1524117	1524122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4242	NC_006396	CGG	2	6	1524156	1524161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4243	NC_006396	GATCA	2	10	1524165	1524174	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4244	NC_006396	ATT	2	6	1525866	1525871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4245	NC_006396	CT	3	6	1525928	1525933	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4246	NC_006396	CACCC	2	10	1525966	1525975	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
4247	NC_006396	GAC	2	6	1526001	1526006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4248	NC_006396	GACC	2	8	1526013	1526020	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4249	NC_006396	GTC	2	6	1526040	1526045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4250	NC_006396	TCG	2	6	1526080	1526085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4251	NC_006396	ACG	2	6	1526102	1526107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4252	NC_006396	AAC	2	6	1526112	1526117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4253	NC_006396	CGA	2	6	1526138	1526143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4254	NC_006396	GAA	2	6	1526196	1526201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4255	NC_006396	GTC	2	6	1526223	1526228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4256	NC_006396	CGT	2	6	1526244	1526249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4258	NC_006396	GCGA	2	8	1529851	1529858	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4259	NC_006396	GCT	2	6	1529951	1529956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4260	NC_006396	CGGT	2	8	1530632	1530639	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4261	NC_006396	GTG	2	6	1530723	1530728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4264	NC_006396	GTCG	2	8	1532408	1532415	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4280	NC_006396	GCC	3	9	1533179	1533187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4301	NC_006396	TCC	2	6	1545958	1545963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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