MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG500

Total Repeats: 535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006393	CAC	2	6	5	10	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_006393	GCT	2	6	65	70	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_006393	GAT	2	6	144	149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006393	GAA	2	6	1293	1298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006393	TGC	2	6	3194	3199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_006393	ACT	2	6	3291	3296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_006393	AAT	2	6	3415	3420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006393	ACA	2	6	3424	3429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_006393	AGG	2	6	3516	3521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006393	GAG	2	6	3628	3633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006393	CCT	2	6	3667	3672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_006393	GTA	2	6	3911	3916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006393	ATC	2	6	3935	3940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_006393	GTT	2	6	4011	4016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006393	GCG	2	6	4018	4023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_006393	TGC	2	6	4059	4064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_006393	GAA	2	6	4082	4087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006393	TGA	2	6	4146	4151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006393	AGC	2	6	4190	4195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_006393	GAA	2	6	4273	4278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006393	CGG	2	6	4312	4317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_006393	AAG	2	6	4325	4330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006393	CTA	2	6	4398	4403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_006393	CGG	2	6	4489	4494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_006393	GTT	2	6	5451	5456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006393	GCC	2	6	5569	5574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_006393	CGA	2	6	5580	5585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_006393	GCG	2	6	5626	5631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_006393	ACT	2	6	6130	6135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_006393	TGG	2	6	6247	6252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006393	CTT	2	6	6455	6460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_006393	AGG	2	6	6619	6624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006393	GTG	2	6	6660	6665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006393	CAA	2	6	6951	6956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_006393	AGC	2	6	7018	7023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_006393	TGC	2	6	7039	7044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_006393	AAC	2	6	7125	7130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_006393	ATA	2	6	10591	10596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006393	ACC	2	6	11625	11630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_006393	TCA	2	6	12628	12633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_006393	TTA	2	6	12733	12738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006393	CGA	2	6	13412	13417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_006393	ACA	2	6	13449	13454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_006393	GCG	2	6	13526	13531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_006393	TGT	2	6	13564	13569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006393	TTC	2	6	13588	13593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_006393	GGT	2	6	13671	13676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006393	CAG	2	6	13699	13704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_006393	TCA	2	6	13797	13802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_006393	GAT	2	6	13810	13815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006393	TTA	2	6	13827	13832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006393	AAC	2	6	13912	13917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_006393	GGC	2	6	14034	14039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_006393	CAA	2	6	14296	14301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_006393	GTT	2	6	14321	14326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006393	GGT	2	6	14410	14415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006393	CGC	2	6	14516	14521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_006393	CAG	2	6	17607	17612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_006393	TGG	2	6	17690	17695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006393	GCC	2	6	17706	17711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_006393	ACC	2	6	17728	17733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_006393	AAG	2	6	17771	17776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006393	GGT	2	6	17795	17800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006393	GTA	2	6	19853	19858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006393	GTG	2	6	21581	21586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006393	TTG	3	9	21619	21627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006393	GAG	2	6	21680	21685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006393	CAA	2	6	22410	22415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_006393	ACT	2	6	22450	22455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_006393	CAC	2	6	23733	23738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_006393	GCC	2	6	23808	23813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_006393	CGC	2	6	23828	23833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_006393	GTC	2	6	23844	23849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_006393	TCG	2	6	23893	23898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_006393	GTT	2	6	23990	23995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006393	AAG	2	6	24028	24033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006393	TGA	2	6	24134	24139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006393	GGT	2	6	24174	24179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006393	TTA	2	6	24181	24186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006393	ATC	2	6	24269	24274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_006393	CCG	2	6	24283	24288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_006393	GGT	2	6	24330	24335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006393	CCG	2	6	24485	24490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_006393	AAG	2	6	24501	24506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006393	AGA	2	6	24682	24687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006393	CCA	2	6	24781	24786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_006393	CGT	2	6	24828	24833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_006393	TCG	2	6	24864	24869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_006393	AAC	2	6	24901	24906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_006393	AGC	2	6	24942	24947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_006393	GTT	2	6	25096	25101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006393	ACA	2	6	25239	25244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_006393	TCT	2	6	25326	25331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_006393	TGT	2	6	25350	25355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006393	ACC	2	6	27359	27364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_006393	GAA	2	6	27414	27419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006393	AAC	2	6	27441	27446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_006393	GTA	2	6	27506	27511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006393	GCT	2	6	27536	27541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_006393	GTG	2	6	27609	27614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006393	GGA	2	6	27784	27789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006393	CTT	2	6	27817	27822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_006393	CAC	2	6	27902	27907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_006393	ACC	2	6	27964	27969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_006393	ACA	2	6	28001	28006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_006393	TCT	2	6	29143	29148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_006393	CAG	2	6	29187	29192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_006393	AGC	2	6	29512	29517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_006393	TCT	2	6	29536	29541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_006393	TCG	2	6	29542	29547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_006393	CGA	2	6	29549	29554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_006393	CGA	2	6	29567	29572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_006393	TCG	2	6	29905	29910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_006393	CGC	2	6	29919	29924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_006393	TCG	2	6	29962	29967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_006393	TCA	2	6	30022	30027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_006393	CGT	2	6	30062	30067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_006393	ATG	2	6	30085	30090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006393	CTA	3	9	30710	30718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_006393	GAC	2	6	30862	30867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_006393	CAG	2	6	30881	30886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_006393	TGG	2	6	30997	31002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006393	TAT	2	6	31654	31659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006393	TGC	2	6	31698	31703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_006393	TTG	2	6	31724	31729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006393	CCA	2	6	31797	31802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_006393	GTG	2	6	31819	31824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006393	TAT	2	6	32445	32450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_006393	TGG	2	6	32548	32553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_006393	CGG	2	6	32610	32615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_006393	GGA	2	6	32895	32900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006393	TCG	2	6	33557	33562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_006393	TCA	2	6	33608	33613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_006393	CAT	2	6	33675	33680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_006393	GTT	2	6	33916	33921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_006393	CAT	2	6	33963	33968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_006393	TGG	2	6	34036	34041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006393	ACA	2	6	34204	34209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_006393	TTG	2	6	34269	34274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_006393	ACG	2	6	34369	34374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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