MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome I

Total Repeats: 8735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_006396	ACG	2	6	1977449	1977454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_006396	GCG	2	6	1977471	1977476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_006396	CGA	3	9	1977510	1977518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_006396	AGC	2	6	1977585	1977590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_006396	A	6	6	1979528	1979533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_006396	GCG	3	9	1979575	1979583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_006396	GGC	3	9	1981351	1981359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_006396	TTG	2	6	1981369	1981374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_006396	GAA	2	6	1981412	1981417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_006396	AT	3	6	1984133	1984138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_006396	GC	3	6	1989657	1989662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5512	NC_006396	CCG	2	6	1990384	1990389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5513	NC_006396	CGG	2	6	1990445	1990450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_006396	CGC	2	6	1990475	1990480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5515	NC_006396	GTC	3	9	1990482	1990490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_006396	GAC	2	6	1990535	1990540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_006396	GCG	2	6	1995025	1995030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_006396	TGACAG	2	12	1995092	1995103	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5519	NC_006396	AGT	2	6	1995149	1995154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_006396	ATT	3	9	1995212	1995220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_006396	AC	3	6	1995497	1995502	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5522	NC_006396	CGG	2	6	1995504	1995509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_006396	TCC	2	6	1995541	1995546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5524	NC_006396	CGG	2	6	1995552	1995557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_006396	GCG	2	6	1995568	1995573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_006396	AGT	2	6	1998350	1998355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_006396	GTC	2	6	1998396	1998401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_006396	CCGA	2	8	1998440	1998447	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5529	NC_006396	GTC	2	6	1998484	1998489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_006396	CTGG	2	8	1998513	1998520	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5531	NC_006396	CGC	2	6	1999423	1999428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5532	NC_006396	CGG	2	6	1999482	1999487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_006396	TCG	2	6	1999665	1999670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_006396	CGA	2	6	1999739	1999744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_006396	CCA	2	6	2000540	2000545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5536	NC_006396	TG	3	6	2003065	2003070	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_006396	CAG	2	6	2003074	2003079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_006396	GAC	2	6	2003092	2003097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_006396	TTCTAT	2	12	2003105	2003116	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5540	NC_006396	ATT	2	6	2003122	2003127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_006396	TTG	2	6	2003145	2003150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_006396	GTT	2	6	2003170	2003175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_006396	TGT	2	6	2003855	2003860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_006396	CAG	2	6	2005965	2005970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_006396	GACCG	2	10	2005976	2005985	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5546	NC_006396	ATT	2	6	2006018	2006023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_006396	GAGCTA	2	12	2006026	2006037	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5548	NC_006396	TGT	2	6	2006079	2006084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_006396	CGG	2	6	2008334	2008339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_006396	GCG	2	6	2010080	2010085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_006396	CCCGA	2	10	2010100	2010109	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5552	NC_006396	GTC	2	6	2010147	2010152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_006396	GAAC	2	8	2010155	2010162	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5554	NC_006396	CGC	2	6	2010186	2010191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5555	NC_006396	TCG	2	6	2010202	2010207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_006396	GTC	2	6	2010952	2010957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_006396	GCT	2	6	2010966	2010971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_006396	CTT	2	6	2011002	2011007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5559	NC_006396	GCC	2	6	2011010	2011015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5560	NC_006396	GCG	2	6	2011448	2011453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_006396	GTCA	2	8	2011461	2011468	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5562	NC_006396	TCG	2	6	2011513	2011518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_006396	GCCT	2	8	2011556	2011563	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5564	NC_006396	TTCAT	2	10	2011569	2011578	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5565	NC_006396	CGC	2	6	2011627	2011632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5566	NC_006396	GTC	2	6	2014401	2014406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_006396	CTC	2	6	2014517	2014522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5568	NC_006396	CTCG	2	8	2014535	2014542	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5569	NC_006396	GCC	3	9	2014580	2014588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5570	NC_006396	CTCC	2	8	2014611	2014618	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5571	NC_006396	GGGC	2	8	2014646	2014653	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5572	NC_006396	GC	3	6	2014652	2014657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5573	NC_006396	CGG	2	6	2014669	2014674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5574	NC_006396	CGA	3	9	2014693	2014701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_006396	CT	3	6	2015406	2015411	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5576	NC_006396	GTA	2	6	2015422	2015427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_006396	CAG	2	6	2015436	2015441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5578	NC_006396	CAA	2	6	2015458	2015463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_006396	AAC	2	6	2018471	2018476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5580	NC_006396	CTGA	2	8	2018878	2018885	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5581	NC_006396	TCC	2	6	2018903	2018908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5582	NC_006396	CTC	2	6	2018929	2018934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5583	NC_006396	CGAG	2	8	2018940	2018947	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5584	NC_006396	CGA	2	6	2019003	2019008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5585	NC_006396	CGGT	2	8	2019014	2019021	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5586	NC_006396	TCG	2	6	2019035	2019040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5587	NC_006396	CTC	2	6	2019085	2019090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5588	NC_006396	GCG	2	6	2019128	2019133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5589	NC_006396	GC	3	6	2019142	2019147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5590	NC_006396	TA	3	6	2019224	2019229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_006396	TGG	2	6	2019247	2019252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_006396	AC	3	6	2019857	2019862	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5593	NC_006396	C	6	6	2019865	2019870	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5594	NC_006396	TCG	2	6	2019873	2019878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5595	NC_006396	C	6	6	2019910	2019915	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5596	NC_006396	CCG	2	6	2019918	2019923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5597	NC_006396	AG	3	6	2020031	2020036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_006396	TACCG	2	10	2020110	2020119	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5599	NC_006396	CA	3	6	2020129	2020134	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5600	NC_006396	CCG	2	6	2020167	2020172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5601	NC_006396	CTT	2	6	2020187	2020192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5602	NC_006396	CT	3	6	2020200	2020205	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5603	NC_006396	CGT	2	6	2020225	2020230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_006396	TCG	2	6	2020251	2020256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_006396	ACT	2	6	2020268	2020273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5606	NC_006396	TA	3	6	2020313	2020318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_006396	GCG	2	6	2020353	2020358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_006396	CGA	2	6	2020368	2020373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_006396	CAG	2	6	2020418	2020423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_006396	CAA	2	6	2020428	2020433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5611	NC_006396	GGGA	2	8	2021068	2021075	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_006396	GTA	2	6	2021079	2021084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_006396	GGGAC	2	10	2021126	2021135	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5614	NC_006396	TCCC	2	8	2021165	2021172	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5615	NC_006396	TCT	2	6	2021193	2021198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_006396	CTT	2	6	2021202	2021207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_006396	TG	3	6	2023537	2023542	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_006396	GA	3	6	2025436	2025441	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_006396	GAA	2	6	2026037	2026042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_006396	CGGT	2	8	2026055	2026062	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5621	NC_006396	TCG	2	6	2026063	2026068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5622	NC_006396	ACT	2	6	2027082	2027087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_006396	CTG	2	6	2027095	2027100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5624	NC_006396	CT	3	6	2027771	2027776	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5625	NC_006396	CGG	2	6	2027806	2027811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5626	NC_006396	GAC	2	6	2027861	2027866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5627	NC_006396	GCG	2	6	2027869	2027874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5629	NC_006396	GTC	2	6	2027925	2027930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5756	NC_006396	GCGA	2	8	2051034	2051041	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5757	NC_006396	GTCG	2	8	2051051	2051058	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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