MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome I

Total Repeats: 8735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006396	CAGC	2	8	190760	190767	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
502	NC_006396	GCT	2	6	190824	190829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_006396	CAG	3	9	190836	190844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_006396	AAG	2	6	190894	190899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_006396	GGA	2	6	190930	190935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_006396	GACAG	2	10	190944	190953	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
507	NC_006396	GCA	2	6	190997	191002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_006396	TACA	2	8	191037	191044	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
509	NC_006396	GCT	2	6	191126	191131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_006396	TCG	3	9	191178	191186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_006396	G	6	6	191320	191325	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
512	NC_006396	CA	3	6	191344	191349	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
513	NC_006396	CA	3	6	191387	191392	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
514	NC_006396	TTTCG	2	10	191393	191402	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
515	NC_006396	ACGG	2	8	191422	191429	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
516	NC_006396	CGT	2	6	191948	191953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_006396	TGC	2	6	192032	192037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_006396	GCG	2	6	193270	193275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_006396	AAC	2	6	193279	193284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_006396	ACG	2	6	193285	193290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_006396	GAC	2	6	193296	193301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_006396	GAC	2	6	193347	193352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_006396	CGC	2	6	193434	193439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_006396	GCGACG	2	12	193441	193452	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_006396	GGA	2	6	193457	193462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
526	NC_006396	CAG	2	6	193482	193487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_006396	CGG	2	6	193493	193498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_006396	GT	3	6	193539	193544	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
529	NC_006396	CTGCC	2	10	193615	193624	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
530	NC_006396	CTG	2	6	194070	194075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_006396	GTC	2	6	194145	194150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_006396	CCGT	2	8	194176	194183	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
533	NC_006396	GC	3	6	194227	194232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
534	NC_006396	TGT	2	6	194783	194788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_006396	CAC	2	6	195049	195054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_006396	CGGT	2	8	195063	195070	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
537	NC_006396	CCT	2	6	195103	195108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_006396	ACG	2	6	195165	195170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_006396	TCG	2	6	195174	195179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_006396	CGT	2	6	195192	195197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_006396	GCG	2	6	195203	195208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_006396	GGA	2	6	195236	195241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_006396	CGC	3	9	195247	195255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_006396	GC	3	6	195390	195395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
545	NC_006396	GCG	2	6	195785	195790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_006396	TGG	2	6	195829	195834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_006396	GCA	2	6	195874	195879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_006396	TCG	2	6	195890	195895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_006396	TCG	2	6	195943	195948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_006396	GCC	2	6	195960	195965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_006396	GTA	2	6	196354	196359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_006396	TTGC	2	8	196367	196374	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
553	NC_006396	TC	4	8	196410	196417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
554	NC_006396	GAAC	2	8	196437	196444	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
555	NC_006396	ACT	2	6	197571	197576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_006396	CAGA	2	8	197601	197608	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
557	NC_006396	CG	3	6	197624	197629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
558	NC_006396	CAT	2	6	198022	198027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_006396	GAC	2	6	198050	198055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_006396	TGT	2	6	198127	198132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_006396	GT	3	6	198142	198147	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
562	NC_006396	AGG	2	6	198153	198158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
563	NC_006396	AAG	2	6	198350	198355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_006396	CACAA	2	10	198417	198426	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
565	NC_006396	CA	3	6	198457	198462	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
566	NC_006396	TC	3	6	198526	198531	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
567	NC_006396	AC	3	6	198598	198603	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
568	NC_006396	GCC	2	6	198672	198677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_006396	GAC	2	6	199743	199748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_006396	GAGG	2	8	199768	199775	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
571	NC_006396	ACA	2	6	201523	201528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_006396	CT	3	6	201540	201545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
573	NC_006396	CGG	2	6	201561	201566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_006396	CCG	2	6	202672	202677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_006396	ACA	2	6	202697	202702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_006396	AC	3	6	202750	202755	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
577	NC_006396	CGC	2	6	202778	202783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_006396	TG	3	6	203794	203799	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
