MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome I

Total Repeats: 8735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_006396	GTC	2	6	961163	961168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_006396	ACT	2	6	961211	961216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2503	NC_006396	AT	4	8	961219	961226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_006396	GAC	2	6	961233	961238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_006396	GATA	2	8	961269	961276	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_006396	CTTT	2	8	961318	961325	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2507	NC_006396	GCC	2	6	961327	961332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2508	NC_006396	ACA	2	6	961335	961340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2509	NC_006396	TA	3	6	961379	961384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_006396	CT	3	6	961467	961472	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2511	NC_006396	CTGC	2	8	961507	961514	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2512	NC_006396	CAA	2	6	966141	966146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2513	NC_006396	AC	3	6	966477	966482	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2514	NC_006396	GGGA	2	8	966546	966553	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_006396	TACC	2	8	968094	968101	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2516	NC_006396	AGT	2	6	968142	968147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_006396	TAC	2	6	969407	969412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2518	NC_006396	TA	3	6	969419	969424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_006396	TTAT	2	8	969450	969457	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_006396	ATC	2	6	969485	969490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2521	NC_006396	AAAAT	2	10	969492	969501	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_006396	ATTT	2	8	969509	969516	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_006396	CCG	2	6	969650	969655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2524	NC_006396	GGGAT	2	10	969744	969753	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_006396	TGG	2	6	969766	969771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_006396	GAC	2	6	969775	969780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2527	NC_006396	GCT	2	6	969821	969826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2528	NC_006396	GAC	2	6	969855	969860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2529	NC_006396	CTG	2	6	969876	969881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2530	NC_006396	CTTT	2	8	969916	969923	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2531	NC_006396	CGG	2	6	969924	969929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2532	NC_006396	AAC	2	6	969960	969965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2533	NC_006396	CAC	2	6	970055	970060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2534	NC_006396	TGC	2	6	970076	970081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2535	NC_006396	GCA	2	6	970096	970101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2536	NC_006396	TTGC	2	8	970103	970110	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2537	NC_006396	GAT	2	6	970179	970184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_006396	CGG	2	6	970345	970350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2539	NC_006396	AC	3	6	972432	972437	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2540	NC_006396	TTCGC	2	10	974989	974998	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2541	NC_006396	GCT	2	6	975080	975085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2542	NC_006396	CGT	2	6	975129	975134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2543	NC_006396	TGT	2	6	975220	975225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_006396	CGGCC	2	10	975247	975256	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2545	NC_006396	CCGTC	2	10	975259	975268	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2546	NC_006396	GAC	2	6	975273	975278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2547	NC_006396	ACC	2	6	975279	975284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2548	NC_006396	AC	3	6	975291	975296	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2549	NC_006396	GCCG	2	8	977909	977916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2550	NC_006396	GAC	2	6	977946	977951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2551	NC_006396	GCC	3	9	977986	977994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2552	NC_006396	AGT	2	6	979039	979044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_006396	ACT	2	6	979098	979103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2554	NC_006396	C	6	6	979121	979126	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2555	NC_006396	AGC	2	6	980848	980853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2556	NC_006396	GC	3	6	980903	980908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2557	NC_006396	CTGT	2	8	982345	982352	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2558	NC_006396	AGT	2	6	982366	982371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_006396	CTG	2	6	984752	984757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2560	NC_006396	GTT	2	6	984779	984784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_006396	AAAG	2	8	984795	984802	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_006396	GCA	2	6	984874	984879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2563	NC_006396	ATC	2	6	984915	984920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2564	NC_006396	ACTT	2	8	984921	984928	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2565	NC_006396	TAT	2	6	984943	984948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_006396	ACCA	2	8	984985	984992	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2567	NC_006396	TGG	2	6	985009	985014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_006396	CAG	2	6	985099	985104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2569	NC_006396	CGG	2	6	985177	985182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2570	NC_006396	TGGGGG	3	18	985247	985264	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_006396	GCG	2	6	985409	985414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2572	NC_006396	TCAG	2	8	985428	985435	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2573	NC_006396	CGC	2	6	985696	985701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2576	NC_006396	GTCGT	2	10	990293	990302	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2577	NC_006396	CGG	2	6	990358	990363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2580	NC_006396	GCG	2	6	991740	991745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2581	NC_006396	ACA	2	6	991755	991760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2583	NC_006396	GCG	2	6	991827	991832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2584	NC_006396	CCA	2	6	991908	991913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2588	NC_006396	TGTA	2	8	996343	996350	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_006396	CGGG	2	8	998620	998627	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2590	NC_006396	CGT	2	6	1002190	1002195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2593	NC_006396	ACCC	2	8	1003623	1003630	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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2596	NC_006396	TTG	2	6	1004490	1004495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_006396	CATT	2	8	1004544	1004551	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2598	NC_006396	GTCG	2	8	1004604	1004611	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2599	NC_006396	GAC	2	6	1004752	1004757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2601	NC_006396	CA	4	8	1005397	1005404	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2602	NC_006396	GTC	2	6	1005426	1005431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2603	NC_006396	TAGT	2	8	1006494	1006501	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_006396	TA	3	6	1006510	1006515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_006396	GCG	2	6	1006552	1006557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2606	NC_006396	GCC	2	6	1006607	1006612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2607	NC_006396	ATG	2	6	1006797	1006802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_006396	TGA	3	9	1006867	1006875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_006396	GTC	2	6	1007405	1007410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2610	NC_006396	ACA	2	6	1007432	1007437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2611	NC_006396	TCGT	2	8	1009551	1009558	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2612	NC_006396	GA	3	6	1010179	1010184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_006396	ATAA	2	8	1010195	1010202	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_006396	CGC	2	6	1014627	1014632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2615	NC_006396	CGT	2	6	1014644	1014649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2616	NC_006396	GTT	2	6	1014675	1014680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_006396	CGAGG	2	10	1014681	1014690	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2618	NC_006396	GAG	2	6	1014694	1014699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_006396	CTCG	2	8	1014762	1014769	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2620	NC_006396	TCA	2	6	1014943	1014948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2621	NC_006396	GA	3	6	1015084	1015089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_006396	AG	3	6	1015125	1015130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_006396	GGC	2	6	1017972	1017977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2624	NC_006396	AATA	2	8	1018787	1018794	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_006396	CGG	2	6	1018801	1018806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2626	NC_006396	GGC	2	6	1018821	1018826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2627	NC_006396	CA	3	6	1018844	1018849	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2628	NC_006396	GGCC	2	8	1018851	1018858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2629	NC_006396	AG	3	6	1018880	1018885	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_006396	ATT	2	6	1020054	1020059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_006396	GT	3	6	1020215	1020220	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2632	NC_006396	GCC	2	6	1020854	1020859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2634	NC_006396	CAG	2	6	1023150	1023155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2892	NC_006396	CA	3	6	1113492	1113497	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2893	NC_006396	TATT	2	8	1113501	1113508	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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