MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG600

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006394	ACAG	2	8	7	14	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_006394	CTCA	2	8	726	733	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_006394	GAAT	2	8	8524	8531	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006394	GAAC	2	8	8547	8554	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_006394	AACG	2	8	8588	8595	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_006394	AACG	2	8	8733	8740	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_006394	CTAT	2	8	19027	19034	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_006394	AGTA	2	8	22251	22258	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006394	GGGT	2	8	25212	25219	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006394	TCCA	2	8	25674	25681	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_006394	TTCT	2	8	25719	25726	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_006394	GTTC	2	8	29103	29110	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_006394	CGTG	2	8	32424	32431	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_006394	GACC	2	8	40536	40543	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_006394	GTCG	2	8	44672	44679	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_006394	GATG	2	8	46258	46265	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006394	CTGA	2	8	50228	50235	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_006394	TTGG	2	8	54221	54228	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006394	TTTA	2	8	54314	54321	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006394	ATTC	2	8	55163	55170	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_006394	GTTA	2	8	66074	66081	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006394	AGTC	2	8	66246	66253	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_006394	TCGG	2	8	76157	76164	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_006394	ATTC	2	8	76858	76865	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_006394	TCAC	2	8	90807	90814	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_006394	TTTC	2	8	92870	92877	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_006394	ATCC	2	8	94922	94929	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_006394	CTGC	3	12	95410	95421	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_006394	GCGG	2	8	95426	95433	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_006394	CGCT	2	8	95530	95537	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_006394	CGGG	2	8	95539	95546	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_006394	TCGC	2	8	95591	95598	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_006394	GCGA	2	8	95623	95630	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_006394	CTTT	2	8	96610	96617	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_006394	CACC	2	8	96655	96662	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
36	NC_006394	GCTC	2	8	96670	96677	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_006394	ATGT	2	8	96725	96732	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006394	TCCG	2	8	96763	96770	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_006394	TACA	2	8	100089	100096	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_006394	GGTC	2	8	100190	100197	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_006394	GTCA	2	8	101285	101292	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_006394	ACCA	2	8	111439	111446	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_006394	GAGT	2	8	114894	114901	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006394	AGTG	2	8	116602	116609	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006394	CGAC	2	8	126741	126748	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_006394	TCAC	2	8	127888	127895	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_006394	CCCG	2	8	131688	131695	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48	NC_006394	TTCG	2	8	132095	132102	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_006394	CCCA	2	8	135171	135178	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
50	NC_006394	TGAT	2	8	135184	135191	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006394	TCCA	2	8	137760	137767	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_006394	TTTG	2	8	144584	144591	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.