MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 plasmid pNRC200

Total Repeats: 194

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002608	TC	3	6	1278	1283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_002608	AT	3	6	1760	1765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002608	GA	3	6	1898	1903	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002608	CG	3	6	3732	3737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_002608	AC	3	6	9121	9126	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_002608	TG	3	6	13395	13400	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002608	CG	3	6	13571	13576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_002608	AC	3	6	14010	14015	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_002608	CA	4	8	14075	14082	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_002608	TC	3	6	22288	22293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_002608	AC	3	6	22791	22796	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_002608	TC	3	6	30115	30120	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_002608	GC	3	6	30514	30519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_002608	GT	3	6	32088	32093	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002608	TC	3	6	32174	32179	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_002608	CG	3	6	32527	32532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_002608	TG	3	6	35592	35597	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002608	GT	3	6	35802	35807	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002608	GC	3	6	35875	35880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_002608	AC	3	6	35937	35942	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_002608	CT	3	6	35974	35979	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_002608	TG	3	6	38535	38540	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002608	AT	3	6	38574	38579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002608	AT	3	6	38611	38616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002608	GA	3	6	38883	38888	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002608	GA	3	6	40937	40942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002608	TG	3	6	41092	41097	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002608	TC	3	6	41098	41103	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_002608	AT	3	6	41577	41582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002608	CT	3	6	52492	52497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_002608	TG	3	6	54447	54452	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002608	TA	3	6	57635	57640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002608	CT	4	8	60203	60210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_002608	GT	3	6	61537	61542	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002608	TC	3	6	63284	63289	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_002608	TC	3	6	64700	64705	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_002608	AT	3	6	64787	64792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002608	AG	3	6	68728	68733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002608	AG	3	6	70085	70090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002608	TG	3	6	70222	70227	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002608	AG	3	6	71739	71744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002608	GT	3	6	81116	81121	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002608	GA	3	6	81916	81921	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002608	GT	3	6	82026	82031	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002608	CG	3	6	82465	82470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_002608	CA	3	6	82641	82646	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_002608	AG	3	6	86631	86636	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002608	AT	3	6	86737	86742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002608	GA	3	6	86876	86881	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002608	CG	3	6	88710	88715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_002608	CT	3	6	96927	96932	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_002608	GA	3	6	97654	97659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002608	CT	3	6	101406	101411	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_002608	GT	3	6	101486	101491	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002608	TC	3	6	101572	101577	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_002608	CG	3	6	101925	101930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_002608	GT	3	6	105615	105620	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002608	TC	3	6	105701	105706	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_002608	CG	3	6	106054	106059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_002608	CA	3	6	112673	112678	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_002608	GC	3	6	125001	125006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_002608	GA	3	6	125198	125203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_002608	CG	3	6	128706	128711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_002608	GA	3	6	129059	129064	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002608	AC	3	6	129145	129150	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_002608	GA	3	6	133242	133247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002608	CG	3	6	134385	134390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_002608	GA	3	6	134738	134743	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002608	AC	3	6	134824	134829	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_002608	TG	3	6	134890	134895	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002608	CT	3	6	135090	135095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_002608	CG	3	6	136410	136415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_002608	AT	3	6	139096	139101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002608	CA	3	6	140846	140851	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_002608	CT	3	6	141538	141543	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_002608	CT	3	6	141563	141568	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_002608	GT	3	6	142608	142613	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002608	GA	3	6	142742	142747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_002608	TC	3	6	143684	143689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_002608	CA	3	6	153222	153227	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_002608	GT	3	6	153806	153811	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002608	TC	3	6	154047	154052	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_002608	GA	3	6	154273	154278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002608	GT	3	6	156071	156076	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002608	AG	3	6	160131	160136	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002608	CT	4	8	160556	160563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_002608	CT	3	6	160581	160586	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_002608	CA	3	6	167819	167824	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_002608	GA	3	6	170590	170595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002608	GT	3	6	170596	170601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_002608	CA	3	6	170605	170610	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_002608	AC	3	6	181655	181660	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_002608	CA	3	6	182979	182984	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_002608	TG	3	6	191603	191608	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002608	AC	5	10	196593	196602	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_002608	GC	3	6	197868	197873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_002608	GA	3	6	205096	205101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002608	CA	3	6	205161	205166	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_002608	GA	4	8	206107	206114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002608	AC	3	6	206271	206276	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_002608	TG	4	8	208775	208782	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002608	CT	5	10	212129	212138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_002608	GC	3	6	213126	213131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_002608	CA	3	6	224882	224887	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_002608	CT	4	8	227324	227331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_002608	CT	3	6	229933	229938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_002608	GA	3	6	232326	232331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_002608	GC	3	6	232395	232400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_002608	GC	3	6	235611	235616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_002608	TC	3	6	240813	240818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_002608	AT	3	6	244623	244628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002608	CA	3	6	244777	244782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_002608	AC	3	6	246861	246866	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_002608	TA	3	6	252829	252834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002608	TC	3	6	253247	253252	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_002608	GC	3	6	253567	253572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_002608	CA	3	6	253767	253772	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_002608	TG	3	6	253810	253815	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002608	AG	3	6	253878	253883	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002608	GT	3	6	254127	254132	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002608	AT	3	6	254340	254345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_002608	AG	3	6	254479	254484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002608	GA	3	6	254990	254995	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002608	TG	3	6	256380	256385	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002608	CT	3	6	258187	258192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_002608	GC	3	6	260178	260183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_002608	CA	4	8	261072	261079	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_002608	GT	3	6	261270	261275	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_002608	TC	3	6	261356	261361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_002608	CG	3	6	261709	261714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_002608	GC	3	6	262730	262735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_002608	GA	3	6	262936	262941	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002608	GC	3	6	263589	263594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_002608	AG	3	6	264074	264079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002608	AT	3	6	265068	265073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002608	TC	3	6	267058	267063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_002608	GA	3	6	267076	267081	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_002608	CA	3	6	272915	272920	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_002608	CG	3	6	273858	273863	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_002608	GA	3	6	274211	274216	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_002608	AC	3	6	274297	274302	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_002608	CA	3	6	274539	274544	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_002608	AC	3	6	275017	275022	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_002608	TA	3	6	280100	280105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_002608	TC	3	6	280147	280152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_002608	CA	3	6	280438	280443	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_002608	GT	3	6	282082	282087	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_002608	TA	5	10	283103	283112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_002608	AC	3	6	286450	286455	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_002608	GA	4	8	289005	289012	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_002608	GA	3	6	292770	292775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_002608	CA	3	6	292822	292827	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_002608	CG	3	6	295299	295304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_002608	TA	3	6	295964	295969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_002608	CT	3	6	296089	296094	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.