579	NC_006396	CCG	2	6	203858	203863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_006396	TAT	2	6	204894	204899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_006396	CG	3	6	204915	204920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
582	NC_006396	GCT	2	6	204935	204940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_006396	CT	3	6	204944	204949	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
584	NC_006396	AC	3	6	206803	206808	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
585	NC_006396	ATA	2	6	206822	206827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_006396	ATC	2	6	206847	206852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_006396	GCC	2	6	206856	206861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_006396	AT	3	6	206897	206902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_006396	TA	3	6	206946	206951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_006396	CAT	2	6	207031	207036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_006396	AAT	2	6	207044	207049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_006396	T	6	6	207081	207086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_006396	AGT	2	6	207106	207111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_006396	GTC	2	6	207880	207885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_006396	GAG	2	6	207892	207897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
596	NC_006396	TG	3	6	207902	207907	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
597	NC_006396	GTC	2	6	208760	208765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_006396	CA	3	6	208787	208792	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
599	NC_006396	GTCA	2	8	208809	208816	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
600	NC_006396	CGC	2	6	212177	212182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_006396	GGC	2	6	212194	212199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_006396	CAGT	2	8	212201	212208	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
603	NC_006396	CGA	2	6	212226	212231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_006396	GCT	2	6	212273	212278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_006396	GAAA	2	8	214750	214757	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
606	NC_006396	TG	4	8	214869	214876	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
607	NC_006396	C	6	6	214917	214922	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
608	NC_006396	G	6	6	216800	216805	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
609	NC_006396	GAG	2	6	216831	216836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_006396	GC	3	6	217267	217272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
611	NC_006396	TG	3	6	217287	217292	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
612	NC_006396	GAGG	2	8	218066	218073	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
613	NC_006396	AAC	2	6	218162	218167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_006396	GTG	2	6	218287	218292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
615	NC_006396	CAG	2	6	219114	219119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_006396	AGA	2	6	219155	219160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_006396	TACA	2	8	219194	219201	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
618	NC_006396	ATG	2	6	219206	219211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_006396	GC	3	6	219216	219221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
620	NC_006396	GC	3	6	221381	221386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
621	NC_006396	CT	3	6	222649	222654	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
622	NC_006396	GTG	2	6	224001	224006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_006396	ATTT	2	8	224017	224024	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_006396	CCA	2	6	224138	224143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_006396	TAC	2	6	226084	226089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_006396	AC	3	6	229976	229981	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
627	NC_006396	ATA	2	6	230030	230035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_006396	CAA	2	6	230082	230087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_006396	TGTC	2	8	230120	230127	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
630	NC_006396	GT	3	6	230141	230146	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
631	NC_006396	GCC	2	6	230336	230341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_006396	TCG	2	6	230385	230390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_006396	GTCG	2	8	230426	230433	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
634	NC_006396	GCT	2	6	230444	230449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_006396	CAC	2	6	230535	230540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_006396	AGT	2	6	232746	232751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_006396	TGG	2	6	234330	234335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
638	NC_006396	CCCTA	2	10	234336	234345	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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651	NC_006396	T	6	6	238995	239000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
652	NC_006396	TA	3	6	239013	239018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
653	NC_006396	CTGT	2	8	239019	239026	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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676	NC_006396	TTGA	2	8	251099	251106	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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678	NC_006396	TGG	2	6	251605	251610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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681	NC_006396	CGT	2	6	253599	253604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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685	NC_006396	CTT	2	6	256244	256249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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762	NC_006396	GGT	3	9	287372	287380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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765	NC_006396	ACA	2	6	287475	287480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
766	NC_006396	C	6	6	287491	287496	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
767	NC_006396	GAC	2	6	287544	287549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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770	NC_006396	CAG	2	6	288216	288221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
771	NC_006396	CGT	2	6	288246	288251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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773	NC_006396	CGT	2	6	288347	288352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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