MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG100

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006389	GCAG	2	8	1597	1604	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_006389	TTGA	2	8	2725	2732	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006389	ATCG	2	8	3688	3695	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_006389	CTGG	2	8	3768	3775	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_006389	CCCG	2	8	5123	5130	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_006389	AGAT	2	8	5782	5789	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006389	CTCG	2	8	6649	6656	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_006389	AAAC	2	8	6881	6888	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_006389	TCGT	2	8	6902	6909	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_006389	AACC	2	8	8663	8670	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_006389	TCCG	2	8	8928	8935	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_006389	GTCG	2	8	9042	9049	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_006389	CCCT	2	8	11527	11534	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_006389	AGAA	2	8	14214	14221	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006389	GGAA	2	8	15047	15054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006389	TGCG	2	8	15454	15461	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_006389	AGCA	2	8	15970	15977	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_006389	AGGT	2	8	20952	20959	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006389	AGTC	2	8	23499	23506	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_006389	TCGT	2	8	25158	25165	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_006389	TCGT	2	8	25202	25209	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_006389	GTTC	2	8	25336	25343	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_006389	ACTG	2	8	27603	27610	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_006389	GTGC	2	8	27738	27745	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_006389	GTAT	2	8	29567	29574	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006389	AATT	2	8	30087	30094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006389	ACTG	2	8	32974	32981	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.